Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R5R1

Protein Details
Accession C4R5R1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-122DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr3_0846  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIISPVIQDEDVDIDGESRPTRYEDPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKPVPETEDEMMLDVFAYTENVIMMARPRKVIYIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKDANEKKAAELKEMEKKGEIIDDAIKNKKTWDSNAITPGTPFMHRLADSLRYWAAYKLTTDPGWSGIEVIISDASVPGEGEHKIMSYVRSLRSSPKHDPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDKKSYSLQDQLRMTDIERQELKDKKTPFLWLHLNILREYLQIELNVPGLSFPFDLEKSIDDWVFICFFCGNDFLPHLPSLDVRDNSITTLVTIWKQILPTMKGYLTTDGYLNLPAVERLLAELAKKEDYIFRKRYEDEKRSLENQKRRKLAQEQSSARSQNAPNISTGKDKAPLTPNQNIPLYTTSGESVGIKMTDSEMVNNSALITKANEANKSIAELLKQNLQNEINKKRKISNEEQEVVKESVEEVVEEEDDVLVTSDPEDSSTEILIPKNEEIRLWEPGYRKRYYETKFHTKDPQKVKKIARNMVQKYIEGVSWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFAADFVNLSELKIEFVEGTPFRPYEQLMSVLPAASSHNLPDVFRSLMSDANSEIIDFYPEEFPLDMNGKKVIWQAIPLLPFIDENRLLKAVQSKYDQLTEDEKFRNTNRSEILVLGRSHSHYPTLVKELYEEGKDSYEFQVDSSGVSGVAIKLQSFDRSGVLRLPVKQLEGYRHYPDISNRDFLMVEFKQLPKSHAKSMILSGLIPHLRRLTQEDKDSILYGGTNFYGRNRFSPEENADFKQYIGPHGKSQYLPRQGGYKAFIQIHSDEAKGHRHGIYHGGSHTETEFRRGGGYHQHGNRGGRGGYQGNQGYQANSGGYQNSYQGSYQGGYRGGYQGGSQGRYQAGYQSGYQGGYQGEYKNGYQGGYQGNQGNQGYNRQTYNASKSGTLPMKRRHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.67
5 0.63
6 0.62
7 0.62
8 0.59
9 0.51
10 0.44
11 0.37
12 0.32
13 0.27
14 0.2
15 0.13
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.17
23 0.22
24 0.27
25 0.36
26 0.44
27 0.5
28 0.57
29 0.57
30 0.55
31 0.51
32 0.45
33 0.38
34 0.29
35 0.24
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.17
49 0.22
50 0.26
51 0.33
52 0.4
53 0.45
54 0.51
55 0.51
56 0.51
57 0.49
58 0.49
59 0.42
60 0.37
61 0.31
62 0.26
63 0.23
64 0.17
65 0.14
66 0.1
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.13
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.23
81 0.25
82 0.27
83 0.3
84 0.28
85 0.29
86 0.28
87 0.26
88 0.27
89 0.25
90 0.25
91 0.23
92 0.19
93 0.12
94 0.15
95 0.21
96 0.28
97 0.39
98 0.46
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.82
104 0.78
105 0.76
106 0.77
107 0.77
108 0.72
109 0.73
110 0.66
111 0.6
112 0.66
113 0.61
114 0.52
115 0.48
116 0.42
117 0.36
118 0.4
119 0.39
120 0.33
121 0.35
122 0.39
123 0.42
124 0.44
125 0.42
126 0.36
127 0.36
128 0.32
129 0.3
130 0.24
131 0.17
132 0.22
133 0.25
134 0.28
135 0.34
136 0.35
137 0.32
138 0.35
139 0.39
140 0.36
141 0.36
142 0.41
143 0.4
144 0.44
145 0.5
146 0.5
147 0.43
148 0.39
149 0.37
150 0.3
151 0.25
152 0.21
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.21
158 0.24
159 0.24
160 0.26
161 0.24
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.21
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.22
170 0.21
171 0.21
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.15
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.14
198 0.19
199 0.21
200 0.24
201 0.26
202 0.33
203 0.4
204 0.47
205 0.5
206 0.56
207 0.61
208 0.62
209 0.66
210 0.65
211 0.66
212 0.59
213 0.52
214 0.42
215 0.34
216 0.3
217 0.26
218 0.2
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.23
239 0.25
240 0.26
241 0.27
242 0.34
243 0.34
244 0.32
245 0.3
246 0.28
247 0.27
248 0.28
249 0.26
250 0.21
251 0.28
252 0.3
253 0.34
254 0.35
255 0.33
256 0.33
257 0.32
258 0.3
259 0.29
260 0.26
261 0.25
262 0.25
263 0.26
264 0.31
265 0.36
266 0.4
267 0.4
268 0.42
269 0.39
270 0.4
271 0.44
272 0.39
273 0.4
274 0.41
275 0.37
276 0.41
277 0.41
278 0.4
279 0.33
280 0.32
281 0.26
282 0.2
283 0.18
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.11
324 0.15
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.14
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.15
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.15
373 0.2
374 0.28
375 0.3
376 0.32
377 0.35
378 0.38
379 0.46
380 0.5
381 0.51
382 0.49
383 0.51
384 0.52
385 0.54
386 0.61
387 0.61
388 0.6
389 0.63
390 0.65
391 0.64
392 0.61
393 0.62
394 0.62
395 0.62
396 0.62
397 0.62
398 0.58
399 0.57
400 0.6
401 0.54
402 0.46
403 0.42
404 0.33
405 0.29
406 0.28
407 0.25
408 0.22
409 0.23
410 0.24
411 0.22
412 0.23
413 0.19
414 0.2
415 0.2
416 0.23
417 0.26
418 0.3
419 0.32
420 0.37
421 0.38
422 0.37
423 0.37
424 0.33
425 0.3
426 0.26
427 0.22
428 0.17
429 0.15
430 0.12
431 0.11
432 0.11
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.11
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.15
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.11
462 0.1
463 0.11
464 0.11
465 0.16
466 0.17
467 0.16
468 0.19
469 0.2
470 0.23
471 0.28
472 0.36
473 0.39
474 0.4
475 0.41
476 0.43
477 0.47
478 0.51
479 0.53
480 0.52
481 0.51
482 0.52
483 0.5
484 0.46
485 0.44
486 0.36
487 0.27
488 0.19
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.13
522 0.15
523 0.18
524 0.18
525 0.21
526 0.23
527 0.3
528 0.35
529 0.32
530 0.31
531 0.31
532 0.38
533 0.38
534 0.43
535 0.44
536 0.5
537 0.51
538 0.54
539 0.61
540 0.58
541 0.64
542 0.65
543 0.67
544 0.63
545 0.68
546 0.71
547 0.68
548 0.71
549 0.69
550 0.66
551 0.66
552 0.63
553 0.63
554 0.57
555 0.5
556 0.43
557 0.38
558 0.29
559 0.2
560 0.17
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.1
573 0.15
574 0.19
575 0.2
576 0.23
577 0.23
578 0.27
579 0.3
580 0.33
581 0.29
582 0.25
583 0.22
584 0.19
585 0.19
586 0.16
587 0.13
588 0.1
589 0.08
590 0.08
591 0.11
592 0.1
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.08
599 0.05
600 0.06
601 0.1
602 0.09
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.12
610 0.13
611 0.14
612 0.12
613 0.14
614 0.14
615 0.13
616 0.12
617 0.1
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.07
622 0.1
623 0.1
624 0.11
625 0.12
626 0.13
627 0.13
628 0.12
629 0.13
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.13
634 0.11
635 0.12
636 0.12
637 0.1
638 0.1
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.1
649 0.13
650 0.12
651 0.12
652 0.14
653 0.13
654 0.14
655 0.17
656 0.17
657 0.14
658 0.15
659 0.17
660 0.19
661 0.2
662 0.18
663 0.16
664 0.14
665 0.14
666 0.13
667 0.14
668 0.13
669 0.13
670 0.15
671 0.16
672 0.15
673 0.17
674 0.23
675 0.21
676 0.24
677 0.26
678 0.27
679 0.28
680 0.31
681 0.3
682 0.25
683 0.28
684 0.26
685 0.29
686 0.28
687 0.27
688 0.28
689 0.29
690 0.35
691 0.31
692 0.34
693 0.3
694 0.3
695 0.3
696 0.29
697 0.3
698 0.26
699 0.25
700 0.22
701 0.21
702 0.2
703 0.21
704 0.2
705 0.19
706 0.16
707 0.18
708 0.19
709 0.23
710 0.22
711 0.2
712 0.21
713 0.23
714 0.23
715 0.22
716 0.2
717 0.15
718 0.16
719 0.16
720 0.17
721 0.15
722 0.15
723 0.14
724 0.13
725 0.14
726 0.13
727 0.13
728 0.12
729 0.1
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.05
734 0.08
735 0.08
736 0.07
737 0.08
738 0.09
739 0.11
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.14
744 0.16
745 0.17
746 0.21
747 0.23
748 0.23
749 0.28
750 0.27
751 0.27
752 0.29
753 0.29
754 0.31
755 0.34
756 0.37
757 0.35
758 0.36
759 0.35
760 0.35
761 0.38
762 0.39
763 0.36
764 0.34
765 0.3
766 0.3
767 0.29
768 0.26
769 0.28
770 0.21
771 0.21
772 0.21
773 0.23
774 0.27
775 0.28
776 0.32
777 0.33
778 0.37
779 0.4
780 0.44
781 0.45
782 0.41
783 0.43
784 0.43
785 0.34
786 0.3
787 0.24
788 0.22
789 0.23
790 0.21
791 0.21
792 0.19
793 0.2
794 0.21
795 0.28
796 0.3
797 0.33
798 0.38
799 0.38
800 0.39
801 0.39
802 0.38
803 0.32
804 0.24
805 0.18
806 0.13
807 0.12
808 0.1
809 0.1
810 0.1
811 0.13
812 0.19
813 0.19
814 0.23
815 0.28
816 0.3
817 0.32
818 0.4
819 0.42
820 0.44
821 0.47
822 0.46
823 0.42
824 0.4
825 0.37
826 0.34
827 0.28
828 0.27
829 0.3
830 0.3
831 0.32
832 0.35
833 0.38
834 0.37
835 0.44
836 0.47
837 0.49
838 0.48
839 0.44
840 0.47
841 0.44
842 0.46
843 0.41
844 0.35
845 0.32
846 0.33
847 0.33
848 0.31
849 0.3
850 0.3
851 0.29
852 0.25
853 0.22
854 0.23
855 0.27
856 0.26
857 0.29
858 0.26
859 0.25
860 0.26
861 0.31
862 0.31
863 0.29
864 0.28
865 0.28
866 0.26
867 0.26
868 0.26
869 0.25
870 0.22
871 0.24
872 0.24
873 0.2
874 0.22
875 0.21
876 0.23
877 0.27
878 0.33
879 0.37
880 0.4
881 0.46
882 0.49
883 0.52
884 0.51
885 0.45
886 0.4
887 0.33
888 0.34
889 0.31
890 0.29
891 0.34
892 0.33
893 0.29
894 0.33
895 0.31
896 0.28
897 0.25
898 0.24
899 0.17
900 0.16
901 0.16
902 0.14
903 0.15
904 0.15
905 0.16
906 0.16
907 0.17
908 0.16
909 0.15
910 0.16
911 0.15
912 0.16
913 0.17
914 0.18
915 0.17
916 0.18
917 0.2
918 0.18
919 0.18
920 0.16
921 0.19
922 0.22
923 0.24
924 0.22
925 0.23
926 0.24
927 0.25
928 0.25
929 0.23
930 0.22
931 0.22
932 0.23
933 0.24
934 0.24
935 0.24
936 0.23
937 0.21
938 0.18
939 0.17
940 0.19
941 0.17
942 0.18
943 0.21
944 0.21
945 0.23
946 0.24
947 0.22
948 0.2
949 0.23
950 0.26
951 0.25
952 0.28
953 0.28
954 0.28
955 0.34
956 0.34
957 0.34
958 0.3
959 0.36
960 0.37
961 0.37
962 0.38
963 0.34
964 0.39
965 0.4
966 0.46
967 0.44
968 0.41
969 0.38
970 0.39
971 0.47
972 0.5
973 0.5
974 0.52