Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3K839

Protein Details
Accession E3K839    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-41QQTEDDSRTKTKRKRKSSAKVQDEPEKKEHydrophilic
60-88AQISAELPKKEKKKKKKKAAEIIAREEADHydrophilic
126-155LETEAISHKERRKRRKLEKKKSAQKDEDEDBasic
524-545AEEPVRKAKKEFKGRQKPGAALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-30KTKRKRKSS
67-78PKKEKKKKKKKA
134-147KERRKRRKLEKKKS
528-541VRKAKKEFKGRQKP
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgr:PGTG_06381  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGSTVISQEKHQQTEDDSRTKTKRKRKSSAKVQDEPEKKETDDRDDSMDAADQSSVSAAQISAELPKKEKKKKKKKAAEIIAREEADEECTSTIIPNKSKCDEDNEDDNDDDGSDQEDGQEDLKLETEAISHKERRKRRKLEKKKSAQKDEDEDGETKTREAVTSSRKVESIFTTATRSKHGVWVGNLLFTTTAQELARFFEPAGKVTRLNMPAGKRAHEANSGFAYVDFDSAEAVDAALEKSECLLGGRKLLIKRSSDYSGRPSAIPASSTTPSSNSTTPSASIPPPTVSKSVRKILDRQKQPPAPCIYFGNLGFETTSEGIVSMLHAHHQAQQVWKPKKNTIKMNGKDQEEEQEDDEEEEDEEEDEGRGRAKPDTRSAQVGIRKVRMGTFEDTGKCKGFAFVDFETIDQATNVLVNLKNHRLDGRSLTVEYASVEAVKRGGGSVRSMHQQQQSKRGYLGSARPPGRPDRFQRDEAPHLARRPPPSIEPRPRTHPNNPSSTRSHQPTAPFAPPPIIAPPPAAEEPVRKAKKEFKGRQKPGAALANAQRAPTGIVKNPETVGKKIVFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.52
4 0.5
5 0.47
6 0.53
7 0.6
8 0.68
9 0.71
10 0.71
11 0.74
12 0.78
13 0.85
14 0.88
15 0.91
16 0.92
17 0.94
18 0.93
19 0.91
20 0.87
21 0.87
22 0.83
23 0.79
24 0.72
25 0.64
26 0.56
27 0.55
28 0.52
29 0.5
30 0.49
31 0.44
32 0.44
33 0.41
34 0.4
35 0.34
36 0.33
37 0.24
38 0.18
39 0.17
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.09
44 0.06
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.13
51 0.18
52 0.2
53 0.23
54 0.32
55 0.41
56 0.52
57 0.62
58 0.67
59 0.73
60 0.83
61 0.9
62 0.94
63 0.95
64 0.95
65 0.96
66 0.95
67 0.92
68 0.88
69 0.83
70 0.72
71 0.61
72 0.5
73 0.39
74 0.32
75 0.24
76 0.17
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.18
82 0.2
83 0.25
84 0.29
85 0.34
86 0.37
87 0.41
88 0.41
89 0.43
90 0.44
91 0.45
92 0.48
93 0.46
94 0.45
95 0.42
96 0.41
97 0.32
98 0.25
99 0.19
100 0.11
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.13
118 0.19
119 0.24
120 0.32
121 0.4
122 0.5
123 0.6
124 0.68
125 0.76
126 0.81
127 0.86
128 0.91
129 0.94
130 0.95
131 0.96
132 0.95
133 0.95
134 0.94
135 0.9
136 0.84
137 0.79
138 0.72
139 0.64
140 0.56
141 0.47
142 0.39
143 0.35
144 0.28
145 0.22
146 0.19
147 0.16
148 0.13
149 0.14
150 0.18
151 0.22
152 0.29
153 0.32
154 0.32
155 0.32
156 0.33
157 0.33
158 0.3
159 0.26
160 0.21
161 0.19
162 0.23
163 0.26
164 0.26
165 0.27
166 0.26
167 0.23
168 0.27
169 0.29
170 0.27
171 0.25
172 0.31
173 0.28
174 0.27
175 0.26
176 0.21
177 0.18
178 0.14
179 0.15
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.2
193 0.18
194 0.18
195 0.19
196 0.25
197 0.22
198 0.24
199 0.26
200 0.23
201 0.29
202 0.3
203 0.3
204 0.26
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.27
209 0.23
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.17
214 0.16
215 0.11
216 0.11
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.11
238 0.14
239 0.16
240 0.21
241 0.24
242 0.23
243 0.25
244 0.27
245 0.3
246 0.28
247 0.29
248 0.29
249 0.29
250 0.28
251 0.26
252 0.23
253 0.21
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.16
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.16
267 0.15
268 0.16
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.17
278 0.17
279 0.22
280 0.26
281 0.31
282 0.34
283 0.34
284 0.41
285 0.48
286 0.54
287 0.56
288 0.57
289 0.6
290 0.61
291 0.6
292 0.59
293 0.55
294 0.47
295 0.41
296 0.37
297 0.3
298 0.28
299 0.26
300 0.24
301 0.17
302 0.16
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.1
307 0.1
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.12
319 0.15
320 0.17
321 0.19
322 0.25
323 0.34
324 0.41
325 0.45
326 0.44
327 0.48
328 0.55
329 0.58
330 0.62
331 0.62
332 0.66
333 0.64
334 0.71
335 0.71
336 0.63
337 0.58
338 0.49
339 0.45
340 0.37
341 0.35
342 0.26
343 0.21
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.12
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.13
361 0.17
362 0.21
363 0.28
364 0.34
365 0.35
366 0.38
367 0.38
368 0.41
369 0.41
370 0.42
371 0.39
372 0.36
373 0.34
374 0.31
375 0.31
376 0.28
377 0.27
378 0.24
379 0.23
380 0.25
381 0.26
382 0.28
383 0.29
384 0.27
385 0.24
386 0.21
387 0.2
388 0.17
389 0.16
390 0.19
391 0.17
392 0.2
393 0.19
394 0.19
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.1
399 0.09
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.09
405 0.12
406 0.17
407 0.21
408 0.23
409 0.24
410 0.26
411 0.26
412 0.27
413 0.29
414 0.3
415 0.27
416 0.27
417 0.26
418 0.24
419 0.22
420 0.19
421 0.15
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.15
434 0.18
435 0.22
436 0.25
437 0.31
438 0.36
439 0.42
440 0.44
441 0.51
442 0.53
443 0.51
444 0.5
445 0.45
446 0.4
447 0.38
448 0.41
449 0.4
450 0.44
451 0.44
452 0.45
453 0.48
454 0.54
455 0.56
456 0.55
457 0.55
458 0.56
459 0.6
460 0.62
461 0.67
462 0.65
463 0.64
464 0.62
465 0.61
466 0.56
467 0.54
468 0.56
469 0.54
470 0.51
471 0.5
472 0.47
473 0.48
474 0.53
475 0.6
476 0.64
477 0.67
478 0.67
479 0.71
480 0.76
481 0.76
482 0.76
483 0.75
484 0.71
485 0.74
486 0.73
487 0.71
488 0.69
489 0.67
490 0.66
491 0.62
492 0.59
493 0.52
494 0.52
495 0.53
496 0.53
497 0.51
498 0.45
499 0.39
500 0.38
501 0.35
502 0.32
503 0.29
504 0.25
505 0.21
506 0.21
507 0.21
508 0.24
509 0.24
510 0.24
511 0.22
512 0.24
513 0.3
514 0.39
515 0.42
516 0.38
517 0.43
518 0.5
519 0.59
520 0.66
521 0.69
522 0.7
523 0.77
524 0.84
525 0.88
526 0.85
527 0.78
528 0.74
529 0.72
530 0.62
531 0.57
532 0.56
533 0.55
534 0.49
535 0.46
536 0.38
537 0.3
538 0.32
539 0.31
540 0.3
541 0.27
542 0.32
543 0.35
544 0.38
545 0.39
546 0.43
547 0.42
548 0.39
549 0.39