Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JTD3

Protein Details
Accession E3JTD3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52RERTSRTRDSDRDRNRYRDRDGBasic
140-167SPDGRSRKLDRSRHKSRHGRSRSRSPSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-183RDRDRSRSPDGRSRKLDRSRHKSRHGRSRSRSPSGSPGPSRRSSGGKGGDR
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pgr:PGTG_01800  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MRGGPSRHDSRAGSPGDGNSRNQRESSFQDRERTSRTRDSDRDRNRYRDRDGRDKDGERNRERGREYVDRDLDRDRDRTRDRDRGQDYSKSYDRDADRDRDRYRERTRDGDGKHRNSDRSIRDSAGDREYRDRDRDRSRSPDGRSRKLDRSRHKSRHGRSRSRSPSGSPGPSRRSSGGKGGDRTSPENTRKRSTGNAMDVDPNVDDEDEEAKMARLMGFSSLTTTKGKHVAGNNEAGTVDVVKVRTWRQYMNRRGGFNRPLDKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.41
4 0.41
5 0.41
6 0.42
7 0.46
8 0.45
9 0.44
10 0.42
11 0.39
12 0.44
13 0.48
14 0.47
15 0.46
16 0.52
17 0.54
18 0.57
19 0.58
20 0.57
21 0.54
22 0.54
23 0.56
24 0.57
25 0.62
26 0.67
27 0.71
28 0.75
29 0.79
30 0.78
31 0.81
32 0.81
33 0.8
34 0.79
35 0.77
36 0.75
37 0.76
38 0.74
39 0.73
40 0.71
41 0.68
42 0.69
43 0.7
44 0.71
45 0.64
46 0.67
47 0.63
48 0.62
49 0.6
50 0.56
51 0.54
52 0.52
53 0.54
54 0.54
55 0.55
56 0.5
57 0.49
58 0.49
59 0.47
60 0.41
61 0.42
62 0.34
63 0.37
64 0.41
65 0.47
66 0.51
67 0.56
68 0.56
69 0.6
70 0.63
71 0.61
72 0.61
73 0.59
74 0.55
75 0.51
76 0.52
77 0.44
78 0.4
79 0.39
80 0.36
81 0.36
82 0.37
83 0.38
84 0.39
85 0.44
86 0.46
87 0.47
88 0.5
89 0.53
90 0.57
91 0.58
92 0.56
93 0.54
94 0.57
95 0.56
96 0.54
97 0.56
98 0.57
99 0.53
100 0.56
101 0.54
102 0.51
103 0.47
104 0.52
105 0.46
106 0.42
107 0.39
108 0.33
109 0.31
110 0.32
111 0.32
112 0.3
113 0.27
114 0.22
115 0.25
116 0.28
117 0.29
118 0.31
119 0.32
120 0.33
121 0.39
122 0.45
123 0.45
124 0.49
125 0.53
126 0.55
127 0.56
128 0.58
129 0.57
130 0.58
131 0.6
132 0.59
133 0.62
134 0.64
135 0.69
136 0.7
137 0.73
138 0.76
139 0.78
140 0.82
141 0.82
142 0.81
143 0.83
144 0.83
145 0.84
146 0.8
147 0.83
148 0.8
149 0.77
150 0.71
151 0.63
152 0.61
153 0.57
154 0.56
155 0.5
156 0.49
157 0.49
158 0.49
159 0.49
160 0.43
161 0.41
162 0.37
163 0.39
164 0.41
165 0.4
166 0.41
167 0.4
168 0.41
169 0.4
170 0.41
171 0.38
172 0.38
173 0.41
174 0.46
175 0.49
176 0.5
177 0.5
178 0.49
179 0.5
180 0.49
181 0.49
182 0.47
183 0.44
184 0.41
185 0.41
186 0.38
187 0.34
188 0.26
189 0.19
190 0.13
191 0.11
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.23
214 0.24
215 0.26
216 0.31
217 0.37
218 0.39
219 0.45
220 0.41
221 0.37
222 0.35
223 0.3
224 0.25
225 0.18
226 0.15
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.16
231 0.19
232 0.25
233 0.28
234 0.35
235 0.43
236 0.53
237 0.61
238 0.69
239 0.72
240 0.7
241 0.71
242 0.72
243 0.7
244 0.69