Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KXF6

Protein Details
Accession E3KXF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-98LDYIAKSKRSRTHPNRRKTTHRQTTQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-248GGPGSNRGGGGRGNSDRGRGRGSDRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 15, extr 5, cyto 3, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034101  Lsm4  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0097526  C:spliceosomal tri-snRNP complex  
GO:0005688  C:U6 snRNP  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0033962  P:P-body assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG pgr:PGTG_15117  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01723  LSm4  
Amino Acid Sequences MTARTDVAQRVLLYATTGLLNSSDKSGERKRLRAAARSSYGWASSGGDAPDSDRPPPPPSARLVDDRRTTFLDYIAKSKRSRTHPNRRKTTHRQTTQPPMLPLALLHGAQGKPMLVELKNGETFNGHLIQCDNFMNLTMREVYQTSANGEQFWKLPECYIRGNTIKYIRVTDNVIDQVKQQEDAYRQQNRSSRGGGNQTNERGGRGGSGGRGYSNSNNRGGPGSNRGGGGRGNSDRGRGRGSDRGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.1
4 0.1
5 0.08
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.13
12 0.2
13 0.27
14 0.37
15 0.42
16 0.48
17 0.52
18 0.59
19 0.63
20 0.65
21 0.65
22 0.63
23 0.61
24 0.57
25 0.53
26 0.46
27 0.41
28 0.33
29 0.27
30 0.2
31 0.16
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.14
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.23
42 0.26
43 0.32
44 0.33
45 0.31
46 0.33
47 0.37
48 0.38
49 0.43
50 0.46
51 0.47
52 0.49
53 0.48
54 0.47
55 0.44
56 0.42
57 0.34
58 0.31
59 0.3
60 0.25
61 0.3
62 0.32
63 0.34
64 0.33
65 0.39
66 0.43
67 0.46
68 0.56
69 0.6
70 0.66
71 0.71
72 0.8
73 0.85
74 0.84
75 0.85
76 0.85
77 0.85
78 0.84
79 0.81
80 0.77
81 0.74
82 0.78
83 0.75
84 0.67
85 0.57
86 0.47
87 0.41
88 0.34
89 0.27
90 0.19
91 0.13
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.09
102 0.06
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.16
145 0.18
146 0.19
147 0.23
148 0.24
149 0.25
150 0.28
151 0.3
152 0.31
153 0.29
154 0.31
155 0.27
156 0.26
157 0.27
158 0.24
159 0.23
160 0.24
161 0.23
162 0.2
163 0.2
164 0.22
165 0.21
166 0.21
167 0.17
168 0.17
169 0.2
170 0.27
171 0.34
172 0.37
173 0.38
174 0.43
175 0.48
176 0.48
177 0.49
178 0.46
179 0.42
180 0.4
181 0.47
182 0.45
183 0.46
184 0.47
185 0.45
186 0.46
187 0.43
188 0.38
189 0.3
190 0.26
191 0.21
192 0.17
193 0.16
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.19
200 0.25
201 0.31
202 0.33
203 0.34
204 0.34
205 0.35
206 0.36
207 0.35
208 0.32
209 0.31
210 0.32
211 0.3
212 0.31
213 0.3
214 0.29
215 0.28
216 0.27
217 0.27
218 0.25
219 0.3
220 0.3
221 0.36
222 0.39
223 0.4
224 0.41
225 0.37
226 0.39
227 0.42
228 0.47