Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JXY9

Protein Details
Accession E3JXY9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
761-782PREDRKSISRRHSHNSERDRSEBasic
810-840EKEILHKSSKSRHRHRARSKSKDPVEHRSSCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
627-627R
814-831LHKSSKSRHRHRARSKSK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007854  Fip1_dom  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
KEGG pgr:PGTG_02375  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05182  Fip1  
Amino Acid Sequences MDDPPPKKLGLEVRATPPFSRFHARQGRAQLPSIQNEQLQKRFHPIPNVPKTTGEVGKPAGGQLVQPAVEPTRAPLNLPGKPISPVPATIPTTTEQVHRAFELASNALIPPEPLPIPLPSHPVEPATAPVTQAPPIQATIDKHSQNQSIDIDGTGMVDEEEEVGDEQGLLEDSDEDLDIILEGDTSVAPTAPPSRPSTQPLRFETPQDSVPLVRSNEQLNVTTEYKPLERVDLKLVDPASLLPLKPSPMPVAQPTPSPRHTPHHNSHNRLPTPENFPAPGTPPPQPPGELKPPDLQADNPVIPSGYDDKDGSALMNFDFDALPESEKGWKKPGAHLADWFNYGFDKTTWRTYVMKQKRLRKEEGWAANPFVAFAMGNVEQAWAGLPPELKGVMMGIIMGNLLGSRNNNHAPQMPRSVPPMMVMNPMMQGMEMGGYVIKQDPGGASEQTEDLSALYGDDMDPREQHHHEQQRMQDQMRHMQHMNHMGMGAGFMPGMDLAAMFGNPDHPMFMNGPSFNGMMEMPHMQHIPAQMQQQQQQQQQQQTQQQPIGLGPSINMTKPPSLNSTPIFTPVNPVQTIQTGTRPNSPGILPPISSSTAGPATHTATPGDSPGLLAMPSPASARGRGARPGGRGRGNTQASAFMAAAAARGWGRVISASNSVTTLAPVPAIPLLSPKIDPPVQATLATAIPVATTPVSSCASVRPVSPLPLNVPTGPRRAAPASGAPPPRGPHGVPGGYFDKDAAGGREDAGLDYGGGGGDSPREDRKSISRRHSHNSERDRSEKDSQRFERGEDPADRSRSKSRDKELVDEKEILHKSSKSRHRHRARSKSKDPVEHRSSCEKGDKEKDETGHKPSKYANGEKESAESSGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.52
4 0.46
5 0.42
6 0.4
7 0.44
8 0.38
9 0.42
10 0.5
11 0.53
12 0.57
13 0.63
14 0.66
15 0.61
16 0.62
17 0.6
18 0.55
19 0.56
20 0.54
21 0.47
22 0.43
23 0.47
24 0.51
25 0.5
26 0.48
27 0.45
28 0.48
29 0.53
30 0.54
31 0.57
32 0.58
33 0.62
34 0.69
35 0.73
36 0.67
37 0.61
38 0.6
39 0.57
40 0.53
41 0.43
42 0.37
43 0.32
44 0.33
45 0.31
46 0.28
47 0.23
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.18
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.21
60 0.21
61 0.22
62 0.28
63 0.34
64 0.36
65 0.4
66 0.4
67 0.34
68 0.36
69 0.36
70 0.32
71 0.27
72 0.24
73 0.25
74 0.3
75 0.32
76 0.3
77 0.31
78 0.28
79 0.29
80 0.28
81 0.27
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.21
90 0.18
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.11
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.15
103 0.2
104 0.21
105 0.25
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.2
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.18
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.25
127 0.31
128 0.31
129 0.34
130 0.38
131 0.4
132 0.38
133 0.39
134 0.33
135 0.28
136 0.27
137 0.23
138 0.19
139 0.14
140 0.13
141 0.09
142 0.08
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.11
178 0.13
179 0.17
180 0.22
181 0.26
182 0.3
183 0.36
184 0.44
185 0.47
186 0.52
187 0.55
188 0.58
189 0.55
190 0.55
191 0.54
192 0.47
193 0.4
194 0.35
195 0.29
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.22
200 0.21
201 0.22
202 0.22
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.22
207 0.26
208 0.26
209 0.25
210 0.24
211 0.22
212 0.21
213 0.22
214 0.2
215 0.21
216 0.21
217 0.22
218 0.27
219 0.27
220 0.27
221 0.28
222 0.28
223 0.21
224 0.2
225 0.18
226 0.16
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.19
237 0.21
238 0.25
239 0.24
240 0.29
241 0.32
242 0.35
243 0.35
244 0.38
245 0.38
246 0.39
247 0.47
248 0.51
249 0.54
250 0.59
251 0.65
252 0.67
253 0.71
254 0.74
255 0.67
256 0.62
257 0.57
258 0.5
259 0.5
260 0.47
261 0.41
262 0.32
263 0.31
264 0.3
265 0.29
266 0.29
267 0.24
268 0.24
269 0.25
270 0.27
271 0.27
272 0.27
273 0.27
274 0.3
275 0.36
276 0.35
277 0.35
278 0.37
279 0.37
280 0.37
281 0.35
282 0.29
283 0.23
284 0.24
285 0.22
286 0.18
287 0.16
288 0.14
289 0.13
290 0.15
291 0.15
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.08
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.16
313 0.18
314 0.2
315 0.22
316 0.26
317 0.27
318 0.32
319 0.4
320 0.39
321 0.37
322 0.4
323 0.4
324 0.37
325 0.37
326 0.31
327 0.23
328 0.17
329 0.16
330 0.13
331 0.09
332 0.12
333 0.12
334 0.16
335 0.17
336 0.2
337 0.22
338 0.27
339 0.37
340 0.42
341 0.49
342 0.52
343 0.61
344 0.68
345 0.71
346 0.72
347 0.64
348 0.61
349 0.61
350 0.61
351 0.55
352 0.47
353 0.42
354 0.37
355 0.34
356 0.27
357 0.18
358 0.11
359 0.07
360 0.05
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.02
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.14
396 0.19
397 0.21
398 0.24
399 0.28
400 0.27
401 0.26
402 0.28
403 0.28
404 0.23
405 0.2
406 0.2
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.08
449 0.12
450 0.14
451 0.17
452 0.24
453 0.3
454 0.33
455 0.37
456 0.4
457 0.43
458 0.45
459 0.43
460 0.38
461 0.32
462 0.38
463 0.35
464 0.35
465 0.29
466 0.27
467 0.29
468 0.32
469 0.3
470 0.22
471 0.2
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.1
476 0.04
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.07
495 0.08
496 0.1
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.13
502 0.11
503 0.11
504 0.09
505 0.06
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.11
515 0.13
516 0.15
517 0.19
518 0.22
519 0.27
520 0.32
521 0.37
522 0.39
523 0.43
524 0.46
525 0.47
526 0.48
527 0.49
528 0.5
529 0.5
530 0.49
531 0.43
532 0.39
533 0.33
534 0.29
535 0.25
536 0.18
537 0.12
538 0.09
539 0.11
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.14
545 0.14
546 0.16
547 0.19
548 0.21
549 0.24
550 0.24
551 0.26
552 0.24
553 0.26
554 0.25
555 0.19
556 0.22
557 0.21
558 0.24
559 0.2
560 0.21
561 0.18
562 0.19
563 0.21
564 0.17
565 0.21
566 0.21
567 0.22
568 0.28
569 0.29
570 0.27
571 0.27
572 0.26
573 0.24
574 0.25
575 0.25
576 0.19
577 0.18
578 0.2
579 0.19
580 0.19
581 0.16
582 0.14
583 0.15
584 0.15
585 0.15
586 0.14
587 0.15
588 0.16
589 0.17
590 0.14
591 0.12
592 0.13
593 0.13
594 0.12
595 0.09
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.07
605 0.09
606 0.1
607 0.11
608 0.14
609 0.18
610 0.2
611 0.23
612 0.28
613 0.3
614 0.34
615 0.4
616 0.44
617 0.44
618 0.44
619 0.43
620 0.47
621 0.45
622 0.41
623 0.35
624 0.31
625 0.26
626 0.25
627 0.22
628 0.12
629 0.11
630 0.09
631 0.09
632 0.06
633 0.07
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.08
641 0.09
642 0.13
643 0.13
644 0.14
645 0.14
646 0.15
647 0.14
648 0.13
649 0.12
650 0.09
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.09
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.12
662 0.18
663 0.18
664 0.19
665 0.2
666 0.24
667 0.24
668 0.23
669 0.23
670 0.19
671 0.18
672 0.18
673 0.14
674 0.08
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.09
682 0.11
683 0.11
684 0.12
685 0.13
686 0.17
687 0.18
688 0.18
689 0.21
690 0.21
691 0.25
692 0.26
693 0.25
694 0.25
695 0.29
696 0.31
697 0.27
698 0.3
699 0.3
700 0.33
701 0.32
702 0.29
703 0.29
704 0.29
705 0.29
706 0.26
707 0.3
708 0.29
709 0.36
710 0.38
711 0.36
712 0.37
713 0.37
714 0.38
715 0.35
716 0.32
717 0.3
718 0.34
719 0.35
720 0.32
721 0.35
722 0.34
723 0.31
724 0.31
725 0.25
726 0.18
727 0.16
728 0.17
729 0.14
730 0.13
731 0.12
732 0.13
733 0.14
734 0.14
735 0.13
736 0.12
737 0.1
738 0.08
739 0.08
740 0.07
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.05
746 0.07
747 0.1
748 0.15
749 0.18
750 0.19
751 0.22
752 0.33
753 0.41
754 0.49
755 0.57
756 0.61
757 0.65
758 0.73
759 0.8
760 0.79
761 0.8
762 0.81
763 0.8
764 0.78
765 0.77
766 0.73
767 0.7
768 0.7
769 0.7
770 0.66
771 0.67
772 0.65
773 0.68
774 0.64
775 0.61
776 0.59
777 0.52
778 0.52
779 0.46
780 0.48
781 0.47
782 0.51
783 0.5
784 0.47
785 0.53
786 0.54
787 0.59
788 0.62
789 0.62
790 0.65
791 0.67
792 0.72
793 0.72
794 0.72
795 0.66
796 0.6
797 0.54
798 0.53
799 0.51
800 0.44
801 0.39
802 0.35
803 0.37
804 0.44
805 0.53
806 0.55
807 0.64
808 0.73
809 0.79
810 0.86
811 0.91
812 0.92
813 0.94
814 0.94
815 0.93
816 0.93
817 0.91
818 0.9
819 0.86
820 0.85
821 0.82
822 0.78
823 0.74
824 0.73
825 0.67
826 0.61
827 0.63
828 0.57
829 0.58
830 0.61
831 0.61
832 0.59
833 0.62
834 0.62
835 0.61
836 0.62
837 0.62
838 0.61
839 0.55
840 0.52
841 0.51
842 0.56
843 0.56
844 0.59
845 0.59
846 0.58
847 0.6
848 0.57
849 0.56
850 0.48