Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JV39

Protein Details
Accession E3JV39    Localization Confidence Low Confidence Score 5.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48TINPQSHHPRRPFTHRPPSQDKQQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, cyto 4, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029061  THDP-binding  
IPR009014  Transketo_C/PFOR_II  
IPR005475  Transketolase-like_Pyr-bd  
IPR033248  Transketolase_C  
Gene Ontology GO:0005947  C:mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0009083  P:branched-chain amino acid catabolic process  
GO:0006163  P:purine nucleotide metabolic process  
GO:0007584  P:response to nutrient  
KEGG pgr:PGTG_01245  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02779  Transket_pyr  
PF02780  Transketolase_C  
CDD cd07036  TPP_PYR_E1-PDHc-beta_like  
Amino Acid Sequences MVNRGTHQARHWLNSTTRRTTTTINPQSHHPRRPFTHRPPSQDKQQSSEPLSPAYPTLSTSAFLCHQPEDVERIRGLTRSHAGQHPSANQPPPPPPVKLNMFQAIRDALAITLQKDDSAVLFGEDVAFGGVFRCSLGLSEEYGPDRVFNTPLTEQGIAGFGIGMATMGHTAIAEIQFGDYIFPAFDQLVNEAAKLRYRSGGKYNCGKLTVRTPVMAVGHGGLYHSQSPEGYFQQASGLKVVIPRSPSQAKGLLLASIREPNPVIFMEPKVLYRSSVEWVPGGEYELALDRAEVVSAGQDLTVVSYGTAFYVCELALAMLRNPPPEIAHLVPQSLRNLSVELIDLRTVVPFDYPTVVQSVRKTGRAVVVHEAPLNGGVGAELAARIQEHCFTRLEAPVKRVCGWDTPFPLVFEKFYLPDQIRILDAIVETMKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.59
4 0.58
5 0.56
6 0.56
7 0.54
8 0.55
9 0.57
10 0.58
11 0.57
12 0.55
13 0.6
14 0.68
15 0.73
16 0.72
17 0.68
18 0.68
19 0.69
20 0.78
21 0.8
22 0.79
23 0.81
24 0.79
25 0.82
26 0.82
27 0.82
28 0.82
29 0.81
30 0.74
31 0.69
32 0.69
33 0.67
34 0.63
35 0.62
36 0.53
37 0.46
38 0.43
39 0.38
40 0.31
41 0.26
42 0.2
43 0.15
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.18
55 0.2
56 0.23
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.25
61 0.25
62 0.26
63 0.25
64 0.24
65 0.25
66 0.25
67 0.29
68 0.32
69 0.34
70 0.35
71 0.38
72 0.38
73 0.41
74 0.43
75 0.42
76 0.4
77 0.41
78 0.42
79 0.44
80 0.42
81 0.39
82 0.36
83 0.4
84 0.43
85 0.42
86 0.43
87 0.45
88 0.42
89 0.39
90 0.39
91 0.32
92 0.27
93 0.22
94 0.17
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.14
137 0.13
138 0.15
139 0.17
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.15
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.17
185 0.19
186 0.27
187 0.32
188 0.34
189 0.41
190 0.43
191 0.4
192 0.41
193 0.38
194 0.31
195 0.31
196 0.32
197 0.25
198 0.22
199 0.21
200 0.2
201 0.2
202 0.18
203 0.13
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.18
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.24
236 0.23
237 0.23
238 0.22
239 0.19
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.1
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.2
313 0.17
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.24
318 0.26
319 0.26
320 0.22
321 0.21
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.15
342 0.16
343 0.18
344 0.2
345 0.28
346 0.29
347 0.32
348 0.32
349 0.32
350 0.38
351 0.38
352 0.39
353 0.36
354 0.36
355 0.35
356 0.35
357 0.32
358 0.25
359 0.22
360 0.19
361 0.12
362 0.08
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.08
373 0.13
374 0.15
375 0.17
376 0.19
377 0.21
378 0.24
379 0.3
380 0.36
381 0.35
382 0.39
383 0.42
384 0.45
385 0.44
386 0.44
387 0.39
388 0.4
389 0.41
390 0.43
391 0.43
392 0.44
393 0.44
394 0.43
395 0.44
396 0.38
397 0.34
398 0.28
399 0.26
400 0.23
401 0.23
402 0.29
403 0.28
404 0.31
405 0.32
406 0.31
407 0.28
408 0.27
409 0.26
410 0.2
411 0.17
412 0.15