Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KSE0

Protein Details
Accession E3KSE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-311SSNLDNSNPENRKKKKSKKNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-311RKKKKSKKNK
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:0071051  P:polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing  
GO:0016075  P:rRNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
KEGG pgr:PGTG_12810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11372  RNase_PH_RRP46  
Amino Acid Sequences MSIMRSDSRTEADIRSLTMRMSILSRSDGSAQFSFGDLKALGAVTGPAEVRIRDEKPTEAFVDVIVVPVCGLPGPPTKSLAHSIKSFFTPLILLKKYPRSLIQINLQTLSKPSDRWTNGFTTGTLEPSATVPLFEETQSVSEKAALINAASLALLDAGVGMRGCAFAVGLAILPPSAVSPNHNNPQALESDLIVLDPSPTEESSAKSLHLVGFHFGHGFNTTTDSGVEIGTVALCESNGSFSYDQLQTVLKLASLATQQILAFVRQSCETVYDHEDGINSASQAAVGQPTSSNLDNSNPENRKKKKSKKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.24
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.16
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.23
15 0.23
16 0.27
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.17
23 0.18
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.13
38 0.19
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.27
43 0.29
44 0.32
45 0.3
46 0.25
47 0.23
48 0.19
49 0.19
50 0.15
51 0.14
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.05
58 0.05
59 0.07
60 0.13
61 0.17
62 0.18
63 0.22
64 0.23
65 0.25
66 0.33
67 0.34
68 0.31
69 0.31
70 0.32
71 0.31
72 0.31
73 0.29
74 0.22
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.24
82 0.31
83 0.32
84 0.33
85 0.33
86 0.32
87 0.34
88 0.37
89 0.4
90 0.39
91 0.38
92 0.37
93 0.35
94 0.29
95 0.27
96 0.26
97 0.19
98 0.14
99 0.15
100 0.23
101 0.24
102 0.26
103 0.28
104 0.27
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.22
109 0.2
110 0.19
111 0.16
112 0.13
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.07
166 0.13
167 0.19
168 0.24
169 0.27
170 0.26
171 0.26
172 0.27
173 0.25
174 0.21
175 0.16
176 0.11
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.06
225 0.06
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.09
244 0.11
245 0.1
246 0.13
247 0.14
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.18
264 0.19
265 0.16
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.15
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.21
282 0.25
283 0.28
284 0.36
285 0.39
286 0.47
287 0.56
288 0.62
289 0.69
290 0.76
291 0.83