Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2A3

Protein Details
Accession C4R2A3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-273PLDTRHTKAKLSKKHRKKDYKFPASWNRPEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-260KAKLSKKHRKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039848  Ribosomal_S24/S35  
IPR019349  Ribosomal_S24/S35_mit  
IPR017081  Ribosomal_S24_mit  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0487  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10213  MRP-S28  
Amino Acid Sequences MHRVVRNFHQAVRLLQETPLFLTPEKWKGLPSEKIFQLYQERVLSLGPKYTKDKHELEALLSTSKDTGFTYRQIQKIYEGGEISAYEVERKSVADDFKPQPFMFDDYPSQAHDLIDEHREQRYYNRVAAYELPQLAKFRQEFKKPSPTEKPLRFRYTTYLGESHPAERKVVLECRVSDLQLGPKESHKFKLLASVRYDHSTGLFKMSSDRFPEPTQNAKYLTQMFNRLLAESKNLKDSFEDVPLDTRHTKAKLSKKHRKKDYKFPASWNRPEDAPKPSMDVFREIYQQQKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.31
4 0.26
5 0.26
6 0.25
7 0.21
8 0.18
9 0.22
10 0.26
11 0.3
12 0.32
13 0.3
14 0.29
15 0.34
16 0.42
17 0.46
18 0.46
19 0.49
20 0.48
21 0.51
22 0.5
23 0.47
24 0.47
25 0.4
26 0.4
27 0.33
28 0.3
29 0.27
30 0.27
31 0.26
32 0.19
33 0.23
34 0.2
35 0.22
36 0.28
37 0.34
38 0.39
39 0.43
40 0.45
41 0.42
42 0.47
43 0.44
44 0.4
45 0.37
46 0.33
47 0.28
48 0.24
49 0.22
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.1
54 0.13
55 0.14
56 0.17
57 0.25
58 0.31
59 0.34
60 0.35
61 0.35
62 0.33
63 0.34
64 0.33
65 0.27
66 0.21
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.15
81 0.15
82 0.22
83 0.25
84 0.28
85 0.32
86 0.3
87 0.28
88 0.28
89 0.3
90 0.24
91 0.24
92 0.21
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.17
109 0.23
110 0.23
111 0.25
112 0.25
113 0.24
114 0.25
115 0.27
116 0.26
117 0.21
118 0.2
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.16
125 0.2
126 0.25
127 0.31
128 0.35
129 0.4
130 0.5
131 0.48
132 0.53
133 0.54
134 0.55
135 0.58
136 0.61
137 0.64
138 0.61
139 0.65
140 0.59
141 0.53
142 0.51
143 0.48
144 0.41
145 0.36
146 0.31
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.24
151 0.23
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.21
158 0.22
159 0.2
160 0.19
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.21
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.22
169 0.18
170 0.22
171 0.27
172 0.28
173 0.3
174 0.27
175 0.25
176 0.24
177 0.33
178 0.33
179 0.33
180 0.34
181 0.35
182 0.34
183 0.35
184 0.35
185 0.25
186 0.23
187 0.21
188 0.18
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.24
196 0.26
197 0.26
198 0.28
199 0.35
200 0.34
201 0.4
202 0.4
203 0.38
204 0.39
205 0.36
206 0.38
207 0.38
208 0.38
209 0.32
210 0.35
211 0.32
212 0.33
213 0.33
214 0.29
215 0.26
216 0.22
217 0.25
218 0.25
219 0.26
220 0.29
221 0.29
222 0.29
223 0.28
224 0.31
225 0.27
226 0.26
227 0.26
228 0.19
229 0.24
230 0.24
231 0.28
232 0.26
233 0.25
234 0.27
235 0.27
236 0.32
237 0.36
238 0.45
239 0.51
240 0.61
241 0.7
242 0.75
243 0.84
244 0.89
245 0.92
246 0.9
247 0.91
248 0.91
249 0.91
250 0.86
251 0.85
252 0.86
253 0.84
254 0.84
255 0.77
256 0.68
257 0.6
258 0.61
259 0.55
260 0.51
261 0.44
262 0.37
263 0.38
264 0.38
265 0.41
266 0.37
267 0.38
268 0.35
269 0.35
270 0.39
271 0.35