Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KM12

Protein Details
Accession E3KM12    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-44NKVTRSKVSKSLKRDKAQAKLTRRVQQKKAEAAHydrophilic
423-450TTNPTCQPTTSKKRKQKSKTSAGIEEKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-35KSLKRDKAQAKLTRR
436-437RK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
KEGG pgr:PGTG_11530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MVVINSTSQIANKVTRSKVSKSLKRDKAQAKLTRRVQQKKAEAADPSLREARLKANVPRTIERTKEWLGDDDDDERMLPVKVEYSAQTEEGADGAEPGLENVHFDMGRLHDLFSPYMNEEIYPSAPADEPPNPEEEPHPEQGTSQPEPAAQPEQQQPRTLITTSPRPSEFTLAFIHELGGLFGGSRNCDIIPRKTKRFELTRVCRWACERGYGSMVVIGEAHGGRNRSGPTHMTISRLPYGPTASFRMTSIVPSKAIPGHAKPTSHFPELVLSNFSTPLGLSIGTLLQSVFPPLPELEGRQVVSMQNQRDFVFFRRYRYVFAEREKVFLNKGDETIRTRLQEIGPRFTLKVRWLKRGTLAGGLNQNVLPGQIGKERKLGELERQQEASRAGRRRQERSKDADSAASKALTTDPTALSTSTSETTNPTCQPTTSKKRKQKSKTSAGIEEKFLRGERSDSEDPETSEQPRKSGGLNEFMKNVKQRACQGRNTSRELEWEWKPNMGVSRRKFFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.48
4 0.5
5 0.56
6 0.62
7 0.65
8 0.68
9 0.75
10 0.78
11 0.79
12 0.83
13 0.82
14 0.8
15 0.82
16 0.81
17 0.79
18 0.79
19 0.81
20 0.8
21 0.82
22 0.82
23 0.8
24 0.81
25 0.8
26 0.79
27 0.76
28 0.72
29 0.64
30 0.61
31 0.6
32 0.52
33 0.48
34 0.43
35 0.38
36 0.34
37 0.33
38 0.33
39 0.33
40 0.38
41 0.4
42 0.45
43 0.5
44 0.54
45 0.58
46 0.59
47 0.58
48 0.55
49 0.5
50 0.48
51 0.47
52 0.45
53 0.42
54 0.4
55 0.36
56 0.36
57 0.35
58 0.3
59 0.27
60 0.23
61 0.21
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.18
99 0.19
100 0.17
101 0.18
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.15
115 0.16
116 0.19
117 0.2
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.24
122 0.26
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.24
127 0.25
128 0.29
129 0.33
130 0.28
131 0.24
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.24
136 0.23
137 0.17
138 0.2
139 0.27
140 0.35
141 0.36
142 0.37
143 0.36
144 0.35
145 0.37
146 0.32
147 0.28
148 0.24
149 0.31
150 0.32
151 0.35
152 0.32
153 0.32
154 0.33
155 0.34
156 0.3
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.2
161 0.17
162 0.16
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.12
176 0.16
177 0.23
178 0.33
179 0.39
180 0.46
181 0.49
182 0.54
183 0.57
184 0.6
185 0.6
186 0.6
187 0.62
188 0.64
189 0.68
190 0.64
191 0.58
192 0.54
193 0.52
194 0.42
195 0.39
196 0.32
197 0.26
198 0.27
199 0.25
200 0.23
201 0.17
202 0.16
203 0.1
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.21
222 0.24
223 0.24
224 0.23
225 0.21
226 0.17
227 0.18
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.13
236 0.15
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.26
251 0.29
252 0.28
253 0.27
254 0.22
255 0.23
256 0.24
257 0.24
258 0.18
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.08
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.12
290 0.17
291 0.2
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.23
297 0.24
298 0.22
299 0.28
300 0.28
301 0.3
302 0.36
303 0.36
304 0.38
305 0.42
306 0.46
307 0.4
308 0.43
309 0.48
310 0.41
311 0.42
312 0.4
313 0.35
314 0.3
315 0.28
316 0.27
317 0.19
318 0.21
319 0.21
320 0.22
321 0.25
322 0.28
323 0.27
324 0.24
325 0.24
326 0.25
327 0.26
328 0.31
329 0.3
330 0.31
331 0.3
332 0.31
333 0.3
334 0.29
335 0.3
336 0.3
337 0.36
338 0.35
339 0.42
340 0.44
341 0.45
342 0.48
343 0.5
344 0.45
345 0.41
346 0.37
347 0.32
348 0.33
349 0.31
350 0.27
351 0.22
352 0.2
353 0.14
354 0.13
355 0.1
356 0.07
357 0.08
358 0.13
359 0.16
360 0.18
361 0.23
362 0.24
363 0.25
364 0.29
365 0.29
366 0.32
367 0.38
368 0.4
369 0.39
370 0.39
371 0.38
372 0.36
373 0.37
374 0.35
375 0.34
376 0.37
377 0.39
378 0.45
379 0.52
380 0.59
381 0.66
382 0.7
383 0.7
384 0.71
385 0.72
386 0.7
387 0.64
388 0.62
389 0.53
390 0.46
391 0.4
392 0.32
393 0.25
394 0.2
395 0.2
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.15
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.15
410 0.19
411 0.23
412 0.24
413 0.26
414 0.26
415 0.26
416 0.33
417 0.4
418 0.48
419 0.54
420 0.62
421 0.68
422 0.77
423 0.87
424 0.9
425 0.91
426 0.91
427 0.91
428 0.89
429 0.87
430 0.86
431 0.84
432 0.77
433 0.71
434 0.64
435 0.54
436 0.47
437 0.4
438 0.33
439 0.26
440 0.25
441 0.23
442 0.28
443 0.31
444 0.31
445 0.35
446 0.35
447 0.37
448 0.38
449 0.38
450 0.34
451 0.39
452 0.38
453 0.34
454 0.34
455 0.33
456 0.31
457 0.36
458 0.35
459 0.37
460 0.4
461 0.41
462 0.42
463 0.43
464 0.46
465 0.43
466 0.45
467 0.42
468 0.43
469 0.5
470 0.58
471 0.62
472 0.66
473 0.71
474 0.75
475 0.75
476 0.76
477 0.71
478 0.61
479 0.6
480 0.56
481 0.53
482 0.49
483 0.5
484 0.45
485 0.44
486 0.43
487 0.41
488 0.44
489 0.45
490 0.49
491 0.48