Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6QPL5

Protein Details
Accession H6QPL5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-55SDHPSPAKSSKKLSKRKKNQKNNNKPKDKFLITHydrophilic
62-82IAGPSVPKPNKHQNNHPQETLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-49AKSSKKLSKRKKNQKNNNKPK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008409  F:5'-3' exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
KEGG pgr:PGTG_20788  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MSSPPTVILDSSSSSSSDSSEHSDHPSPAKSSKKLSKRKKNQKNNNKPKDKFLITADQWTPIAGPSVPKPNKHQNNHPQETLSLIEPTTNTKLVSLFEPSTSSSSARTATEDLLLAQSNDQEAQQPILVTVEQRVSLYVNCFEEMLNIVLRHEDFLFLPSELRILNSWQALPRSSKYLFVRLFMRKHENWFRLDKLSSYEADVGDLGQTCGSLCKPVDELLAELKRMDPLITLLNNNHCRGGMENIQYPGDQSASHLGGPLNMSTQLEEFNHQYATGGGLNDIHYAGHQLDNYSPCQGTNDPQYPAHQLNPYSPSQASNNLPYAGYQINTYNSPGLGINDVQYTGHQLNLFNPSEGISNAHYTGQQHGIPVTGLFRHSPPAKLDQLNPYNNPYEAINNVQFTSQAHGTHLDGFLKSSPPAKFDPLNLPQHSPNGGMDDAQYSGEQPGISFSDLIRSSPAVEPDHLTTFNHYEGMNDIQWATQQPVSLDELLQCNTHDLAMLEGPYSGALQDTELAYQDQLKSFNQLSPTIPSRIQLGDPSTCPDSPADSLKTDEGIIAQLNVFLDQTSRTKNWTQPPANTLSSHLDQAPNSCRVDESPGPEWIPFDVNDSQTLPDIPPIPPPVDIHPTSITKPPDLVSTTPSVSPSRSQPVESGKDPELSSFATMTSSVDYGLLNTDDLFACMNLDELKSFAKKLNANPHTTRDMIILSIKAVTCKQSTLFGAPSTNKGKQRKQLSLKFTKKGLKESQILSLNSRRPSIKLRPKVCSLFKRLHLIFYRSTTITEKTMTASMLAQMRIRNYPTYTVIRTNSIFESREQLMKYEEALELEKQFDDLMVNERRPWNEDDQGKARRQEAKTVRLKKALDVFESAWLLWQAVILEENDRLDNRLNQGLIYPEYDRSNYYKRRFQPGWPLTRILQKGLAILARFKEYEREVKVLEALIQQPHFRRGKRGQWYDRLALVLMTHLARDESLTVEQRQIHMNSALYTCEHGLKDPDTHQLYRFSLGRRLARLQAIGGALQHPWMDSLETPQVEDWKAARRTTILRTMDNDDRESGVKSRWMSILDNTLLSVEEIALEHYLSDHSHWRGFHSETGILKMIFSLVFWDVIFAPVPGAFETAFQTAPLDIATDAFAIVRRPLIDERMGKIERGGSEEIVNRMRETYVRESGRKTWSIGISQGYWERYRLEDLEQIVRCFSAQAFILISNALFEDYSVWSAGAPDLCLWDPSQMRCKFVEVKGPGDKLSEQQKNWLSLLLKAEGIEVEICSVKED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.19
7 0.21
8 0.23
9 0.28
10 0.32
11 0.34
12 0.38
13 0.4
14 0.38
15 0.43
16 0.5
17 0.49
18 0.54
19 0.61
20 0.67
21 0.73
22 0.8
23 0.84
24 0.86
25 0.92
26 0.94
27 0.95
28 0.96
29 0.97
30 0.97
31 0.97
32 0.97
33 0.97
34 0.89
35 0.87
36 0.85
37 0.78
38 0.71
39 0.66
40 0.65
41 0.56
42 0.62
43 0.54
44 0.47
45 0.42
46 0.38
47 0.32
48 0.22
49 0.22
50 0.14
51 0.16
52 0.18
53 0.29
54 0.33
55 0.37
56 0.45
57 0.54
58 0.63
59 0.68
60 0.74
61 0.74
62 0.81
63 0.83
64 0.78
65 0.68
66 0.58
67 0.54
68 0.45
69 0.36
70 0.26
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.21
75 0.22
76 0.21
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.22
82 0.23
83 0.2
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.18
91 0.19
92 0.2
93 0.19
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.16
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.13
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.13
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.22
156 0.24
157 0.26
158 0.29
159 0.28
160 0.31
161 0.3
162 0.36
163 0.35
164 0.43
165 0.41
166 0.4
167 0.45
168 0.46
169 0.49
170 0.48
171 0.53
172 0.47
173 0.55
174 0.61
175 0.58
176 0.56
177 0.57
178 0.55
179 0.52
180 0.5
181 0.42
182 0.37
183 0.36
184 0.32
185 0.29
186 0.28
187 0.22
188 0.22
189 0.2
190 0.16
191 0.14
192 0.14
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.1
201 0.12
202 0.14
203 0.15
204 0.17
205 0.16
206 0.17
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.2
211 0.2
212 0.19
213 0.19
214 0.17
215 0.1
216 0.1
217 0.15
218 0.16
219 0.18
220 0.2
221 0.29
222 0.34
223 0.34
224 0.33
225 0.28
226 0.27
227 0.27
228 0.29
229 0.27
230 0.27
231 0.3
232 0.31
233 0.32
234 0.3
235 0.29
236 0.24
237 0.18
238 0.13
239 0.11
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.11
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.14
278 0.16
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.16
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.26
287 0.29
288 0.29
289 0.3
290 0.32
291 0.34
292 0.35
293 0.35
294 0.3
295 0.27
296 0.29
297 0.32
298 0.31
299 0.29
300 0.27
301 0.25
302 0.24
303 0.29
304 0.27
305 0.27
306 0.28
307 0.25
308 0.25
309 0.23
310 0.24
311 0.19
312 0.17
313 0.14
314 0.13
315 0.15
316 0.16
317 0.17
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.13
331 0.11
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.15
336 0.22
337 0.22
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.16
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.13
357 0.13
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.16
364 0.17
365 0.2
366 0.21
367 0.26
368 0.31
369 0.32
370 0.36
371 0.39
372 0.45
373 0.46
374 0.45
375 0.43
376 0.39
377 0.36
378 0.33
379 0.25
380 0.19
381 0.16
382 0.19
383 0.18
384 0.17
385 0.18
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.17
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.15
395 0.17
396 0.17
397 0.14
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.13
403 0.17
404 0.16
405 0.18
406 0.2
407 0.23
408 0.23
409 0.25
410 0.33
411 0.34
412 0.41
413 0.4
414 0.41
415 0.38
416 0.39
417 0.37
418 0.3
419 0.23
420 0.18
421 0.16
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.13
442 0.12
443 0.14
444 0.16
445 0.19
446 0.15
447 0.15
448 0.17
449 0.18
450 0.2
451 0.18
452 0.17
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.15
457 0.13
458 0.11
459 0.12
460 0.15
461 0.13
462 0.11
463 0.11
464 0.09
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.11
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.08
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.13
509 0.14
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.19
515 0.22
516 0.21
517 0.21
518 0.19
519 0.19
520 0.19
521 0.18
522 0.16
523 0.16
524 0.15
525 0.15
526 0.18
527 0.18
528 0.17
529 0.17
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.17
534 0.16
535 0.14
536 0.16
537 0.15
538 0.16
539 0.14
540 0.12
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.08
554 0.11
555 0.11
556 0.14
557 0.18
558 0.23
559 0.31
560 0.39
561 0.4
562 0.4
563 0.42
564 0.45
565 0.43
566 0.38
567 0.33
568 0.27
569 0.25
570 0.23
571 0.21
572 0.17
573 0.15
574 0.18
575 0.19
576 0.18
577 0.18
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.21
582 0.2
583 0.21
584 0.2
585 0.21
586 0.22
587 0.22
588 0.21
589 0.16
590 0.15
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.14
597 0.13
598 0.12
599 0.13
600 0.09
601 0.08
602 0.1
603 0.09
604 0.11
605 0.12
606 0.13
607 0.13
608 0.14
609 0.16
610 0.19
611 0.19
612 0.19
613 0.2
614 0.21
615 0.22
616 0.26
617 0.24
618 0.19
619 0.19
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.16
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.14
628 0.16
629 0.14
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.18
634 0.18
635 0.18
636 0.19
637 0.25
638 0.28
639 0.27
640 0.28
641 0.24
642 0.26
643 0.25
644 0.22
645 0.18
646 0.14
647 0.13
648 0.1
649 0.09
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.05
671 0.04
672 0.05
673 0.04
674 0.05
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.1
679 0.14
680 0.18
681 0.23
682 0.33
683 0.36
684 0.41
685 0.43
686 0.45
687 0.43
688 0.4
689 0.35
690 0.25
691 0.21
692 0.17
693 0.15
694 0.11
695 0.08
696 0.09
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.13
706 0.15
707 0.15
708 0.14
709 0.16
710 0.16
711 0.21
712 0.23
713 0.27
714 0.32
715 0.38
716 0.43
717 0.47
718 0.54
719 0.59
720 0.64
721 0.66
722 0.68
723 0.72
724 0.74
725 0.69
726 0.67
727 0.64
728 0.57
729 0.56
730 0.53
731 0.48
732 0.45
733 0.43
734 0.44
735 0.44
736 0.42
737 0.38
738 0.38
739 0.37
740 0.35
741 0.36
742 0.29
743 0.26
744 0.33
745 0.4
746 0.44
747 0.49
748 0.52
749 0.55
750 0.6
751 0.64
752 0.65
753 0.61
754 0.57
755 0.54
756 0.52
757 0.55
758 0.5
759 0.49
760 0.45
761 0.41
762 0.38
763 0.35
764 0.34
765 0.26
766 0.28
767 0.24
768 0.22
769 0.2
770 0.19
771 0.16
772 0.15
773 0.15
774 0.13
775 0.12
776 0.1
777 0.12
778 0.13
779 0.13
780 0.14
781 0.14
782 0.16
783 0.18
784 0.19
785 0.18
786 0.17
787 0.19
788 0.22
789 0.24
790 0.25
791 0.27
792 0.27
793 0.28
794 0.28
795 0.27
796 0.25
797 0.23
798 0.22
799 0.18
800 0.21
801 0.2
802 0.22
803 0.2
804 0.19
805 0.19
806 0.18
807 0.18
808 0.15
809 0.14
810 0.12
811 0.13
812 0.13
813 0.12
814 0.12
815 0.11
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.07
820 0.07
821 0.12
822 0.15
823 0.16
824 0.19
825 0.21
826 0.22
827 0.25
828 0.28
829 0.27
830 0.3
831 0.33
832 0.35
833 0.41
834 0.46
835 0.46
836 0.45
837 0.44
838 0.46
839 0.44
840 0.48
841 0.47
842 0.51
843 0.57
844 0.64
845 0.64
846 0.62
847 0.61
848 0.56
849 0.57
850 0.5
851 0.42
852 0.36
853 0.33
854 0.29
855 0.29
856 0.25
857 0.17
858 0.15
859 0.13
860 0.09
861 0.08
862 0.06
863 0.05
864 0.06
865 0.06
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.08
870 0.09
871 0.1
872 0.11
873 0.14
874 0.16
875 0.18
876 0.17
877 0.16
878 0.17
879 0.18
880 0.17
881 0.17
882 0.15
883 0.14
884 0.16
885 0.16
886 0.17
887 0.2
888 0.28
889 0.35
890 0.4
891 0.46
892 0.49
893 0.58
894 0.58
895 0.59
896 0.61
897 0.61
898 0.64
899 0.59
900 0.57
901 0.49
902 0.54
903 0.5
904 0.41
905 0.35
906 0.26
907 0.24
908 0.23
909 0.23
910 0.16
911 0.17
912 0.16
913 0.15
914 0.15
915 0.15
916 0.18
917 0.19
918 0.26
919 0.27
920 0.28
921 0.27
922 0.27
923 0.28
924 0.23
925 0.22
926 0.18
927 0.16
928 0.17
929 0.18
930 0.2
931 0.21
932 0.28
933 0.32
934 0.31
935 0.37
936 0.43
937 0.51
938 0.59
939 0.68
940 0.68
941 0.71
942 0.76
943 0.7
944 0.63
945 0.54
946 0.44
947 0.34
948 0.25
949 0.17
950 0.12
951 0.09
952 0.08
953 0.07
954 0.07
955 0.07
956 0.07
957 0.07
958 0.08
959 0.11
960 0.14
961 0.15
962 0.19
963 0.2
964 0.21
965 0.25
966 0.24
967 0.23
968 0.22
969 0.22
970 0.21
971 0.2
972 0.19
973 0.15
974 0.16
975 0.14
976 0.15
977 0.15
978 0.14
979 0.16
980 0.18
981 0.21
982 0.21
983 0.28
984 0.29
985 0.3
986 0.31
987 0.34
988 0.33
989 0.33
990 0.35
991 0.3
992 0.32
993 0.37
994 0.39
995 0.39
996 0.41
997 0.41
998 0.4
999 0.38
1000 0.32
1001 0.29
1002 0.25
1003 0.21
1004 0.18
1005 0.14
1006 0.11
1007 0.11
1008 0.11
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.09
1013 0.08
1014 0.12
1015 0.17
1016 0.17
1017 0.18
1018 0.18
1019 0.2
1020 0.2
1021 0.21
1022 0.19
1023 0.23
1024 0.27
1025 0.26
1026 0.27
1027 0.27
1028 0.31
1029 0.36
1030 0.43
1031 0.38
1032 0.37
1033 0.4
1034 0.45
1035 0.48
1036 0.46
1037 0.42
1038 0.34
1039 0.32
1040 0.3
1041 0.29
1042 0.25
1043 0.2
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.23
1047 0.24
1048 0.25
1049 0.25
1050 0.26
1051 0.3
1052 0.27
1053 0.26
1054 0.23
1055 0.21
1056 0.18
1057 0.16
1058 0.13
1059 0.06
1060 0.06
1061 0.06
1062 0.06
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.06
1066 0.06
1067 0.07
1068 0.07
1069 0.09
1070 0.15
1071 0.17
1072 0.21
1073 0.21
1074 0.24
1075 0.28
1076 0.3
1077 0.31
1078 0.29
1079 0.31
1080 0.29
1081 0.33
1082 0.32
1083 0.27
1084 0.24
1085 0.21
1086 0.18
1087 0.13
1088 0.12
1089 0.1
1090 0.08
1091 0.09
1092 0.09
1093 0.11
1094 0.1
1095 0.11
1096 0.11
1097 0.09
1098 0.09
1099 0.08
1100 0.1
1101 0.09
1102 0.09
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.12
1106 0.13
1107 0.12
1108 0.11
1109 0.12
1110 0.11
1111 0.11
1112 0.1
1113 0.08
1114 0.06
1115 0.07
1116 0.08
1117 0.07
1118 0.07
1119 0.07
1120 0.08
1121 0.08
1122 0.09
1123 0.11
1124 0.1
1125 0.14
1126 0.17
1127 0.21
1128 0.27
1129 0.3
1130 0.32
1131 0.39
1132 0.39
1133 0.36
1134 0.35
1135 0.35
1136 0.29
1137 0.3
1138 0.29
1139 0.21
1140 0.24
1141 0.28
1142 0.3
1143 0.3
1144 0.3
1145 0.26
1146 0.25
1147 0.25
1148 0.23
1149 0.26
1150 0.29
1151 0.34
1152 0.39
1153 0.42
1154 0.46
1155 0.52
1156 0.57
1157 0.53
1158 0.48
1159 0.46
1160 0.44
1161 0.43
1162 0.42
1163 0.38
1164 0.32
1165 0.34
1166 0.36
1167 0.33
1168 0.3
1169 0.28
1170 0.27
1171 0.26
1172 0.29
1173 0.27
1174 0.26
1175 0.27
1176 0.29
1177 0.36
1178 0.37
1179 0.35
1180 0.31
1181 0.3
1182 0.26
1183 0.22
1184 0.19
1185 0.14
1186 0.12
1187 0.12
1188 0.13
1189 0.13
1190 0.14
1191 0.13
1192 0.13
1193 0.09
1194 0.09
1195 0.08
1196 0.06
1197 0.06
1198 0.08
1199 0.09
1200 0.11
1201 0.11
1202 0.1
1203 0.1
1204 0.11
1205 0.14
1206 0.12
1207 0.11
1208 0.11
1209 0.14
1210 0.14
1211 0.15
1212 0.15
1213 0.19
1214 0.22
1215 0.27
1216 0.36
1217 0.35
1218 0.38
1219 0.38
1220 0.43
1221 0.45
1222 0.45
1223 0.49
1224 0.43
1225 0.48
1226 0.53
1227 0.54
1228 0.49
1229 0.45
1230 0.42
1231 0.38
1232 0.45
1233 0.46
1234 0.39
1235 0.46
1236 0.51
1237 0.51
1238 0.5
1239 0.5
1240 0.4
1241 0.37
1242 0.4
1243 0.33
1244 0.28
1245 0.24
1246 0.25
1247 0.19
1248 0.19
1249 0.16
1250 0.11
1251 0.11
1252 0.12