Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JXL6

Protein Details
Accession E3JXL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-51IKPHTARRPKTISTTRRPKRSTIPQKLKVPTAPKRPKINPTRKRIWTPTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-45RRPKTISTTRRPKRSTIPQKLKVPTAPKRPKINPTRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043138  F:3'-5' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0009378  F:four-way junction helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006268  P:DNA unwinding involved in DNA replication  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
KEGG pgr:PGTG_02252  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
Amino Acid Sequences MIKPHTARRPKTISTTRRPKRSTIPQKLKVPTAPKRPKINPTRKRIWTPTGINIYQEVYKMTDEKLKAHIAETSLKSYGQCAKDLQVDAVFNLVQGRNTFLLAGTGFGKSRIAKLYMKMIPQNSRGVVVVLNPLDSLGENQVLEKKQAGFSAINLTKLTFNRKAAEEISDGVYQFVYLSPEIFLNSKLFRKLYYSSRFQNRLALIVIDEAHMIYIWGLVEGSSSNNSTSAHFRHEDYSIFRPSYGKLGPQLLFRNDKPLLLLSATCRPVAVEAIKKSLKLTDATVDILRGKLTRPEIRIVRLPMAHSLASSLDAIKVFPSCKEVANCDMVPSLVYSGSRNRTSTVLEVIDYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.82
3 0.82
4 0.84
5 0.83
6 0.79
7 0.79
8 0.8
9 0.8
10 0.8
11 0.82
12 0.81
13 0.86
14 0.85
15 0.81
16 0.77
17 0.75
18 0.73
19 0.73
20 0.75
21 0.74
22 0.79
23 0.8
24 0.83
25 0.85
26 0.86
27 0.85
28 0.84
29 0.86
30 0.84
31 0.86
32 0.83
33 0.79
34 0.77
35 0.73
36 0.72
37 0.7
38 0.62
39 0.54
40 0.47
41 0.42
42 0.34
43 0.29
44 0.21
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.2
50 0.2
51 0.22
52 0.26
53 0.27
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.23
58 0.29
59 0.28
60 0.27
61 0.25
62 0.25
63 0.24
64 0.25
65 0.3
66 0.24
67 0.24
68 0.22
69 0.24
70 0.28
71 0.29
72 0.27
73 0.22
74 0.2
75 0.18
76 0.18
77 0.15
78 0.1
79 0.12
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.1
97 0.13
98 0.14
99 0.17
100 0.18
101 0.2
102 0.28
103 0.3
104 0.32
105 0.34
106 0.35
107 0.36
108 0.37
109 0.39
110 0.31
111 0.28
112 0.25
113 0.22
114 0.18
115 0.14
116 0.14
117 0.11
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.16
136 0.12
137 0.12
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.21
145 0.27
146 0.21
147 0.22
148 0.23
149 0.24
150 0.26
151 0.24
152 0.25
153 0.19
154 0.17
155 0.18
156 0.16
157 0.14
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.19
179 0.26
180 0.3
181 0.34
182 0.38
183 0.46
184 0.49
185 0.46
186 0.48
187 0.39
188 0.35
189 0.31
190 0.24
191 0.17
192 0.14
193 0.13
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.14
216 0.15
217 0.18
218 0.19
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.23
223 0.23
224 0.27
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.26
231 0.22
232 0.2
233 0.19
234 0.24
235 0.25
236 0.29
237 0.33
238 0.32
239 0.36
240 0.34
241 0.38
242 0.33
243 0.32
244 0.29
245 0.25
246 0.22
247 0.18
248 0.19
249 0.15
250 0.21
251 0.22
252 0.21
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.21
258 0.21
259 0.22
260 0.29
261 0.3
262 0.3
263 0.3
264 0.29
265 0.27
266 0.22
267 0.22
268 0.19
269 0.2
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.16
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.23
280 0.28
281 0.31
282 0.38
283 0.42
284 0.46
285 0.51
286 0.49
287 0.48
288 0.43
289 0.42
290 0.38
291 0.37
292 0.32
293 0.25
294 0.22
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.17
307 0.17
308 0.22
309 0.25
310 0.28
311 0.31
312 0.36
313 0.35
314 0.32
315 0.31
316 0.26
317 0.23
318 0.2
319 0.17
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.2
324 0.28
325 0.31
326 0.31
327 0.32
328 0.33
329 0.36
330 0.36
331 0.34
332 0.29