Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JWE9

Protein Details
Accession E3JWE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-193IGQPKVRRGGRSRSPPKKPLVNRIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-187PKVRRGGRSRSPPKKP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR008111  RNA-bd_8  
IPR000504  RRM_dom  
IPR033744  RRM_RBM8  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pgr:PGTG_02815  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12324  RRM_RBM8  
Amino Acid Sequences MDSNADKNKESTEDMMAIDESPINQEVAVKRKGRGFKAGDATEPMEVDASAGQVIYERLDDEHQKEKEQTAGNAARSVEGWVVIVQGVHEEATEEDLMEKFSDYGHVMNLAMPLDRRTGYVKGYALVEYETRKEAEMAIKSGTDSKLLDQTLKCDFAFVRAPTGASAPIGQPKVRRGGRSRSPPKKPLVNRID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.21
4 0.18
5 0.16
6 0.13
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.12
13 0.16
14 0.22
15 0.29
16 0.29
17 0.31
18 0.38
19 0.44
20 0.44
21 0.49
22 0.47
23 0.48
24 0.54
25 0.53
26 0.48
27 0.44
28 0.42
29 0.33
30 0.29
31 0.21
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.09
47 0.12
48 0.15
49 0.23
50 0.24
51 0.26
52 0.26
53 0.26
54 0.3
55 0.29
56 0.26
57 0.25
58 0.28
59 0.26
60 0.27
61 0.26
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.12
66 0.08
67 0.08
68 0.05
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.2
129 0.18
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.17
134 0.18
135 0.22
136 0.19
137 0.22
138 0.24
139 0.26
140 0.24
141 0.21
142 0.2
143 0.2
144 0.26
145 0.24
146 0.24
147 0.22
148 0.23
149 0.22
150 0.23
151 0.19
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.18
156 0.2
157 0.21
158 0.24
159 0.28
160 0.37
161 0.4
162 0.46
163 0.46
164 0.54
165 0.62
166 0.7
167 0.77
168 0.77
169 0.82
170 0.83
171 0.85
172 0.85
173 0.83