Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JTR5

Protein Details
Accession E3JTR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MLPTKSASKKRKRVKVVDGSSLKTHydrophilic
102-122GDENPKKKSEKTDHTERRPKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-15SKKRKRVK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgr:PGTG_00813  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MLPTKSASKKRKRVKVVDGSSLKTKKPLGIEEYPNLEPSPEELDLEEAVFGFAPLSRSTQLDTNNSTQSALPDEDHHPQKELTQLADDQLFIFDEANQSTPGDENPKKKSEKTDHTERRPKMSERIPAWKDESTNQVSVSLTHGPSRLKKLRTLEDQDDDEKKITISGEEYEKRLRSQFEKMNPTPTWLNDRRGSKKTQQQQIDGQEGEEDEDQVGFGLDLILQSTGDLSRQKVTKKTRKGVLPRGQLQVERLRDANQAEPEKTKSSPISCLQFHPHSDILFTGSAESKRLSFFKIDGTHNPALHFVHTPDLPIQAAEFCPPSTTNVSSTVLITGHRPYFYTFDLQSCQCIKSPQGLFHKSVFSQSSQGTSLSHFKFSPQGNLVAFVGMNGLIELVDWSNNISSSQVIHSLKSNTPIKSLAWSRNGTELLTVGSNAEVSIWDLRMNKILGSWMDDGGFKPTKISTTDQDSGRLAQDSSSYTAVGSQTGIVNLYSDLNSSPSSFVDSFQNPRKPFKTVGNLTTSINRIQFNPDGQMLGISSQVKKDSFKLVHVKSGTVFSNWPTSNTPLGHVIDFDFNSNSKYLVTGNNRGKVLLYSLKFWE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.91
3 0.87
4 0.87
5 0.82
6 0.76
7 0.75
8 0.69
9 0.59
10 0.53
11 0.49
12 0.43
13 0.43
14 0.46
15 0.44
16 0.48
17 0.54
18 0.54
19 0.57
20 0.53
21 0.49
22 0.42
23 0.34
24 0.26
25 0.21
26 0.22
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.12
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.21
47 0.25
48 0.29
49 0.33
50 0.35
51 0.37
52 0.36
53 0.35
54 0.31
55 0.28
56 0.26
57 0.23
58 0.19
59 0.2
60 0.23
61 0.3
62 0.36
63 0.35
64 0.34
65 0.32
66 0.33
67 0.35
68 0.33
69 0.27
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.24
74 0.22
75 0.16
76 0.15
77 0.14
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.2
90 0.25
91 0.31
92 0.37
93 0.45
94 0.48
95 0.51
96 0.6
97 0.61
98 0.66
99 0.66
100 0.71
101 0.74
102 0.81
103 0.87
104 0.8
105 0.78
106 0.75
107 0.71
108 0.68
109 0.65
110 0.63
111 0.59
112 0.66
113 0.59
114 0.57
115 0.57
116 0.5
117 0.45
118 0.39
119 0.4
120 0.34
121 0.34
122 0.3
123 0.27
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.21
128 0.17
129 0.18
130 0.2
131 0.22
132 0.27
133 0.36
134 0.4
135 0.38
136 0.43
137 0.49
138 0.54
139 0.59
140 0.63
141 0.59
142 0.56
143 0.57
144 0.55
145 0.51
146 0.44
147 0.36
148 0.29
149 0.23
150 0.19
151 0.16
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.19
156 0.2
157 0.23
158 0.26
159 0.27
160 0.28
161 0.29
162 0.31
163 0.27
164 0.34
165 0.39
166 0.43
167 0.51
168 0.51
169 0.56
170 0.52
171 0.52
172 0.46
173 0.4
174 0.41
175 0.36
176 0.41
177 0.39
178 0.46
179 0.49
180 0.51
181 0.56
182 0.54
183 0.58
184 0.62
185 0.64
186 0.62
187 0.6
188 0.63
189 0.61
190 0.58
191 0.49
192 0.4
193 0.31
194 0.26
195 0.23
196 0.16
197 0.11
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.12
218 0.16
219 0.19
220 0.26
221 0.37
222 0.45
223 0.53
224 0.59
225 0.62
226 0.67
227 0.74
228 0.76
229 0.75
230 0.74
231 0.69
232 0.66
233 0.6
234 0.53
235 0.47
236 0.43
237 0.36
238 0.29
239 0.24
240 0.22
241 0.23
242 0.24
243 0.24
244 0.23
245 0.24
246 0.23
247 0.25
248 0.25
249 0.25
250 0.24
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.23
255 0.25
256 0.27
257 0.26
258 0.28
259 0.3
260 0.31
261 0.3
262 0.29
263 0.26
264 0.21
265 0.2
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.16
282 0.2
283 0.22
284 0.23
285 0.29
286 0.31
287 0.3
288 0.3
289 0.25
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.15
328 0.17
329 0.15
330 0.16
331 0.18
332 0.18
333 0.2
334 0.19
335 0.19
336 0.16
337 0.17
338 0.16
339 0.21
340 0.23
341 0.27
342 0.34
343 0.36
344 0.37
345 0.38
346 0.4
347 0.32
348 0.34
349 0.28
350 0.21
351 0.2
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.14
357 0.15
358 0.21
359 0.19
360 0.21
361 0.18
362 0.18
363 0.24
364 0.25
365 0.28
366 0.23
367 0.25
368 0.23
369 0.25
370 0.24
371 0.18
372 0.16
373 0.11
374 0.09
375 0.06
376 0.05
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.18
397 0.22
398 0.23
399 0.29
400 0.33
401 0.27
402 0.29
403 0.3
404 0.27
405 0.3
406 0.34
407 0.33
408 0.34
409 0.35
410 0.34
411 0.38
412 0.38
413 0.31
414 0.26
415 0.2
416 0.15
417 0.13
418 0.12
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.16
432 0.16
433 0.14
434 0.13
435 0.16
436 0.14
437 0.18
438 0.18
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.16
443 0.19
444 0.21
445 0.16
446 0.16
447 0.16
448 0.18
449 0.21
450 0.24
451 0.22
452 0.29
453 0.35
454 0.34
455 0.36
456 0.35
457 0.33
458 0.31
459 0.28
460 0.2
461 0.15
462 0.16
463 0.15
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.13
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.11
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.11
488 0.16
489 0.16
490 0.17
491 0.21
492 0.24
493 0.3
494 0.39
495 0.47
496 0.44
497 0.52
498 0.53
499 0.51
500 0.52
501 0.54
502 0.56
503 0.54
504 0.57
505 0.56
506 0.55
507 0.52
508 0.52
509 0.45
510 0.38
511 0.35
512 0.3
513 0.25
514 0.29
515 0.31
516 0.28
517 0.3
518 0.27
519 0.24
520 0.23
521 0.23
522 0.17
523 0.14
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.16
528 0.19
529 0.2
530 0.22
531 0.25
532 0.31
533 0.31
534 0.38
535 0.46
536 0.45
537 0.51
538 0.5
539 0.49
540 0.41
541 0.43
542 0.37
543 0.29
544 0.28
545 0.22
546 0.3
547 0.28
548 0.3
549 0.29
550 0.31
551 0.35
552 0.34
553 0.35
554 0.31
555 0.33
556 0.3
557 0.27
558 0.25
559 0.25
560 0.24
561 0.24
562 0.2
563 0.19
564 0.2
565 0.2
566 0.18
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.21
571 0.28
572 0.36
573 0.44
574 0.5
575 0.5
576 0.49
577 0.48
578 0.4
579 0.39
580 0.38
581 0.32