Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6QT82

Protein Details
Accession H6QT82    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-50LLHLSFKFGERKRKKNKDVANKKRCKPKDQKSDEKPNDRGGKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-50ERKRKKNKDVANKKRCKPKDQKSDEKPNDRGGKS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pgr:PGTG_22000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MLTDPKLLLHLSFKFGERKRKKNKDVANKKRCKPKDQKSDEKPNDRGGKSMGTSKAVRSKTNAHSKPSSTAHQKIESQPPSEVLRTPMKTGPPDADATRLSSPSPQTQGPLIDVLDLFRLHTKQMEERGLAIPLDPALEHLTAENLFSEPAIEDGDHLPKINPELLCCFCDELLPASPSARFLKLSSYLQGVSEVKRQVSATNRLALHLPSIHLGSSPGLQITAVCIRQIPVQSQWVKIVAGRLKLSFQSSQGSNGKCSRVRSHRQRLTNVCDRQIPSDFLRDALEAWETHGGRKVQSVSHEYSSFQIEQPGYYGVQGYKIILKELRSMFMRSAIQLAHPLDNDFLLRKVLIPEVAMCLIAEDYNLPVLDPRVRLHLEDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.41
3 0.51
4 0.55
5 0.63
6 0.7
7 0.79
8 0.85
9 0.86
10 0.9
11 0.91
12 0.92
13 0.93
14 0.93
15 0.92
16 0.9
17 0.91
18 0.88
19 0.87
20 0.87
21 0.87
22 0.87
23 0.87
24 0.9
25 0.89
26 0.93
27 0.92
28 0.91
29 0.84
30 0.82
31 0.81
32 0.71
33 0.63
34 0.54
35 0.49
36 0.42
37 0.45
38 0.38
39 0.34
40 0.35
41 0.37
42 0.43
43 0.41
44 0.41
45 0.38
46 0.44
47 0.49
48 0.58
49 0.58
50 0.56
51 0.59
52 0.6
53 0.62
54 0.58
55 0.56
56 0.53
57 0.55
58 0.54
59 0.53
60 0.55
61 0.55
62 0.6
63 0.57
64 0.51
65 0.45
66 0.43
67 0.41
68 0.38
69 0.33
70 0.27
71 0.31
72 0.3
73 0.33
74 0.33
75 0.34
76 0.34
77 0.35
78 0.33
79 0.27
80 0.29
81 0.26
82 0.26
83 0.22
84 0.24
85 0.23
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.22
90 0.23
91 0.26
92 0.23
93 0.22
94 0.24
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.16
99 0.13
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.13
109 0.15
110 0.17
111 0.24
112 0.26
113 0.24
114 0.26
115 0.27
116 0.25
117 0.23
118 0.19
119 0.13
120 0.09
121 0.09
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.14
149 0.12
150 0.11
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.13
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.14
171 0.17
172 0.18
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.21
187 0.26
188 0.24
189 0.28
190 0.28
191 0.28
192 0.28
193 0.25
194 0.21
195 0.15
196 0.13
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.21
220 0.22
221 0.23
222 0.24
223 0.22
224 0.21
225 0.2
226 0.23
227 0.19
228 0.2
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.24
234 0.19
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.24
239 0.28
240 0.28
241 0.29
242 0.31
243 0.35
244 0.34
245 0.37
246 0.39
247 0.43
248 0.53
249 0.6
250 0.67
251 0.71
252 0.75
253 0.79
254 0.78
255 0.77
256 0.76
257 0.69
258 0.61
259 0.58
260 0.53
261 0.48
262 0.44
263 0.39
264 0.31
265 0.33
266 0.31
267 0.26
268 0.26
269 0.22
270 0.19
271 0.17
272 0.16
273 0.1
274 0.12
275 0.17
276 0.16
277 0.17
278 0.22
279 0.21
280 0.2
281 0.24
282 0.25
283 0.21
284 0.26
285 0.31
286 0.3
287 0.33
288 0.34
289 0.3
290 0.3
291 0.31
292 0.28
293 0.23
294 0.23
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.15
300 0.14
301 0.16
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.13
306 0.16
307 0.16
308 0.19
309 0.19
310 0.21
311 0.26
312 0.27
313 0.3
314 0.29
315 0.3
316 0.28
317 0.32
318 0.31
319 0.24
320 0.25
321 0.21
322 0.2
323 0.23
324 0.25
325 0.22
326 0.22
327 0.22
328 0.2
329 0.2
330 0.21
331 0.17
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.18
343 0.17
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.07
350 0.07
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.13
356 0.18
357 0.2
358 0.2
359 0.25
360 0.27