Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KVS0

Protein Details
Accession E3KVS0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34NDRPREPDRSSRNLKRLRSEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0017005  F:3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG pgr:PGTG_14494  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MPMTLPIFDIQLMANDRPREPDRSSRNLKRLRSEVIEISSDEDGDPKQAADRHRTKIGSRDISSIPPVPSASKPQSVLQNKPERYKLEYERLALQRARELASNPSASSSSVSPAVTPTDQGPKDSDPSISEPFPNYWNSAIKVTFNDWYPDCPNTLRIEDIIGPKDRIKMALVSSYVLELPWIHKLFNPRTRIMVIRHHTDCGSFKVNERANMFLCHPPMLKTANGNAKAGCMHIKFFIIFYDNFCRVAIPTANAVSFDYEFVENAIWIQDFRRFSGNTIGYNSRRSDDVPPFRKTLDDLLDRMGVPLPFRKPLKDHDFGSAAANLVVSIQGTHPANSPMGQAHLAEQLKTLGLQSGPGTGRTATLECQGSSIGSYDLKWLNNFYRCASGSPPTASTEDPDLQTKTPPLTVLYPTLHTVRNSHSGKAGAGTLFCNKATWEKANFPTHIFADTMSKRTGVLMHVKMILGLFNSDSSAKSTSSTLDTASVEKSGARDGRINKDHAGFLYIGSHNFTPAAWGKFNLKSGSDDSTSLEISNWELGVVLPVKSHAQAEEYVTWQRPTKPYGHRGKDTSIPWMQFSHGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.28
4 0.34
5 0.38
6 0.38
7 0.4
8 0.48
9 0.5
10 0.58
11 0.67
12 0.7
13 0.77
14 0.79
15 0.8
16 0.79
17 0.77
18 0.74
19 0.69
20 0.64
21 0.59
22 0.54
23 0.5
24 0.41
25 0.38
26 0.31
27 0.26
28 0.2
29 0.17
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.1
34 0.14
35 0.18
36 0.23
37 0.31
38 0.39
39 0.43
40 0.5
41 0.53
42 0.52
43 0.57
44 0.62
45 0.61
46 0.55
47 0.55
48 0.5
49 0.5
50 0.51
51 0.46
52 0.37
53 0.3
54 0.29
55 0.27
56 0.27
57 0.33
58 0.34
59 0.34
60 0.35
61 0.38
62 0.47
63 0.5
64 0.54
65 0.56
66 0.61
67 0.6
68 0.64
69 0.66
70 0.59
71 0.59
72 0.6
73 0.58
74 0.57
75 0.57
76 0.53
77 0.56
78 0.56
79 0.56
80 0.49
81 0.43
82 0.37
83 0.35
84 0.34
85 0.27
86 0.26
87 0.26
88 0.29
89 0.29
90 0.25
91 0.24
92 0.23
93 0.22
94 0.22
95 0.17
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.13
100 0.14
101 0.17
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.23
106 0.23
107 0.24
108 0.26
109 0.25
110 0.28
111 0.28
112 0.27
113 0.21
114 0.25
115 0.28
116 0.26
117 0.25
118 0.24
119 0.24
120 0.26
121 0.24
122 0.21
123 0.2
124 0.22
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.23
131 0.23
132 0.21
133 0.22
134 0.2
135 0.23
136 0.25
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.23
141 0.23
142 0.24
143 0.2
144 0.18
145 0.19
146 0.21
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.23
151 0.24
152 0.27
153 0.25
154 0.22
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.21
159 0.2
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.12
165 0.1
166 0.07
167 0.08
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.24
173 0.32
174 0.39
175 0.43
176 0.37
177 0.4
178 0.42
179 0.44
180 0.4
181 0.41
182 0.38
183 0.39
184 0.4
185 0.38
186 0.36
187 0.34
188 0.32
189 0.26
190 0.27
191 0.21
192 0.22
193 0.29
194 0.31
195 0.33
196 0.33
197 0.32
198 0.28
199 0.3
200 0.3
201 0.25
202 0.23
203 0.21
204 0.2
205 0.18
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.21
211 0.27
212 0.29
213 0.28
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.22
218 0.2
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.15
235 0.18
236 0.15
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.24
264 0.25
265 0.22
266 0.25
267 0.28
268 0.26
269 0.29
270 0.28
271 0.21
272 0.19
273 0.2
274 0.23
275 0.27
276 0.36
277 0.39
278 0.4
279 0.41
280 0.4
281 0.39
282 0.34
283 0.29
284 0.25
285 0.21
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.17
292 0.11
293 0.1
294 0.13
295 0.13
296 0.17
297 0.18
298 0.19
299 0.2
300 0.28
301 0.35
302 0.36
303 0.36
304 0.34
305 0.35
306 0.34
307 0.33
308 0.25
309 0.18
310 0.13
311 0.12
312 0.08
313 0.06
314 0.05
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.1
364 0.13
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.21
369 0.25
370 0.26
371 0.24
372 0.26
373 0.26
374 0.27
375 0.27
376 0.25
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.22
381 0.22
382 0.21
383 0.19
384 0.2
385 0.19
386 0.19
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.21
391 0.21
392 0.17
393 0.16
394 0.16
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.2
399 0.2
400 0.2
401 0.21
402 0.23
403 0.23
404 0.21
405 0.22
406 0.22
407 0.3
408 0.3
409 0.3
410 0.3
411 0.28
412 0.28
413 0.26
414 0.24
415 0.15
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.14
422 0.13
423 0.17
424 0.21
425 0.24
426 0.26
427 0.31
428 0.38
429 0.44
430 0.44
431 0.42
432 0.41
433 0.36
434 0.33
435 0.27
436 0.2
437 0.23
438 0.24
439 0.25
440 0.22
441 0.21
442 0.2
443 0.21
444 0.22
445 0.17
446 0.23
447 0.22
448 0.24
449 0.25
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.2
454 0.12
455 0.1
456 0.08
457 0.07
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.11
462 0.13
463 0.12
464 0.13
465 0.14
466 0.15
467 0.17
468 0.18
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.17
479 0.18
480 0.19
481 0.24
482 0.29
483 0.39
484 0.43
485 0.45
486 0.43
487 0.44
488 0.43
489 0.37
490 0.35
491 0.25
492 0.2
493 0.23
494 0.21
495 0.19
496 0.2
497 0.19
498 0.17
499 0.17
500 0.16
501 0.15
502 0.19
503 0.23
504 0.21
505 0.23
506 0.28
507 0.32
508 0.37
509 0.34
510 0.3
511 0.3
512 0.32
513 0.35
514 0.32
515 0.28
516 0.27
517 0.27
518 0.26
519 0.22
520 0.19
521 0.15
522 0.14
523 0.15
524 0.12
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.1
532 0.12
533 0.14
534 0.15
535 0.16
536 0.13
537 0.14
538 0.16
539 0.21
540 0.23
541 0.24
542 0.28
543 0.29
544 0.31
545 0.33
546 0.37
547 0.37
548 0.38
549 0.44
550 0.49
551 0.57
552 0.65
553 0.71
554 0.72
555 0.72
556 0.73
557 0.72
558 0.64
559 0.62
560 0.58
561 0.51
562 0.45
563 0.42