Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXT4

Protein Details
Accession C4QXT4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-98QSVRVKLIRSRHNRSPNPNSSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0223  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12611  RRM1_NGR1_NAM8_like  
Amino Acid Sequences MSLEHLGVTDSLAQVDPDAPTEAKFVQSQEQGAGSSNSPPPSSKSSPSLASRTLWMGDLEPWWVEENIIQLWQQLGQSVRVKLIRSRHNRSPNPNSSLPPPQNAGYCFVEFERHEDALQALALNGSIVPRSSGRLFRLNWASGPTLQSQIPPTPQYSLFVGDLSPSTTEAHLLALFQPNYSSIQSVRVMTDPATGSSRCFGFVRFTEEEDRQRALHEMSGIWLGGRPIRVALATPRGAGHQPVQMQQHLQYAPSAPMVPQFASNNSSSRNIYNDPTNSTVFVGGLAAGVSEETLFTLFEPFGSISSIKIPRGKGCGFVKFSTREEAENAISGMHGFLIGGSRVRLSWGRSSLPNQHTHSHPHPQHLMMSPGVFDPMGRNGGMYGIPPGVAPGVLPGMTPIYYPTDSQVYSEMDPGQYSGPYMVQSPVGSSIGAPNISGNGSMGATSKEVPASSSATTSSPSKSLEDFEETVTSPILSAKEPAPPSSPNTNLSGANSPELASPTVSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.19
12 0.2
13 0.24
14 0.26
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.18
22 0.2
23 0.23
24 0.23
25 0.23
26 0.24
27 0.27
28 0.33
29 0.38
30 0.37
31 0.38
32 0.4
33 0.46
34 0.5
35 0.5
36 0.45
37 0.41
38 0.38
39 0.36
40 0.33
41 0.27
42 0.22
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.15
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.13
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.18
64 0.23
65 0.23
66 0.27
67 0.28
68 0.3
69 0.33
70 0.4
71 0.44
72 0.49
73 0.56
74 0.62
75 0.7
76 0.76
77 0.81
78 0.83
79 0.81
80 0.79
81 0.75
82 0.68
83 0.62
84 0.65
85 0.58
86 0.5
87 0.44
88 0.39
89 0.39
90 0.37
91 0.37
92 0.3
93 0.27
94 0.25
95 0.22
96 0.25
97 0.21
98 0.24
99 0.24
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.16
105 0.16
106 0.11
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.06
116 0.07
117 0.1
118 0.13
119 0.18
120 0.21
121 0.28
122 0.29
123 0.35
124 0.4
125 0.38
126 0.36
127 0.34
128 0.32
129 0.27
130 0.29
131 0.23
132 0.2
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.22
138 0.21
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.22
143 0.2
144 0.2
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.11
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.09
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.17
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.21
191 0.2
192 0.22
193 0.25
194 0.28
195 0.3
196 0.29
197 0.29
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.18
202 0.16
203 0.13
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.14
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.18
233 0.18
234 0.21
235 0.17
236 0.16
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.23
263 0.23
264 0.2
265 0.18
266 0.17
267 0.12
268 0.11
269 0.08
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.02
277 0.02
278 0.02
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.13
293 0.15
294 0.16
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.28
299 0.28
300 0.3
301 0.32
302 0.36
303 0.36
304 0.36
305 0.38
306 0.36
307 0.37
308 0.34
309 0.31
310 0.26
311 0.24
312 0.25
313 0.21
314 0.18
315 0.17
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.05
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.11
332 0.13
333 0.18
334 0.21
335 0.23
336 0.26
337 0.31
338 0.38
339 0.41
340 0.46
341 0.43
342 0.44
343 0.43
344 0.48
345 0.49
346 0.5
347 0.47
348 0.46
349 0.45
350 0.43
351 0.44
352 0.39
353 0.36
354 0.27
355 0.24
356 0.19
357 0.16
358 0.15
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.1
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.2
398 0.19
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.14
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.13
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.14
438 0.16
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.15
443 0.18
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.2
448 0.22
449 0.22
450 0.24
451 0.26
452 0.29
453 0.28
454 0.28
455 0.28
456 0.26
457 0.26
458 0.23
459 0.19
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.14
465 0.15
466 0.22
467 0.24
468 0.27
469 0.28
470 0.29
471 0.35
472 0.41
473 0.43
474 0.38
475 0.41
476 0.41
477 0.38
478 0.39
479 0.4
480 0.33
481 0.31
482 0.28
483 0.25
484 0.24
485 0.25
486 0.22