Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R945

Protein Details
Accession C4R945    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-413VDQLKKITKKPIKVNFQIPYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036168  AP2_Mu_C_sf  
IPR001392  Clathrin_mu  
IPR018240  Clathrin_mu_CS  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR028565  MHD  
Gene Ontology GO:0030121  C:AP-1 adaptor complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005768  C:endosome  
GO:0099638  P:endosome to plasma membrane protein transport  
GO:0006895  P:Golgi to endosome transport  
GO:0043001  P:Golgi to plasma membrane protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG ppa:PAS_chr4_0852  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00928  Adap_comp_sub  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00990  CLAT_ADAPTOR_M_1  
PS00991  CLAT_ADAPTOR_M_2  
PS51072  MHD  
CDD cd09250  AP-1_Mu1_Cterm  
Amino Acid Sequences MASSIHFLDIKGKPLLTKDYKGDIPVTALERFPLLVLQGSSDEYNTKPVFQDRGVSYAYLIHNDLYVLALARGNVNIYSIMVFLRRLIEVLESYVKRLVEESIRDNFSIIYELLDEMVDFGTPQISDVQMLKQYIKVKHFKLEELINPIKALDNDQKVKVPMALTNSISWRSEGISYKKNEAFLDVVEAINMTLTTTGQVITSEILGKIKIRSQLSGMPDLRLGINEKFLNAGLDRLNGGPDNVTNDFGLEDIKFHQCVRLAKFENDKIITFIPPDGEFELMTYRILSPPNLVPLILVDYKLQNHSNTRLELFVRLKTNFKRRLTCTNLELLIPCPDDIDSPSFQTSATTSKCKIKYVPEKSAILWRFKSIPGGKDYSMIAELNLPSVKLQENVDQLKKITKKPIKVNFQIPYFTTSGLQVRYLRINEPKLQYKSYPWVRYVTQSGDDYIIRMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.4
3 0.38
4 0.42
5 0.42
6 0.45
7 0.47
8 0.47
9 0.45
10 0.36
11 0.32
12 0.31
13 0.29
14 0.25
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.16
20 0.12
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.13
31 0.21
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.25
36 0.29
37 0.28
38 0.35
39 0.29
40 0.32
41 0.31
42 0.29
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.09
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.2
79 0.18
80 0.19
81 0.22
82 0.22
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.22
88 0.25
89 0.28
90 0.3
91 0.29
92 0.29
93 0.26
94 0.22
95 0.2
96 0.15
97 0.1
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.18
120 0.24
121 0.28
122 0.34
123 0.39
124 0.38
125 0.44
126 0.45
127 0.43
128 0.4
129 0.4
130 0.36
131 0.38
132 0.37
133 0.3
134 0.28
135 0.27
136 0.25
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.24
141 0.27
142 0.28
143 0.3
144 0.3
145 0.3
146 0.27
147 0.21
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.19
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.2
156 0.18
157 0.14
158 0.12
159 0.15
160 0.19
161 0.22
162 0.27
163 0.29
164 0.34
165 0.35
166 0.36
167 0.32
168 0.29
169 0.25
170 0.18
171 0.2
172 0.14
173 0.13
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.18
201 0.22
202 0.24
203 0.3
204 0.28
205 0.23
206 0.22
207 0.22
208 0.2
209 0.16
210 0.16
211 0.09
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.09
219 0.1
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.14
245 0.19
246 0.22
247 0.28
248 0.3
249 0.33
250 0.39
251 0.39
252 0.4
253 0.37
254 0.34
255 0.27
256 0.25
257 0.22
258 0.17
259 0.15
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.16
289 0.18
290 0.16
291 0.19
292 0.24
293 0.27
294 0.27
295 0.27
296 0.26
297 0.25
298 0.28
299 0.27
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.33
304 0.38
305 0.47
306 0.5
307 0.54
308 0.57
309 0.58
310 0.66
311 0.68
312 0.65
313 0.58
314 0.54
315 0.49
316 0.42
317 0.38
318 0.3
319 0.25
320 0.21
321 0.18
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.17
335 0.2
336 0.22
337 0.24
338 0.33
339 0.35
340 0.38
341 0.41
342 0.45
343 0.52
344 0.57
345 0.63
346 0.6
347 0.6
348 0.58
349 0.63
350 0.57
351 0.52
352 0.45
353 0.38
354 0.35
355 0.34
356 0.41
357 0.37
358 0.37
359 0.36
360 0.4
361 0.37
362 0.37
363 0.36
364 0.29
365 0.27
366 0.22
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.14
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.13
377 0.16
378 0.18
379 0.26
380 0.32
381 0.36
382 0.35
383 0.35
384 0.42
385 0.45
386 0.46
387 0.49
388 0.5
389 0.56
390 0.64
391 0.73
392 0.75
393 0.77
394 0.8
395 0.76
396 0.72
397 0.67
398 0.58
399 0.53
400 0.44
401 0.37
402 0.29
403 0.25
404 0.26
405 0.24
406 0.27
407 0.24
408 0.26
409 0.32
410 0.33
411 0.36
412 0.4
413 0.44
414 0.48
415 0.53
416 0.59
417 0.57
418 0.6
419 0.57
420 0.56
421 0.6
422 0.63
423 0.61
424 0.54
425 0.54
426 0.52
427 0.55
428 0.54
429 0.48
430 0.44
431 0.39
432 0.38
433 0.37
434 0.34