Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KU28

Protein Details
Accession E3KU28    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-299FVNPKQYQRIIKRRLARARLHydrophilic
313-336LHESRHKHAVRRPRGPRGRFLTKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-298KRRLARAR
304-304R
306-310SRERQ
313-331LHESRHKHAVRRPRGPRGR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_14518  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MMSTNNNNHYRGWTTTSVGEENEELEDLLNHLSSAAGDRGLGEGSGLDDETMPAFDDILQPASSSTARDRAGLTALLPFDYPPDGHEHDDDDDDDEDDEDDEDDDEDVDEERKAAVQAAMRGLHTPFTHLSRSERAQTLIEEDGEEEDEQSDEEQVKGGKEEEEEGWEMARPIEEEGAEGLVKIESEDEEPSALPTISLDHREASPLGLPERPGEEEEEEVDPKEEEEEEEIPATLGGVDAVSSVPEDGPTGSSELVMRDKPGVAGLPIRGPNSTERPVFVNPKQYQRIIKRRLARARLEEMGRLSRERQPYLHESRHKHAVRRPRGPRGRFLTKEELARADHPNIDPTPDPIPTAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.37
4 0.34
5 0.3
6 0.28
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.15
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.07
19 0.06
20 0.06
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.09
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.19
54 0.19
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.22
59 0.2
60 0.18
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.08
70 0.14
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.14
114 0.16
115 0.18
116 0.18
117 0.21
118 0.23
119 0.26
120 0.28
121 0.27
122 0.26
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.2
127 0.17
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.05
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.18
258 0.19
259 0.23
260 0.27
261 0.31
262 0.26
263 0.25
264 0.29
265 0.33
266 0.39
267 0.38
268 0.42
269 0.41
270 0.49
271 0.53
272 0.54
273 0.58
274 0.61
275 0.68
276 0.66
277 0.7
278 0.7
279 0.75
280 0.8
281 0.79
282 0.76
283 0.73
284 0.71
285 0.69
286 0.62
287 0.55
288 0.49
289 0.47
290 0.42
291 0.37
292 0.34
293 0.35
294 0.39
295 0.39
296 0.37
297 0.38
298 0.45
299 0.52
300 0.58
301 0.59
302 0.59
303 0.62
304 0.71
305 0.69
306 0.67
307 0.66
308 0.67
309 0.69
310 0.73
311 0.77
312 0.77
313 0.83
314 0.81
315 0.83
316 0.81
317 0.81
318 0.75
319 0.74
320 0.72
321 0.66
322 0.67
323 0.6
324 0.55
325 0.47
326 0.47
327 0.44
328 0.38
329 0.39
330 0.34
331 0.37
332 0.34
333 0.35
334 0.32
335 0.3
336 0.31
337 0.26