Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

E3K7J6

Protein Details
Accession E3K7J6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
990-1013SEDGTKKKRKGGGGKRKNNKETGIBasic
1021-1054VDEGSEQEEKKRKRKRTKKQSNQKEDQTNNRSNRHydrophilic
1066-1090SDDAKPVNRSSKKKSGKIYKSAEFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
995-1008KKKRKGGGGKRKNN
1030-1039KKRKRKRTKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_06443  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13174  TPR_6  
Amino Acid Sequences MASAMAMASSSILEVPLNNNTESLELDLAEFCGGEGSVEEIVGIFLQEKLPAKFWTRAAMEYWKRDLKQDAISLANQGLQALRDQDRPSECLPLLCQLATYAINLSRGLPTLKLETPEYDTIPPAQPTADETLEKAAHYINEASRIDSRNPLVLDARATLYLAQKNYDQALTACEEILKERPTHLPALLGKARVLFHRKFFRPALKLYQQVLKLAPHVLPDPRIGIGSCFWFLGDQKLARQAWERSLVVNPGKASQGARLLLGLSHFQASKDIHLPDEAQFAAYQKAISDVQAVFKMDRNNAAAAAVLASHLLTANNWTTATKMAERAVQYANTASTAVEARLVLARAFHAQGKLNEAMREYRAAAPPERSVLTSILGVAQILVARNEFGIAINMFENVVRRQPRCIEALANLAALRTHLAFTSSSSTEASSEKTKAKELHEQITRLFATRVKNHSMKPDDEGMMPPRIREVASDPDLYIEIARLSSDTDINRSLKAYRQSLTVREDLGKPIPAMLLNNIGVLEWKNGHLTEAQERIESALAATASAVVGDETEREINERTAVCMLFNLGVICEQAKDKAKAKDIYERILLRHPEYVDAKARLALMYLSEKNYDKTNALLKEALTSQTGNGELRALYTYFLIESNQIKQARDFTVATLKDHDKSDVYALCASGALLYTQARENKAIGPEASLDRATLQLDPQCAFAAQGLAIALAEHVISPSNVNAPSSNGAFAPDASNVRAKNLRDSITILTKVREAHNDGSVYVNLGHCHYLRDEFDRAIENYFTASKRFYDDKNVLVLLYLARAWYQKASKDRSFAALRSALTFVQTAKEHHPKDGAIAFNLALVQQKGLELLVDLPPSKRTLAEIKTAIADAQLAQEAFGELASKPAGTVPFDIDIAHQRKRYGESLLRRTSELSESQEAYESSEIAKIERARQERENERQRLAEAERLRLEEIAAKNEELTRKRQEMQESVATWYIKQANSDNESEDGTKKKRKGGGGKRKNNKETGITIVPDDEVDEGSEQEEKKRKRKRTKKQSNQKEDQTNNRSNRAISTGEDENYDSDDAKPVNRSSKKKSGKIYKSAEFVEDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.16
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.19
11 0.14
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.05
32 0.06
33 0.07
34 0.11
35 0.14
36 0.17
37 0.2
38 0.24
39 0.28
40 0.33
41 0.34
42 0.39
43 0.38
44 0.37
45 0.38
46 0.45
47 0.47
48 0.48
49 0.54
50 0.53
51 0.51
52 0.54
53 0.54
54 0.49
55 0.49
56 0.47
57 0.43
58 0.39
59 0.39
60 0.37
61 0.32
62 0.29
63 0.22
64 0.18
65 0.15
66 0.12
67 0.13
68 0.16
69 0.19
70 0.22
71 0.23
72 0.29
73 0.32
74 0.35
75 0.35
76 0.37
77 0.34
78 0.31
79 0.32
80 0.3
81 0.29
82 0.24
83 0.23
84 0.16
85 0.19
86 0.17
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.15
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.17
98 0.2
99 0.23
100 0.24
101 0.25
102 0.26
103 0.3
104 0.32
105 0.32
106 0.28
107 0.27
108 0.27
109 0.29
110 0.27
111 0.22
112 0.19
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.21
117 0.18
118 0.18
119 0.23
120 0.23
121 0.23
122 0.2
123 0.17
124 0.15
125 0.16
126 0.19
127 0.16
128 0.22
129 0.23
130 0.25
131 0.29
132 0.32
133 0.32
134 0.33
135 0.34
136 0.31
137 0.31
138 0.31
139 0.28
140 0.26
141 0.26
142 0.22
143 0.22
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.19
148 0.22
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.23
153 0.25
154 0.23
155 0.19
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.14
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.19
168 0.24
169 0.26
170 0.29
171 0.27
172 0.28
173 0.27
174 0.34
175 0.35
176 0.31
177 0.29
178 0.29
179 0.3
180 0.3
181 0.35
182 0.3
183 0.35
184 0.44
185 0.47
186 0.5
187 0.55
188 0.58
189 0.56
190 0.58
191 0.59
192 0.56
193 0.59
194 0.56
195 0.56
196 0.48
197 0.45
198 0.42
199 0.34
200 0.29
201 0.25
202 0.23
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.2
207 0.2
208 0.2
209 0.18
210 0.18
211 0.16
212 0.15
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.15
221 0.18
222 0.17
223 0.18
224 0.26
225 0.26
226 0.27
227 0.32
228 0.3
229 0.3
230 0.35
231 0.33
232 0.28
233 0.3
234 0.34
235 0.3
236 0.31
237 0.26
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.21
242 0.18
243 0.21
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.13
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.14
256 0.14
257 0.16
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.18
264 0.2
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.08
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.15
282 0.18
283 0.21
284 0.19
285 0.22
286 0.22
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.15
291 0.11
292 0.1
293 0.07
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.15
312 0.19
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.16
339 0.17
340 0.21
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.23
345 0.23
346 0.2
347 0.21
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.23
352 0.24
353 0.25
354 0.25
355 0.26
356 0.24
357 0.2
358 0.18
359 0.16
360 0.15
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.09
385 0.08
386 0.14
387 0.18
388 0.18
389 0.22
390 0.25
391 0.28
392 0.28
393 0.29
394 0.24
395 0.21
396 0.25
397 0.21
398 0.19
399 0.16
400 0.13
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.08
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.15
420 0.18
421 0.19
422 0.23
423 0.25
424 0.29
425 0.35
426 0.36
427 0.41
428 0.42
429 0.42
430 0.38
431 0.39
432 0.35
433 0.27
434 0.24
435 0.19
436 0.21
437 0.26
438 0.29
439 0.31
440 0.35
441 0.35
442 0.43
443 0.44
444 0.4
445 0.37
446 0.36
447 0.31
448 0.29
449 0.29
450 0.23
451 0.24
452 0.23
453 0.2
454 0.17
455 0.16
456 0.15
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.19
461 0.2
462 0.19
463 0.19
464 0.19
465 0.18
466 0.14
467 0.08
468 0.05
469 0.04
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.22
484 0.22
485 0.2
486 0.24
487 0.26
488 0.29
489 0.31
490 0.28
491 0.24
492 0.23
493 0.23
494 0.21
495 0.2
496 0.17
497 0.13
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.08
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.13
519 0.15
520 0.15
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.11
526 0.07
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.03
535 0.02
536 0.02
537 0.02
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.06
554 0.07
555 0.06
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.08
563 0.12
564 0.15
565 0.2
566 0.24
567 0.3
568 0.34
569 0.36
570 0.41
571 0.4
572 0.39
573 0.38
574 0.35
575 0.31
576 0.32
577 0.31
578 0.24
579 0.25
580 0.22
581 0.21
582 0.22
583 0.23
584 0.22
585 0.22
586 0.21
587 0.19
588 0.19
589 0.15
590 0.14
591 0.11
592 0.08
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.13
597 0.14
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.13
602 0.14
603 0.19
604 0.18
605 0.19
606 0.19
607 0.18
608 0.18
609 0.18
610 0.17
611 0.12
612 0.11
613 0.09
614 0.1
615 0.11
616 0.09
617 0.08
618 0.08
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.07
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.06
629 0.08
630 0.09
631 0.11
632 0.17
633 0.19
634 0.19
635 0.19
636 0.23
637 0.22
638 0.24
639 0.22
640 0.17
641 0.23
642 0.23
643 0.23
644 0.24
645 0.24
646 0.23
647 0.23
648 0.23
649 0.16
650 0.16
651 0.19
652 0.16
653 0.16
654 0.14
655 0.14
656 0.12
657 0.12
658 0.11
659 0.07
660 0.06
661 0.04
662 0.05
663 0.05
664 0.06
665 0.09
666 0.12
667 0.13
668 0.14
669 0.15
670 0.17
671 0.19
672 0.19
673 0.16
674 0.15
675 0.16
676 0.16
677 0.16
678 0.13
679 0.11
680 0.1
681 0.11
682 0.1
683 0.09
684 0.1
685 0.1
686 0.12
687 0.12
688 0.13
689 0.12
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.08
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.03
706 0.04
707 0.04
708 0.05
709 0.08
710 0.08
711 0.09
712 0.09
713 0.11
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.1
718 0.12
719 0.11
720 0.11
721 0.11
722 0.11
723 0.11
724 0.12
725 0.16
726 0.14
727 0.17
728 0.21
729 0.21
730 0.26
731 0.29
732 0.3
733 0.28
734 0.31
735 0.31
736 0.31
737 0.34
738 0.27
739 0.24
740 0.24
741 0.25
742 0.24
743 0.25
744 0.24
745 0.24
746 0.27
747 0.26
748 0.25
749 0.25
750 0.23
751 0.2
752 0.16
753 0.14
754 0.11
755 0.11
756 0.13
757 0.11
758 0.12
759 0.13
760 0.15
761 0.16
762 0.2
763 0.21
764 0.19
765 0.21
766 0.23
767 0.22
768 0.21
769 0.19
770 0.15
771 0.14
772 0.17
773 0.16
774 0.13
775 0.14
776 0.13
777 0.17
778 0.2
779 0.21
780 0.27
781 0.29
782 0.3
783 0.32
784 0.31
785 0.26
786 0.23
787 0.22
788 0.13
789 0.11
790 0.09
791 0.06
792 0.07
793 0.07
794 0.08
795 0.13
796 0.15
797 0.21
798 0.28
799 0.36
800 0.39
801 0.42
802 0.42
803 0.44
804 0.44
805 0.39
806 0.37
807 0.32
808 0.29
809 0.28
810 0.28
811 0.21
812 0.19
813 0.19
814 0.14
815 0.15
816 0.16
817 0.17
818 0.23
819 0.32
820 0.32
821 0.33
822 0.36
823 0.31
824 0.34
825 0.36
826 0.3
827 0.22
828 0.22
829 0.19
830 0.17
831 0.17
832 0.13
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.05
842 0.07
843 0.09
844 0.1
845 0.11
846 0.12
847 0.13
848 0.15
849 0.15
850 0.13
851 0.15
852 0.21
853 0.24
854 0.3
855 0.3
856 0.29
857 0.3
858 0.3
859 0.26
860 0.18
861 0.15
862 0.09
863 0.09
864 0.09
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.08
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.05
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.09
878 0.11
879 0.11
880 0.13
881 0.14
882 0.15
883 0.15
884 0.15
885 0.15
886 0.22
887 0.25
888 0.29
889 0.29
890 0.29
891 0.32
892 0.37
893 0.38
894 0.37
895 0.4
896 0.45
897 0.53
898 0.59
899 0.57
900 0.53
901 0.52
902 0.47
903 0.43
904 0.37
905 0.32
906 0.29
907 0.29
908 0.29
909 0.29
910 0.26
911 0.25
912 0.22
913 0.16
914 0.13
915 0.14
916 0.14
917 0.12
918 0.17
919 0.17
920 0.23
921 0.31
922 0.35
923 0.38
924 0.44
925 0.52
926 0.57
927 0.65
928 0.68
929 0.66
930 0.64
931 0.61
932 0.55
933 0.52
934 0.46
935 0.43
936 0.36
937 0.37
938 0.37
939 0.37
940 0.37
941 0.31
942 0.29
943 0.27
944 0.26
945 0.25
946 0.24
947 0.22
948 0.23
949 0.27
950 0.33
951 0.29
952 0.33
953 0.36
954 0.39
955 0.44
956 0.48
957 0.51
958 0.5
959 0.53
960 0.54
961 0.47
962 0.45
963 0.45
964 0.4
965 0.33
966 0.33
967 0.32
968 0.26
969 0.27
970 0.29
971 0.32
972 0.36
973 0.37
974 0.34
975 0.3
976 0.31
977 0.3
978 0.3
979 0.3
980 0.33
981 0.4
982 0.42
983 0.48
984 0.52
985 0.6
986 0.67
987 0.71
988 0.75
989 0.78
990 0.85
991 0.88
992 0.92
993 0.9
994 0.85
995 0.79
996 0.73
997 0.66
998 0.63
999 0.57
1000 0.47
1001 0.41
1002 0.36
1003 0.3
1004 0.24
1005 0.21
1006 0.14
1007 0.09
1008 0.09
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.09
1012 0.13
1013 0.13
1014 0.21
1015 0.29
1016 0.36
1017 0.46
1018 0.56
1019 0.66
1020 0.73
1021 0.84
1022 0.88
1023 0.9
1024 0.94
1025 0.95
1026 0.97
1027 0.97
1028 0.97
1029 0.96
1030 0.94
1031 0.93
1032 0.89
1033 0.89
1034 0.86
1035 0.85
1036 0.79
1037 0.76
1038 0.68
1039 0.59
1040 0.54
1041 0.48
1042 0.4
1043 0.33
1044 0.33
1045 0.31
1046 0.29
1047 0.3
1048 0.27
1049 0.24
1050 0.24
1051 0.23
1052 0.18
1053 0.15
1054 0.19
1055 0.18
1056 0.2
1057 0.25
1058 0.27
1059 0.36
1060 0.44
1061 0.51
1062 0.56
1063 0.66
1064 0.73
1065 0.75
1066 0.82
1067 0.82
1068 0.84
1069 0.86
1070 0.85
1071 0.81
1072 0.77
1073 0.71
1074 0.63
1075 0.54