Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KM06

Protein Details
Accession E3KM06    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-95QRSSEQSSAPKKKNQQRNKRPDSADNGHydrophilic
121-145IDEAAGKNKKGKRRRRKGGDEDLEMBasic
349-372QKATAKKTREWARKIQDARKIQRMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-138GKNKKGKRRRRKG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
KEGG pgr:PGTG_11524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MPRDLEDEIFGGESDLSDFDQDERPTEDVQENLAEEGRQHEEDDGGLSHDPAPREGSHTYPKFRKDTTQRSSEQSSAPKKKNQQRNKRPDSADNGVPPDDGEAEVVIDPEEQRRQELYQRIDEAAGKNKKGKRRRRKGGDEDLEMMADEEVSRLRTEMLSAADTDIQANEERRPATGKLMLLPKVKSTIQKSHLETAILDNGVLEAVKKWLEPLPDRSLPALNIQRELLELLSKMSIDTQSLKSSELGKIVLFYTKCPRVDPTIKRMADQLVTRWIKPILRRSARSREPIPMTAPRPVRPPTGGAPNSQRARIPETVHQVFHNPARSQLDSTTDGPGGSQNPAMRNSTQKATAKKTREWARKIQDARKIQRMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.17
8 0.17
9 0.19
10 0.21
11 0.23
12 0.23
13 0.26
14 0.26
15 0.21
16 0.22
17 0.22
18 0.19
19 0.18
20 0.18
21 0.14
22 0.12
23 0.16
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.14
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.18
41 0.22
42 0.23
43 0.25
44 0.33
45 0.38
46 0.45
47 0.48
48 0.54
49 0.55
50 0.55
51 0.6
52 0.6
53 0.65
54 0.64
55 0.66
56 0.63
57 0.64
58 0.67
59 0.6
60 0.54
61 0.53
62 0.56
63 0.57
64 0.6
65 0.61
66 0.67
67 0.73
68 0.79
69 0.81
70 0.82
71 0.83
72 0.89
73 0.9
74 0.9
75 0.85
76 0.81
77 0.79
78 0.73
79 0.67
80 0.59
81 0.52
82 0.43
83 0.37
84 0.3
85 0.23
86 0.18
87 0.12
88 0.09
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.24
103 0.31
104 0.32
105 0.34
106 0.36
107 0.35
108 0.34
109 0.34
110 0.3
111 0.32
112 0.32
113 0.29
114 0.34
115 0.38
116 0.46
117 0.53
118 0.62
119 0.64
120 0.71
121 0.8
122 0.84
123 0.9
124 0.91
125 0.92
126 0.88
127 0.8
128 0.71
129 0.6
130 0.5
131 0.39
132 0.29
133 0.17
134 0.1
135 0.07
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.22
167 0.26
168 0.26
169 0.25
170 0.23
171 0.23
172 0.24
173 0.25
174 0.26
175 0.29
176 0.32
177 0.38
178 0.39
179 0.4
180 0.4
181 0.35
182 0.31
183 0.25
184 0.22
185 0.15
186 0.12
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.08
198 0.12
199 0.15
200 0.2
201 0.26
202 0.28
203 0.29
204 0.29
205 0.28
206 0.25
207 0.29
208 0.29
209 0.23
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.13
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.19
233 0.17
234 0.15
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.14
240 0.15
241 0.21
242 0.26
243 0.27
244 0.27
245 0.29
246 0.33
247 0.42
248 0.46
249 0.47
250 0.51
251 0.51
252 0.5
253 0.49
254 0.44
255 0.38
256 0.33
257 0.28
258 0.28
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.29
263 0.29
264 0.33
265 0.4
266 0.41
267 0.47
268 0.53
269 0.59
270 0.66
271 0.7
272 0.72
273 0.65
274 0.63
275 0.6
276 0.58
277 0.55
278 0.52
279 0.48
280 0.48
281 0.48
282 0.42
283 0.43
284 0.43
285 0.42
286 0.36
287 0.38
288 0.35
289 0.42
290 0.41
291 0.4
292 0.44
293 0.49
294 0.49
295 0.47
296 0.45
297 0.37
298 0.42
299 0.42
300 0.4
301 0.38
302 0.44
303 0.46
304 0.45
305 0.43
306 0.39
307 0.38
308 0.39
309 0.4
310 0.31
311 0.33
312 0.37
313 0.38
314 0.38
315 0.36
316 0.36
317 0.32
318 0.34
319 0.32
320 0.27
321 0.24
322 0.22
323 0.23
324 0.19
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.22
329 0.25
330 0.28
331 0.28
332 0.34
333 0.36
334 0.37
335 0.42
336 0.45
337 0.5
338 0.56
339 0.62
340 0.62
341 0.64
342 0.69
343 0.72
344 0.76
345 0.75
346 0.76
347 0.76
348 0.79
349 0.82
350 0.8
351 0.79
352 0.8
353 0.81