Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3L479

Protein Details
Accession E3L479    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-68DEALQKGKKPRRKHVDLPKPTELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-59QKGKKPRRKH
181-187AKRLKKL
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_17008  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MSNKKQSTYGAPAAGTDFRKTWDKAEYEAKAKQRDEEERERMKEADEALQKGKKPRRKHVDLPKPTELMKQREAPLELNKNQNKTMIVQGSSRGPGAPGFYCDVCSRTSKDSSSYLDHLNSRFHLRQLGQKTQVARSTIDQVRAKIAEMREATKQQAASKQYDFSQRLKEIKAAEEAEREAKRLKKLQAREAQAKAKPPSDVYQPAPESNEINGENGADEMAKMMGFSGGFKARK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.26
4 0.22
5 0.23
6 0.29
7 0.29
8 0.3
9 0.32
10 0.32
11 0.34
12 0.42
13 0.44
14 0.44
15 0.49
16 0.52
17 0.52
18 0.51
19 0.51
20 0.49
21 0.53
22 0.56
23 0.59
24 0.61
25 0.62
26 0.64
27 0.62
28 0.55
29 0.48
30 0.42
31 0.34
32 0.33
33 0.29
34 0.29
35 0.31
36 0.34
37 0.36
38 0.43
39 0.49
40 0.49
41 0.54
42 0.62
43 0.67
44 0.73
45 0.8
46 0.82
47 0.84
48 0.86
49 0.86
50 0.8
51 0.71
52 0.63
53 0.6
54 0.55
55 0.5
56 0.45
57 0.42
58 0.4
59 0.42
60 0.43
61 0.39
62 0.4
63 0.42
64 0.41
65 0.45
66 0.45
67 0.44
68 0.43
69 0.42
70 0.35
71 0.29
72 0.31
73 0.25
74 0.23
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.19
80 0.13
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.18
97 0.2
98 0.22
99 0.23
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.22
105 0.21
106 0.19
107 0.17
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.19
112 0.19
113 0.25
114 0.3
115 0.34
116 0.32
117 0.34
118 0.35
119 0.35
120 0.37
121 0.31
122 0.26
123 0.22
124 0.26
125 0.26
126 0.32
127 0.3
128 0.27
129 0.29
130 0.28
131 0.27
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.21
143 0.25
144 0.27
145 0.27
146 0.27
147 0.28
148 0.28
149 0.35
150 0.36
151 0.33
152 0.37
153 0.38
154 0.39
155 0.39
156 0.4
157 0.33
158 0.32
159 0.34
160 0.29
161 0.26
162 0.25
163 0.25
164 0.28
165 0.27
166 0.26
167 0.26
168 0.28
169 0.33
170 0.38
171 0.45
172 0.46
173 0.53
174 0.61
175 0.65
176 0.68
177 0.7
178 0.7
179 0.69
180 0.64
181 0.65
182 0.59
183 0.53
184 0.47
185 0.42
186 0.39
187 0.39
188 0.42
189 0.38
190 0.43
191 0.43
192 0.43
193 0.42
194 0.4
195 0.34
196 0.29
197 0.3
198 0.22
199 0.21
200 0.19
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.12