Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JW27

Protein Details
Accession E3JW27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
892-913EVEDSEKKKKKTKAPTQEEVEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
898-902KKKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011184  DNA_mismatch_repair_Msh2  
IPR007695  DNA_mismatch_repair_MutS-lik_N  
IPR000432  DNA_mismatch_repair_MutS_C  
IPR007861  DNA_mismatch_repair_MutS_clamp  
IPR007696  DNA_mismatch_repair_MutS_core  
IPR016151  DNA_mismatch_repair_MutS_N  
IPR036187  DNA_mismatch_repair_MutS_sf  
IPR007860  DNA_mmatch_repair_MutS_con_dom  
IPR032642  Msh2_ATP-bd  
IPR036678  MutS_con_dom_sf  
IPR045076  MutS_family  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0032301  C:MutSalpha complex  
GO:0032302  C:MutSbeta complex  
GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0140664  F:ATP-dependent DNA damage sensor activity  
GO:0000406  F:double-strand/single-strand DNA junction binding  
GO:0000400  F:four-way junction DNA binding  
GO:0032137  F:guanine/thymine mispair binding  
GO:0000404  F:heteroduplex DNA loop binding  
GO:0030983  F:mismatched DNA binding  
GO:0032138  F:single base insertion or deletion binding  
GO:0000403  F:Y-form DNA binding  
GO:0007534  P:gene conversion at mating-type locus  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
GO:0043570  P:maintenance of DNA repeat elements  
GO:0006311  P:meiotic gene conversion  
GO:0000710  P:meiotic mismatch repair  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006312  P:mitotic recombination  
GO:0000735  P:removal of nonhomologous ends  
GO:0043111  P:replication fork arrest  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
KEGG pgr:PGTG_02693  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01624  MutS_I  
PF05188  MutS_II  
PF05192  MutS_III  
PF05190  MutS_IV  
PF00488  MutS_V  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00486  DNA_MISMATCH_REPAIR_2  
CDD cd03285  ABC_MSH2_euk  
Amino Acid Sequences MTTPMYPTKAPEVNEDQTASKKFCETFKNLEPCPKGTLRIFEREKGEFYTCYGPDAQYVATQFYRTNTVLRFIGPKTNGEPGLPSCSLSRTGAITFLRECLTSRQMRIQIYRSDQPSSKSSSSWSLAVQASPGNLEPLADLLFSNTDILSSPVIASLWVKGNSGSASGRIMGVAFADTSVRTLGLSEFPEQEDGWGNTESLIIQLGIKEAIIATPTSTKNTSDSSQNTEYQQLIEVLERCGVVVTERKRAEFTLKNVEQDINRLLSGDRQLAALPQFEMKTALAALNPLLNYLAILDDPSNHSAYKFITHDLGQFMRLDASAVRALHLFPNPTSIGGGGKNMSLFGLLNRCKTGQGTRLLGRWLKQPLVNLHEIEQRQTLVGIMFQDGLLRQTLQDDHLKAMPDLTRISKRFIQGAGSLEDVVRVYQAVVKLPEILEALDKADGFETGNSEEAKELLNVIYRLPFQECVTNLAQYVEMVETTVDLDELENHQFIIKPDFDDDLRELKNALDQNREQLDEEHLRVAQDLGMGTDSKVLHFENHQVYGYVFRLTRKEAGVIRSKKTYIELSNRNNGCHFTTKTLKELNNELKDLTQKYQRKQSSLVKEVVSIAASYCPILEKLNEIIAHLDLIVSFAHVSLNAPMTYTCPKMYALGEGDVCLKGCRHPCLEVQDDINFIPNDTLMERERSSFHIITGPNMGGKSTYIRQIGVAALMAQLGCYVPCAEASLPVFDSILARVGAGDSQTKGISTFMAEMLETAVILKSATPNSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEHIAVEIKAFTLFATHFHELTTLDKQVEHVKNYHVVAHVEKKSAAGVSSSDITLLYKVEPGFSDQSFGIHVAEMANFPEDVLKLARRKAEELEYFGEEEVEDSEKKKKKTKAPTQEEVEEGTGLVRQMLEKWIDQDQRMKTSPDQMDLDDDQLKLDSKLKCLKESFQSFLPQLEQNPWIRDILMNSY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.38
4 0.4
5 0.43
6 0.37
7 0.31
8 0.32
9 0.31
10 0.36
11 0.42
12 0.42
13 0.46
14 0.54
15 0.61
16 0.6
17 0.66
18 0.64
19 0.58
20 0.58
21 0.52
22 0.48
23 0.44
24 0.5
25 0.47
26 0.53
27 0.55
28 0.54
29 0.57
30 0.54
31 0.52
32 0.48
33 0.46
34 0.36
35 0.35
36 0.37
37 0.32
38 0.31
39 0.31
40 0.26
41 0.24
42 0.25
43 0.22
44 0.17
45 0.18
46 0.2
47 0.19
48 0.2
49 0.19
50 0.2
51 0.25
52 0.23
53 0.26
54 0.24
55 0.28
56 0.27
57 0.28
58 0.31
59 0.28
60 0.35
61 0.32
62 0.34
63 0.33
64 0.38
65 0.37
66 0.33
67 0.34
68 0.28
69 0.34
70 0.31
71 0.29
72 0.23
73 0.24
74 0.27
75 0.24
76 0.23
77 0.18
78 0.19
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.28
89 0.3
90 0.33
91 0.39
92 0.43
93 0.48
94 0.52
95 0.52
96 0.51
97 0.53
98 0.57
99 0.52
100 0.52
101 0.49
102 0.48
103 0.46
104 0.46
105 0.41
106 0.35
107 0.35
108 0.35
109 0.36
110 0.33
111 0.3
112 0.27
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.17
150 0.19
151 0.17
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.11
172 0.13
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.19
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.09
188 0.09
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.12
202 0.13
203 0.16
204 0.18
205 0.18
206 0.2
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.29
211 0.33
212 0.35
213 0.37
214 0.36
215 0.35
216 0.33
217 0.27
218 0.25
219 0.18
220 0.15
221 0.16
222 0.15
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.15
231 0.17
232 0.25
233 0.26
234 0.28
235 0.29
236 0.3
237 0.36
238 0.35
239 0.37
240 0.4
241 0.4
242 0.41
243 0.41
244 0.43
245 0.35
246 0.32
247 0.29
248 0.2
249 0.18
250 0.17
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.17
255 0.14
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.15
296 0.16
297 0.18
298 0.2
299 0.19
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.07
307 0.09
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.16
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.12
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.14
334 0.15
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.21
342 0.25
343 0.28
344 0.29
345 0.31
346 0.34
347 0.34
348 0.31
349 0.3
350 0.28
351 0.26
352 0.25
353 0.27
354 0.28
355 0.31
356 0.32
357 0.27
358 0.26
359 0.3
360 0.28
361 0.26
362 0.22
363 0.18
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.07
380 0.07
381 0.1
382 0.13
383 0.13
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.16
388 0.18
389 0.16
390 0.14
391 0.15
392 0.17
393 0.22
394 0.22
395 0.26
396 0.27
397 0.27
398 0.28
399 0.27
400 0.26
401 0.21
402 0.23
403 0.2
404 0.17
405 0.16
406 0.13
407 0.13
408 0.1
409 0.08
410 0.06
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.1
451 0.11
452 0.09
453 0.12
454 0.13
455 0.16
456 0.16
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.1
462 0.1
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.04
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.08
480 0.08
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.13
493 0.12
494 0.16
495 0.17
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.22
500 0.23
501 0.24
502 0.21
503 0.19
504 0.22
505 0.19
506 0.2
507 0.16
508 0.15
509 0.14
510 0.14
511 0.13
512 0.08
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.05
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.15
527 0.14
528 0.16
529 0.16
530 0.15
531 0.15
532 0.16
533 0.16
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.18
540 0.16
541 0.19
542 0.19
543 0.23
544 0.32
545 0.34
546 0.35
547 0.35
548 0.35
549 0.31
550 0.31
551 0.31
552 0.27
553 0.32
554 0.38
555 0.4
556 0.48
557 0.48
558 0.47
559 0.43
560 0.39
561 0.33
562 0.3
563 0.27
564 0.23
565 0.29
566 0.3
567 0.33
568 0.37
569 0.36
570 0.33
571 0.39
572 0.43
573 0.38
574 0.38
575 0.34
576 0.3
577 0.31
578 0.31
579 0.27
580 0.27
581 0.3
582 0.34
583 0.43
584 0.44
585 0.44
586 0.48
587 0.54
588 0.54
589 0.54
590 0.53
591 0.44
592 0.42
593 0.4
594 0.33
595 0.25
596 0.15
597 0.11
598 0.08
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.09
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.09
615 0.08
616 0.04
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.06
626 0.08
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.14
634 0.13
635 0.13
636 0.15
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.16
641 0.15
642 0.15
643 0.16
644 0.14
645 0.14
646 0.11
647 0.09
648 0.12
649 0.16
650 0.19
651 0.2
652 0.22
653 0.26
654 0.32
655 0.35
656 0.33
657 0.31
658 0.28
659 0.27
660 0.24
661 0.25
662 0.18
663 0.14
664 0.13
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.12
669 0.09
670 0.13
671 0.14
672 0.15
673 0.16
674 0.19
675 0.25
676 0.22
677 0.22
678 0.24
679 0.23
680 0.24
681 0.25
682 0.22
683 0.17
684 0.17
685 0.16
686 0.11
687 0.11
688 0.14
689 0.13
690 0.18
691 0.17
692 0.18
693 0.18
694 0.19
695 0.18
696 0.15
697 0.13
698 0.08
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.05
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.07
711 0.07
712 0.1
713 0.12
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.11
719 0.12
720 0.09
721 0.1
722 0.08
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.08
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.08
739 0.09
740 0.08
741 0.08
742 0.08
743 0.08
744 0.06
745 0.06
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.07
751 0.08
752 0.09
753 0.1
754 0.1
755 0.11
756 0.13
757 0.13
758 0.1
759 0.1
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.09
764 0.08
765 0.07
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.09
772 0.09
773 0.09
774 0.09
775 0.07
776 0.07
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.06
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.06
791 0.07
792 0.08
793 0.1
794 0.17
795 0.18
796 0.18
797 0.18
798 0.19
799 0.18
800 0.21
801 0.23
802 0.18
803 0.17
804 0.17
805 0.18
806 0.27
807 0.31
808 0.31
809 0.29
810 0.3
811 0.35
812 0.36
813 0.37
814 0.3
815 0.27
816 0.29
817 0.36
818 0.36
819 0.33
820 0.32
821 0.3
822 0.29
823 0.27
824 0.22
825 0.14
826 0.12
827 0.13
828 0.14
829 0.14
830 0.12
831 0.12
832 0.12
833 0.11
834 0.11
835 0.09
836 0.11
837 0.11
838 0.12
839 0.13
840 0.17
841 0.2
842 0.19
843 0.21
844 0.18
845 0.18
846 0.18
847 0.18
848 0.14
849 0.1
850 0.1
851 0.09
852 0.1
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.1
859 0.09
860 0.11
861 0.13
862 0.19
863 0.22
864 0.27
865 0.32
866 0.33
867 0.36
868 0.39
869 0.44
870 0.42
871 0.43
872 0.43
873 0.4
874 0.38
875 0.35
876 0.3
877 0.21
878 0.17
879 0.14
880 0.13
881 0.11
882 0.12
883 0.22
884 0.28
885 0.34
886 0.42
887 0.5
888 0.57
889 0.67
890 0.77
891 0.79
892 0.82
893 0.86
894 0.85
895 0.8
896 0.72
897 0.63
898 0.53
899 0.42
900 0.32
901 0.23
902 0.17
903 0.13
904 0.11
905 0.09
906 0.08
907 0.1
908 0.14
909 0.17
910 0.17
911 0.2
912 0.28
913 0.32
914 0.34
915 0.4
916 0.41
917 0.46
918 0.47
919 0.48
920 0.43
921 0.49
922 0.5
923 0.47
924 0.45
925 0.38
926 0.41
927 0.39
928 0.39
929 0.32
930 0.29
931 0.23
932 0.22
933 0.23
934 0.19
935 0.24
936 0.22
937 0.27
938 0.36
939 0.38
940 0.44
941 0.46
942 0.51
943 0.55
944 0.59
945 0.56
946 0.52
947 0.54
948 0.49
949 0.47
950 0.45
951 0.38
952 0.34
953 0.34
954 0.35
955 0.34
956 0.37
957 0.35
958 0.32
959 0.3
960 0.3