FuNGI

E3L4X2

Protein Details

Accession

E3L4X2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
138-163	GPAPASQPKKNQPFKKKTKQVFIAAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
80-82	RKK

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pgr:PGTG_17651 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQARTTSKKPNQEPTPMETDPPKPPPTEAKYVSYTLLAAHDPQLKYNILKFAPSSNRKIEVDSFVQPIKLNRKDPWAIRKKAEEEKKRSTEAQEENASKTGENDNNDDENDNEMKVDQDNKASSTSTKQVRDDSVIGPAPASQPKKNQPFKKKTKQVFIAADQSARMLKKEEYQSWLLEDGSPNGERWVGRYESAGAAAGSSASASTSTSTNNDASNYVLFRMDPSGEAFQVIPCHRFYRFTQRPNYDTLGADEAEAAYEKMQKPTTKEDVGRWFMRRRGANPSSSGSSQPSKTLDNKTSGNVKHEGDVKPTSFFDHSKVSFGTSNKVRSQVEIPSFINGRRNKFTAVQGSNSRLDDDEDRKPNFGQEGDFDEVDYDEQFDDDEEGAGNLNDEAMEEDELKELAEKMKREMLAAGKAGDDEREKEDVDMAKDDLFGEREDLTKEGKAVKKLLMRKGEDNVYDSDDEVRNPYASEEDESDFEEVVPPPPNGPSPTDAKDPASRSGTPTPGSQPAGTSKSIATKGPVTQASNLKGDKPQSRPPSRSGTPSLPNHSRTNSASHPVHGHGFNAGPANRSRATSPQLPSSQLASSSAGPRSRAVSPVLSSSLKPSSPISANASTTNSNGKRKQHPNGAIASKEKKLNSGPTPPGRISSTISAAPDQESGVITKEQVVTLLKIRPLTTKELLAHFKQRLKEESNKVIIFAIIREIANIHEGLLVLKDGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.72
3	0.72
4	0.62
5	0.58
6	0.52
7	0.5
8	0.48
9	0.51
10	0.48
11	0.41
12	0.44
13	0.51
14	0.53
15	0.57
16	0.53
17	0.51
18	0.52
19	0.53
20	0.5
21	0.4
22	0.33
23	0.25
24	0.23
25	0.18
26	0.15
27	0.19
28	0.25
29	0.24
30	0.26
31	0.28
32	0.28
33	0.3
34	0.33
35	0.35
36	0.28
37	0.3
38	0.3
39	0.35
40	0.43
41	0.47
42	0.49
43	0.48
44	0.54
45	0.52
46	0.55
47	0.5
48	0.46
49	0.44
50	0.41
51	0.39
52	0.34
53	0.34
54	0.32
55	0.34
56	0.38
57	0.41
58	0.43
59	0.42
60	0.5
61	0.55
62	0.61
63	0.66
64	0.66
65	0.65
66	0.66
67	0.71
68	0.7
69	0.73
70	0.75
71	0.75
72	0.73
73	0.77
74	0.77
75	0.74
76	0.7
77	0.65
78	0.64
79	0.59
80	0.58
81	0.56
82	0.52
83	0.5
84	0.5
85	0.45
86	0.36
87	0.32
88	0.32
89	0.29
90	0.29
91	0.3
92	0.31
93	0.33
94	0.34
95	0.32
96	0.25
97	0.25
98	0.23
99	0.2
100	0.15
101	0.13
102	0.14
103	0.15
104	0.18
105	0.15
106	0.19
107	0.21
108	0.22
109	0.23
110	0.23
111	0.23
112	0.24
113	0.3
114	0.33
115	0.36
116	0.37
117	0.4
118	0.42
119	0.45
120	0.43
121	0.36
122	0.34
123	0.31
124	0.28
125	0.24
126	0.22
127	0.2
128	0.24
129	0.28
130	0.26
131	0.32
132	0.42
133	0.53
134	0.61
135	0.68
136	0.73
137	0.79
138	0.86
139	0.9
140	0.9
141	0.88
142	0.89
143	0.86
144	0.84
145	0.79
146	0.73
147	0.69
148	0.6
149	0.52
150	0.41
151	0.35
152	0.3
153	0.24
154	0.2
155	0.15
156	0.15
157	0.22
158	0.29
159	0.31
160	0.33
161	0.35
162	0.35
163	0.34
164	0.34
165	0.27
166	0.22
167	0.19
168	0.16
169	0.17
170	0.16
171	0.15
172	0.14
173	0.15
174	0.14
175	0.15
176	0.18
177	0.16
178	0.16
179	0.17
180	0.19
181	0.17
182	0.18
183	0.16
184	0.11
185	0.09
186	0.09
187	0.07
188	0.05
189	0.04
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.04
194	0.05
195	0.06
196	0.07
197	0.09
198	0.11
199	0.13
200	0.13
201	0.14
202	0.13
203	0.14
204	0.14
205	0.14
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.12
214	0.13
215	0.12
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.16
220	0.17
221	0.15
222	0.15
223	0.17
224	0.17
225	0.21
226	0.23
227	0.3
228	0.37
229	0.43
230	0.51
231	0.55
232	0.56
233	0.57
234	0.57
235	0.48
236	0.4
237	0.34
238	0.27
239	0.21
240	0.19
241	0.14
242	0.11
243	0.09
244	0.08
245	0.06
246	0.05
247	0.1
248	0.11
249	0.14
250	0.18
251	0.19
252	0.23
253	0.3
254	0.35
255	0.35
256	0.37
257	0.39
258	0.44
259	0.47
260	0.47
261	0.45
262	0.43
263	0.41
264	0.46
265	0.43
266	0.37
267	0.42
268	0.42
269	0.41
270	0.39
271	0.39
272	0.36
273	0.34
274	0.33
275	0.26
276	0.26
277	0.23
278	0.23
279	0.21
280	0.21
281	0.25
282	0.3
283	0.3
284	0.3
285	0.31
286	0.31
287	0.36
288	0.34
289	0.33
290	0.31
291	0.28
292	0.27
293	0.31
294	0.3
295	0.27
296	0.28
297	0.25
298	0.23
299	0.23
300	0.22
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.2
305	0.2
306	0.2
307	0.2
308	0.2
309	0.21
310	0.21
311	0.25
312	0.23
313	0.27
314	0.27
315	0.31
316	0.29
317	0.27
318	0.28
319	0.28
320	0.26
321	0.25
322	0.24
323	0.22
324	0.23
325	0.22
326	0.27
327	0.25
328	0.27
329	0.26
330	0.28
331	0.28
332	0.29
333	0.32
334	0.34
335	0.32
336	0.31
337	0.31
338	0.33
339	0.33
340	0.3
341	0.27
342	0.18
343	0.18
344	0.18
345	0.2
346	0.23
347	0.26
348	0.27
349	0.27
350	0.27
351	0.26
352	0.24
353	0.2
354	0.14
355	0.1
356	0.15
357	0.15
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.1
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.09
392	0.11
393	0.12
394	0.13
395	0.17
396	0.18
397	0.18
398	0.2
399	0.19
400	0.18
401	0.19
402	0.17
403	0.13
404	0.14
405	0.13
406	0.12
407	0.11
408	0.1
409	0.11
410	0.12
411	0.13
412	0.12
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.1
422	0.09
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.17
433	0.19
434	0.21
435	0.22
436	0.26
437	0.31
438	0.37
439	0.43
440	0.44
441	0.44
442	0.45
443	0.47
444	0.46
445	0.41
446	0.37
447	0.31
448	0.26
449	0.23
450	0.2
451	0.19
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.14
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.14
467	0.12
468	0.11
469	0.12
470	0.1
471	0.11
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.13
476	0.15
477	0.15
478	0.17
479	0.17
480	0.2
481	0.24
482	0.27
483	0.27
484	0.28
485	0.32
486	0.32
487	0.34
488	0.33
489	0.3
490	0.32
491	0.35
492	0.35
493	0.31
494	0.31
495	0.29
496	0.3
497	0.31
498	0.26
499	0.23
500	0.25
501	0.27
502	0.25
503	0.23
504	0.19
505	0.22
506	0.24
507	0.23
508	0.2
509	0.2
510	0.21
511	0.26
512	0.28
513	0.24
514	0.28
515	0.33
516	0.34
517	0.36
518	0.34
519	0.31
520	0.31
521	0.36
522	0.37
523	0.38
524	0.44
525	0.5
526	0.58
527	0.59
528	0.61
529	0.64
530	0.59
531	0.59
532	0.56
533	0.52
534	0.52
535	0.54
536	0.57
537	0.54
538	0.56
539	0.53
540	0.5
541	0.48
542	0.41
543	0.42
544	0.37
545	0.39
546	0.36
547	0.34
548	0.35
549	0.33
550	0.35
551	0.29
552	0.26
553	0.2
554	0.19
555	0.18
556	0.21
557	0.19
558	0.18
559	0.18
560	0.23
561	0.23
562	0.24
563	0.24
564	0.24
565	0.29
566	0.34
567	0.36
568	0.38
569	0.4
570	0.41
571	0.4
572	0.38
573	0.33
574	0.27
575	0.26
576	0.2
577	0.2
578	0.21
579	0.24
580	0.24
581	0.24
582	0.25
583	0.26
584	0.26
585	0.26
586	0.25
587	0.24
588	0.23
589	0.25
590	0.28
591	0.26
592	0.24
593	0.26
594	0.27
595	0.24
596	0.24
597	0.22
598	0.24
599	0.25
600	0.28
601	0.3
602	0.3
603	0.32
604	0.33
605	0.34
606	0.3
607	0.29
608	0.35
609	0.34
610	0.38
611	0.43
612	0.48
613	0.56
614	0.64
615	0.72
616	0.72
617	0.74
618	0.71
619	0.74
620	0.71
621	0.65
622	0.63
623	0.58
624	0.52
625	0.5
626	0.45
627	0.41
628	0.41
629	0.46
630	0.45
631	0.5
632	0.54
633	0.56
634	0.62
635	0.58
636	0.56
637	0.51
638	0.46
639	0.41
640	0.37
641	0.33
642	0.29
643	0.3
644	0.28
645	0.26
646	0.25
647	0.21
648	0.17
649	0.15
650	0.13
651	0.12
652	0.13
653	0.13
654	0.12
655	0.15
656	0.16
657	0.15
658	0.16
659	0.18
660	0.18
661	0.22
662	0.27
663	0.25
664	0.27
665	0.28
666	0.32
667	0.34
668	0.38
669	0.37
670	0.38
671	0.39
672	0.44
673	0.49
674	0.48
675	0.53
676	0.52
677	0.54
678	0.54
679	0.56
680	0.56
681	0.57
682	0.62
683	0.63
684	0.65
685	0.68
686	0.63
687	0.57
688	0.51
689	0.45
690	0.36
691	0.28
692	0.22
693	0.16
694	0.16
695	0.15
696	0.15
697	0.15
698	0.16
699	0.15
700	0.12
701	0.1
702	0.11
703	0.11
704	0.11

E3L4X2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer