Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KRF1

Protein Details
Accession E3KRF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-183YFAIKADRKKRSTKKEKASEAARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-177RKKRSTKKEK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045114  Csn12-like  
Gene Ontology GO:0070390  C:transcription export complex 2  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0000973  P:post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_12617  -  
Amino Acid Sequences MRALPSQKRKQGSSSLELEELTSEQLVERFADHLRHQQDSLSELVRPLDRSLIRLLKSKLSSNRKDDLDSLVQRQLGENRTLADFLSNYFTYIMLVQFEDEPAVINPGFHHYQKQTDPIIDHDNNFDLLLNAYNPASNIFRRPDAAYFTRSIQHLSHGLVYFAIKADRKKRSTKKEKASEAARQMTTTLGVACIDRSPEEPSKRRAAFSLANGLFKIYFFLETHYPKAELVTFHYYLGRLALYQRRLHKARESLKKAFDLCKTDTSLPLGILPRPILLEQFQLQNEFHEVVGSLRTGNWPGVVNGLEKNRDWFRYKGIYILLREKLEVICWRNFFVIMAGLKNGNPGMRLSLTQSVEAARKVFMEPSIDEDDIVCMASSLIDQGYLRAYIKLGEMIVFGSVLPQISTVGEHMNEGGPEPLPAFSGKAIPMSIQPSSDSDAPVKSYRRPYSIRGAKKISHTKRFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.55
3 0.5
4 0.47
5 0.4
6 0.32
7 0.25
8 0.19
9 0.13
10 0.1
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.18
19 0.2
20 0.28
21 0.31
22 0.34
23 0.33
24 0.34
25 0.33
26 0.3
27 0.31
28 0.24
29 0.2
30 0.18
31 0.21
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.24
36 0.23
37 0.25
38 0.32
39 0.35
40 0.35
41 0.41
42 0.43
43 0.43
44 0.45
45 0.51
46 0.53
47 0.57
48 0.63
49 0.62
50 0.67
51 0.61
52 0.61
53 0.55
54 0.52
55 0.5
56 0.46
57 0.43
58 0.39
59 0.38
60 0.35
61 0.36
62 0.35
63 0.3
64 0.29
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.21
70 0.17
71 0.13
72 0.12
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.14
80 0.13
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.14
95 0.17
96 0.16
97 0.22
98 0.21
99 0.27
100 0.3
101 0.35
102 0.32
103 0.32
104 0.32
105 0.31
106 0.37
107 0.33
108 0.31
109 0.27
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.19
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.21
129 0.23
130 0.23
131 0.27
132 0.28
133 0.27
134 0.26
135 0.27
136 0.28
137 0.26
138 0.26
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.18
143 0.21
144 0.18
145 0.17
146 0.15
147 0.15
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.11
152 0.16
153 0.24
154 0.33
155 0.37
156 0.47
157 0.57
158 0.65
159 0.74
160 0.79
161 0.82
162 0.83
163 0.84
164 0.8
165 0.77
166 0.73
167 0.68
168 0.63
169 0.53
170 0.43
171 0.37
172 0.31
173 0.25
174 0.18
175 0.11
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.13
185 0.19
186 0.25
187 0.29
188 0.33
189 0.41
190 0.42
191 0.41
192 0.37
193 0.36
194 0.33
195 0.3
196 0.36
197 0.28
198 0.28
199 0.27
200 0.26
201 0.21
202 0.17
203 0.16
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.13
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.15
214 0.16
215 0.15
216 0.11
217 0.14
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.1
226 0.06
227 0.08
228 0.13
229 0.16
230 0.2
231 0.25
232 0.31
233 0.34
234 0.36
235 0.39
236 0.43
237 0.48
238 0.55
239 0.57
240 0.55
241 0.56
242 0.57
243 0.53
244 0.49
245 0.44
246 0.39
247 0.34
248 0.32
249 0.33
250 0.3
251 0.28
252 0.26
253 0.23
254 0.18
255 0.18
256 0.16
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.14
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.12
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.21
296 0.22
297 0.25
298 0.28
299 0.26
300 0.29
301 0.34
302 0.34
303 0.33
304 0.34
305 0.34
306 0.33
307 0.39
308 0.36
309 0.3
310 0.3
311 0.28
312 0.24
313 0.23
314 0.26
315 0.23
316 0.24
317 0.25
318 0.26
319 0.25
320 0.25
321 0.22
322 0.17
323 0.17
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.21
339 0.22
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.22
344 0.22
345 0.19
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.14
353 0.19
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.2
358 0.19
359 0.16
360 0.16
361 0.1
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.1
411 0.13
412 0.14
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.18
417 0.21
418 0.21
419 0.18
420 0.19
421 0.2
422 0.24
423 0.25
424 0.24
425 0.22
426 0.23
427 0.26
428 0.31
429 0.32
430 0.35
431 0.44
432 0.48
433 0.53
434 0.56
435 0.57
436 0.62
437 0.69
438 0.71
439 0.7
440 0.7
441 0.68
442 0.74
443 0.79
444 0.78