Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3K529

Protein Details
Accession E3K529    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
KEGG pgr:PGTG_05665  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKVVEQVIEDVPAQNAVDGGTEEVPIDMSQRNPNGMEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKKPPETEAEMMIEVFKYTERVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKVKEEEKQALIEEYKQQGKELPEDYKTDKKAWDSNAITPGTPFMTLLTESLRYWIVYKMNTDKGWSQIQVILSDASVPGEGEHKIMDFVRRQRTQPSYDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFADQKKGKGCYTCGQLGHHSSQCQGKPKEKVDEHDTKQKPVERKPFIFLDVGILREYLAIELNIGGLPFPFDIERAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKTNLGRMGGFLTDCGALNLKRTEIILEGLASREDEIFRRRREAEERQDQSAKRRKIDDDNKQVHIKSSTTNQPLPTSNLGNLSTTLNVPLKPTFLPEDVRQTTQSAIPGLGNASLSMMSNADVVKNRFAIRTANMDAAAMLKAELSGTLELPTSAPAGDDATKMTMESTDVALAESQVPLEANTETPGVTQAESDAPTGTQNPSNESHSAIDTSQGKPSNAENDESAATTNGKDSCQDSAAGPPDGETESTVKPPTPVQKRKADELESADPAIGPIDDSVVLSEDEDEDEAPGDVSVFVPGEPSRPAPLKMLGNNMVEQDDTVKLWEPGYRERYFRQKFGIELNDEVEKRKIVKHYVEGLAWVLAYYYQGCQSWQWFYPYHYSPFASDFTNLEEFEIKFNLGQPFKPYEQLMGVFPAASRCHIPDVYHDLMMNDDSPIKDFYPEEFEIDMNGKKMLWQGVALLPFIEQDRLLNSMKDCEDRLAPEDKIRNEPGHVVMFCGEAHPQYENFCKIYQKRDNKEAVTLDPAHANGVFGSALPDPDCIPGSTFYSPLPTVGLPDISNDKSIFARFFVPSQLVPHRSLLLSGVALERPILNNHDRDLTRRGGNQAHGGNQHYGSDGFHQQRRDFGDGPGIMTHYHTNNSNFNGGGGGYWNSNRGSGNHSQYQQPHHSTHAHDYRNSGPPAGNHRGYSNGPAHHHHNGYPQGGHHSQRAPYGLPTSFGSTNARGGGGYRPPHSAPQSSYYNAPMNHNNGGYVPPVRYGGTGVGLPQRAPPAPFADPYPPPTQSSTHYSRAGYRPPGITPAFTRTVPNYPPRAAQQPSRPPYDHSSGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.7
5 0.66
6 0.61
7 0.58
8 0.51
9 0.43
10 0.38
11 0.3
12 0.24
13 0.2
14 0.15
15 0.11
16 0.1
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.21
31 0.24
32 0.27
33 0.27
34 0.28
35 0.3
36 0.29
37 0.29
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.22
43 0.17
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.13
53 0.17
54 0.23
55 0.25
56 0.33
57 0.42
58 0.49
59 0.57
60 0.56
61 0.57
62 0.57
63 0.6
64 0.53
65 0.47
66 0.42
67 0.34
68 0.32
69 0.27
70 0.2
71 0.15
72 0.13
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.2
80 0.28
81 0.38
82 0.45
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.45
87 0.44
88 0.4
89 0.33
90 0.29
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.21
95 0.21
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.13
100 0.2
101 0.26
102 0.37
103 0.46
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.8
108 0.81
109 0.78
110 0.74
111 0.76
112 0.75
113 0.73
114 0.75
115 0.7
116 0.66
117 0.67
118 0.61
119 0.53
120 0.52
121 0.47
122 0.38
123 0.36
124 0.33
125 0.31
126 0.31
127 0.3
128 0.28
129 0.3
130 0.34
131 0.32
132 0.32
133 0.33
134 0.34
135 0.37
136 0.35
137 0.35
138 0.32
139 0.36
140 0.41
141 0.45
142 0.45
143 0.43
144 0.42
145 0.42
146 0.46
147 0.46
148 0.51
149 0.46
150 0.48
151 0.51
152 0.48
153 0.43
154 0.37
155 0.34
156 0.25
157 0.21
158 0.16
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.24
174 0.29
175 0.35
176 0.35
177 0.37
178 0.35
179 0.36
180 0.38
181 0.34
182 0.29
183 0.26
184 0.27
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.14
189 0.14
190 0.12
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.37
206 0.41
207 0.42
208 0.49
209 0.55
210 0.56
211 0.58
212 0.6
213 0.59
214 0.64
215 0.66
216 0.61
217 0.61
218 0.54
219 0.47
220 0.39
221 0.31
222 0.23
223 0.24
224 0.21
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.04
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.17
241 0.17
242 0.21
243 0.25
244 0.27
245 0.27
246 0.29
247 0.28
248 0.35
249 0.36
250 0.36
251 0.33
252 0.34
253 0.35
254 0.36
255 0.35
256 0.3
257 0.33
258 0.35
259 0.38
260 0.4
261 0.38
262 0.38
263 0.4
264 0.4
265 0.41
266 0.38
267 0.33
268 0.3
269 0.35
270 0.36
271 0.41
272 0.42
273 0.44
274 0.49
275 0.54
276 0.61
277 0.58
278 0.6
279 0.59
280 0.64
281 0.61
282 0.64
283 0.6
284 0.54
285 0.56
286 0.56
287 0.55
288 0.55
289 0.6
290 0.58
291 0.59
292 0.6
293 0.57
294 0.53
295 0.47
296 0.37
297 0.33
298 0.25
299 0.23
300 0.19
301 0.16
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.07
306 0.07
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.08
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.16
361 0.18
362 0.21
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.25
367 0.26
368 0.2
369 0.18
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.08
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.12
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.16
396 0.22
397 0.24
398 0.29
399 0.3
400 0.34
401 0.42
402 0.49
403 0.52
404 0.56
405 0.57
406 0.57
407 0.61
408 0.57
409 0.59
410 0.59
411 0.54
412 0.47
413 0.48
414 0.48
415 0.53
416 0.61
417 0.62
418 0.63
419 0.64
420 0.65
421 0.63
422 0.59
423 0.51
424 0.43
425 0.34
426 0.25
427 0.25
428 0.29
429 0.31
430 0.33
431 0.32
432 0.33
433 0.34
434 0.35
435 0.33
436 0.26
437 0.22
438 0.22
439 0.22
440 0.19
441 0.18
442 0.15
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.13
449 0.12
450 0.13
451 0.12
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.18
456 0.18
457 0.26
458 0.26
459 0.28
460 0.27
461 0.25
462 0.24
463 0.22
464 0.22
465 0.14
466 0.12
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.09
483 0.11
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.14
488 0.15
489 0.16
490 0.15
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.12
499 0.07
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.04
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.05
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.11
561 0.1
562 0.13
563 0.15
564 0.17
565 0.17
566 0.18
567 0.17
568 0.15
569 0.15
570 0.12
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.16
575 0.17
576 0.17
577 0.17
578 0.18
579 0.21
580 0.2
581 0.2
582 0.16
583 0.16
584 0.16
585 0.15
586 0.14
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.1
596 0.1
597 0.11
598 0.09
599 0.12
600 0.14
601 0.13
602 0.12
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.08
608 0.09
609 0.09
610 0.11
611 0.11
612 0.1
613 0.11
614 0.14
615 0.22
616 0.29
617 0.37
618 0.41
619 0.5
620 0.52
621 0.57
622 0.59
623 0.53
624 0.45
625 0.43
626 0.4
627 0.32
628 0.29
629 0.24
630 0.19
631 0.16
632 0.13
633 0.07
634 0.04
635 0.03
636 0.03
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.04
643 0.05
644 0.04
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.07
663 0.08
664 0.11
665 0.12
666 0.14
667 0.14
668 0.18
669 0.2
670 0.21
671 0.25
672 0.26
673 0.25
674 0.25
675 0.24
676 0.2
677 0.16
678 0.14
679 0.12
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.08
686 0.1
687 0.11
688 0.17
689 0.23
690 0.25
691 0.26
692 0.29
693 0.4
694 0.41
695 0.41
696 0.39
697 0.34
698 0.33
699 0.36
700 0.38
701 0.29
702 0.27
703 0.26
704 0.25
705 0.24
706 0.24
707 0.19
708 0.15
709 0.15
710 0.18
711 0.2
712 0.21
713 0.24
714 0.28
715 0.33
716 0.34
717 0.33
718 0.3
719 0.27
720 0.22
721 0.18
722 0.12
723 0.06
724 0.04
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.08
732 0.1
733 0.13
734 0.14
735 0.17
736 0.16
737 0.18
738 0.24
739 0.26
740 0.28
741 0.26
742 0.25
743 0.23
744 0.25
745 0.24
746 0.19
747 0.17
748 0.14
749 0.16
750 0.17
751 0.16
752 0.14
753 0.15
754 0.14
755 0.14
756 0.14
757 0.11
758 0.09
759 0.13
760 0.18
761 0.17
762 0.17
763 0.19
764 0.24
765 0.25
766 0.27
767 0.24
768 0.2
769 0.2
770 0.21
771 0.18
772 0.15
773 0.14
774 0.11
775 0.11
776 0.12
777 0.11
778 0.1
779 0.11
780 0.1
781 0.13
782 0.14
783 0.15
784 0.17
785 0.24
786 0.25
787 0.24
788 0.23
789 0.2
790 0.2
791 0.2
792 0.16
793 0.09
794 0.08
795 0.07
796 0.09
797 0.1
798 0.1
799 0.11
800 0.11
801 0.12
802 0.18
803 0.18
804 0.19
805 0.18
806 0.17
807 0.17
808 0.19
809 0.18
810 0.12
811 0.12
812 0.1
813 0.1
814 0.12
815 0.13
816 0.11
817 0.1
818 0.12
819 0.14
820 0.16
821 0.15
822 0.12
823 0.1
824 0.11
825 0.11
826 0.1
827 0.06
828 0.06
829 0.07
830 0.11
831 0.12
832 0.13
833 0.13
834 0.16
835 0.18
836 0.19
837 0.19
838 0.17
839 0.18
840 0.18
841 0.21
842 0.21
843 0.21
844 0.24
845 0.29
846 0.3
847 0.34
848 0.35
849 0.33
850 0.3
851 0.31
852 0.29
853 0.28
854 0.26
855 0.21
856 0.18
857 0.18
858 0.17
859 0.15
860 0.13
861 0.08
862 0.09
863 0.1
864 0.1
865 0.12
866 0.16
867 0.18
868 0.19
869 0.21
870 0.27
871 0.29
872 0.39
873 0.46
874 0.52
875 0.56
876 0.62
877 0.67
878 0.61
879 0.63
880 0.56
881 0.48
882 0.43
883 0.38
884 0.3
885 0.25
886 0.24
887 0.19
888 0.16
889 0.15
890 0.09
891 0.08
892 0.07
893 0.06
894 0.08
895 0.07
896 0.08
897 0.09
898 0.09
899 0.09
900 0.11
901 0.12
902 0.1
903 0.11
904 0.12
905 0.15
906 0.16
907 0.16
908 0.15
909 0.17
910 0.17
911 0.16
912 0.16
913 0.12
914 0.13
915 0.14
916 0.15
917 0.11
918 0.13
919 0.17
920 0.16
921 0.19
922 0.17
923 0.17
924 0.17
925 0.19
926 0.17
927 0.14
928 0.17
929 0.16
930 0.17
931 0.18
932 0.19
933 0.18
934 0.22
935 0.28
936 0.28
937 0.29
938 0.29
939 0.29
940 0.27
941 0.26
942 0.22
943 0.16
944 0.13
945 0.12
946 0.12
947 0.1
948 0.1
949 0.1
950 0.09
951 0.09
952 0.11
953 0.15
954 0.17
955 0.19
956 0.21
957 0.27
958 0.27
959 0.3
960 0.33
961 0.33
962 0.34
963 0.35
964 0.38
965 0.36
966 0.38
967 0.41
968 0.38
969 0.38
970 0.37
971 0.37
972 0.35
973 0.31
974 0.28
975 0.23
976 0.2
977 0.17
978 0.18
979 0.22
980 0.26
981 0.29
982 0.33
983 0.33
984 0.37
985 0.42
986 0.44
987 0.38
988 0.33
989 0.37
990 0.33
991 0.34
992 0.3
993 0.25
994 0.19
995 0.2
996 0.22
997 0.15
998 0.17
999 0.2
1000 0.23
1001 0.27
1002 0.29
1003 0.29
1004 0.26
1005 0.24
1006 0.22
1007 0.18
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.1
1011 0.1
1012 0.11
1013 0.13
1014 0.13
1015 0.15
1016 0.16
1017 0.15
1018 0.21
1019 0.26
1020 0.33
1021 0.37
1022 0.38
1023 0.42
1024 0.46
1025 0.52
1026 0.54
1027 0.51
1028 0.46
1029 0.44
1030 0.47
1031 0.45
1032 0.51
1033 0.52
1034 0.49
1035 0.45
1036 0.48
1037 0.49
1038 0.53
1039 0.5
1040 0.41
1041 0.35
1042 0.35
1043 0.42
1044 0.46
1045 0.43
1046 0.36
1047 0.36
1048 0.39
1049 0.38
1050 0.4
1051 0.37
1052 0.34
1053 0.35
1054 0.38
1055 0.43
1056 0.45
1057 0.46
1058 0.41
1059 0.43
1060 0.44
1061 0.43
1062 0.41
1063 0.36
1064 0.37
1065 0.39
1066 0.4
1067 0.37
1068 0.36
1069 0.35
1070 0.38
1071 0.39
1072 0.33
1073 0.31
1074 0.34
1075 0.29
1076 0.27
1077 0.26
1078 0.28
1079 0.26
1080 0.26
1081 0.27
1082 0.24
1083 0.26
1084 0.25
1085 0.23
1086 0.18
1087 0.18
1088 0.22
1089 0.25
1090 0.28
1091 0.28
1092 0.31
1093 0.33
1094 0.4
1095 0.43
1096 0.42
1097 0.39
1098 0.41
1099 0.44
1100 0.41
1101 0.42
1102 0.4
1103 0.41
1104 0.38
1105 0.4
1106 0.39
1107 0.39
1108 0.41
1109 0.39
1110 0.35
1111 0.29
1112 0.29
1113 0.27
1114 0.23
1115 0.19
1116 0.17
1117 0.18
1118 0.18
1119 0.18
1120 0.18
1121 0.17
1122 0.16
1123 0.15
1124 0.16
1125 0.2
1126 0.21
1127 0.2
1128 0.22
1129 0.25
1130 0.25
1131 0.26
1132 0.26
1133 0.26
1134 0.28
1135 0.3
1136 0.31
1137 0.33
1138 0.34
1139 0.38
1140 0.41
1141 0.38
1142 0.37
1143 0.39
1144 0.38
1145 0.36
1146 0.4
1147 0.42
1148 0.42
1149 0.44
1150 0.44
1151 0.48
1152 0.52
1153 0.55
1154 0.53
1155 0.52
1156 0.49
1157 0.47
1158 0.52
1159 0.46
1160 0.42
1161 0.38
1162 0.38
1163 0.36
1164 0.34
1165 0.36
1166 0.34
1167 0.4
1168 0.42
1169 0.47
1170 0.47
1171 0.46
1172 0.5
1173 0.52
1174 0.55
1175 0.53
1176 0.55
1177 0.57
1178 0.62
1179 0.65
1180 0.68
1181 0.64
1182 0.61
1183 0.64