Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R7J6

Protein Details
Accession C4R7J6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-244KSVKRPSNWKTKPCANWTKFGKCRYGKRCCFKHGDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr4_0329  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTWGQTLSVQEPLFAPTPLHFKKSRQDSLNSDFSYPVSLSPSSSTSSISEDFLPIDKDMLNLIPDLWSGETDDPLVSTQKTQNPPQLCTATSTWQQRPSSWYSHTPSQTQLASFNTTPLTEENLFLLSDSTIRQPQVVHVEQKELERGPQQPLSNTQSHSHTSQTKSVDSNPTLNTGLYKTELCDQFNQKGHCPYGTKCQFAHGTHELKSVKRPSNWKTKPCANWTKFGKCRYGKRCCFKHGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.15
4 0.24
5 0.26
6 0.31
7 0.31
8 0.34
9 0.43
10 0.52
11 0.59
12 0.55
13 0.59
14 0.61
15 0.65
16 0.69
17 0.61
18 0.52
19 0.44
20 0.38
21 0.34
22 0.27
23 0.21
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.15
33 0.18
34 0.18
35 0.18
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.12
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.08
64 0.1
65 0.15
66 0.21
67 0.26
68 0.29
69 0.35
70 0.37
71 0.39
72 0.41
73 0.39
74 0.32
75 0.31
76 0.3
77 0.27
78 0.29
79 0.33
80 0.31
81 0.37
82 0.37
83 0.34
84 0.37
85 0.36
86 0.35
87 0.32
88 0.35
89 0.32
90 0.38
91 0.39
92 0.36
93 0.34
94 0.32
95 0.3
96 0.24
97 0.22
98 0.17
99 0.18
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.11
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.18
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.18
135 0.19
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.27
140 0.3
141 0.3
142 0.3
143 0.28
144 0.27
145 0.29
146 0.29
147 0.28
148 0.28
149 0.28
150 0.32
151 0.32
152 0.31
153 0.3
154 0.33
155 0.35
156 0.32
157 0.33
158 0.29
159 0.29
160 0.28
161 0.26
162 0.23
163 0.17
164 0.17
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.18
169 0.21
170 0.22
171 0.27
172 0.3
173 0.35
174 0.41
175 0.43
176 0.4
177 0.43
178 0.43
179 0.4
180 0.39
181 0.35
182 0.4
183 0.42
184 0.42
185 0.36
186 0.4
187 0.43
188 0.41
189 0.46
190 0.42
191 0.4
192 0.38
193 0.45
194 0.41
195 0.37
196 0.44
197 0.45
198 0.45
199 0.48
200 0.56
201 0.56
202 0.66
203 0.73
204 0.73
205 0.73
206 0.75
207 0.77
208 0.78
209 0.82
210 0.74
211 0.75
212 0.75
213 0.77
214 0.74
215 0.71
216 0.71
217 0.68
218 0.76
219 0.76
220 0.79
221 0.79
222 0.82
223 0.85
224 0.83