FuNGI

H6QT40

Protein Details

Accession

H6QT40

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
350-372	HLLSKCPHPRRPNFNRPPHMVKP	Hydrophilic
429-453	GRKPDWYRPDYRKQQQPQSSHKPSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2

Family & Domain DBs

KEGG	pgr:PGTG_21936 -
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MSDSPPQNTRSFLPNDNPWSNERFGPTANMVNAEGAASSSHHRSRSRGVSSAQDRRVLEDVPGDIRRNVPIYTEDDVDRFLQANQFHGKTVGQVVQNQISRMSSAEKLKPDGSNFSTWEMFMRERVRELFSDPLWYSKACTDQFQEQVGRSLLLATVDTALVRNLLKQKTCRDMYHHLASRFNTISRAEQMMTWQKLTAFKFSDYNSSSEAMGTLIELLDNFADLDLDLTRETIGGLVLQSSIEAGSELRREVDRRVEQDMCSGSRTMARKAVTPDHILKHIDISRNHIELNSSKPDVFSAKPQLPPPLASLSDESKEYYDPSQWQDQIGQVSGLATYGLQCWNCRSSDHLLSKCPHPRRPNFNRPPHMVKPTPRQFLPGRGGPPLTTPGNFQAWYPIVTPPGYVNQGYQSHPSPYSPQPPGSSGPALGRKPDWYRPDYRKQQQPQSSHKPSPRPSANQVEPDAAGPPDQLHPPHHLDHQHQQHPSHYEPPVHQPSPMEPVTRMIEIGRLDDVDDDQFQPRFRQLTVAEGDEPVLDTGATHHLTGQRSGEFIISEPEWANGNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.55
3	0.55
4	0.55
5	0.51
6	0.51
7	0.47
8	0.44
9	0.39
10	0.33
11	0.31
12	0.32
13	0.33
14	0.33
15	0.31
16	0.3
17	0.27
18	0.24
19	0.23
20	0.18
21	0.15
22	0.09
23	0.09
24	0.08
25	0.11
26	0.17
27	0.21
28	0.27
29	0.29
30	0.33
31	0.42
32	0.5
33	0.52
34	0.52
35	0.5
36	0.55
37	0.62
38	0.67
39	0.62
40	0.59
41	0.54
42	0.52
43	0.52
44	0.42
45	0.34
46	0.28
47	0.26
48	0.25
49	0.29
50	0.27
51	0.26
52	0.26
53	0.28
54	0.27
55	0.25
56	0.22
57	0.21
58	0.24
59	0.26
60	0.27
61	0.24
62	0.23
63	0.24
64	0.23
65	0.2
66	0.16
67	0.14
68	0.16
69	0.16
70	0.2
71	0.24
72	0.24
73	0.24
74	0.25
75	0.24
76	0.21
77	0.24
78	0.24
79	0.21
80	0.23
81	0.26
82	0.31
83	0.33
84	0.31
85	0.28
86	0.24
87	0.22
88	0.21
89	0.2
90	0.19
91	0.23
92	0.28
93	0.3
94	0.33
95	0.36
96	0.38
97	0.37
98	0.39
99	0.36
100	0.35
101	0.34
102	0.34
103	0.31
104	0.28
105	0.27
106	0.23
107	0.2
108	0.22
109	0.24
110	0.22
111	0.24
112	0.26
113	0.27
114	0.25
115	0.27
116	0.27
117	0.23
118	0.28
119	0.25
120	0.25
121	0.24
122	0.23
123	0.22
124	0.2
125	0.26
126	0.21
127	0.24
128	0.25
129	0.3
130	0.32
131	0.34
132	0.34
133	0.28
134	0.3
135	0.28
136	0.24
137	0.18
138	0.16
139	0.12
140	0.1
141	0.1
142	0.07
143	0.07
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.07
150	0.1
151	0.16
152	0.2
153	0.24
154	0.29
155	0.35
156	0.42
157	0.46
158	0.45
159	0.45
160	0.49
161	0.52
162	0.56
163	0.57
164	0.5
165	0.5
166	0.48
167	0.47
168	0.4
169	0.34
170	0.27
171	0.22
172	0.23
173	0.22
174	0.23
175	0.18
176	0.17
177	0.21
178	0.27
179	0.27
180	0.25
181	0.22
182	0.22
183	0.27
184	0.28
185	0.28
186	0.22
187	0.22
188	0.25
189	0.25
190	0.31
191	0.27
192	0.27
193	0.24
194	0.23
195	0.21
196	0.18
197	0.17
198	0.1
199	0.08
200	0.06
201	0.05
202	0.04
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.2
241	0.22
242	0.24
243	0.29
244	0.29
245	0.28
246	0.3
247	0.3
248	0.23
249	0.2
250	0.18
251	0.13
252	0.16
253	0.18
254	0.16
255	0.19
256	0.19
257	0.2
258	0.23
259	0.28
260	0.26
261	0.28
262	0.3
263	0.27
264	0.29
265	0.27
266	0.23
267	0.23
268	0.23
269	0.25
270	0.22
271	0.26
272	0.27
273	0.27
274	0.27
275	0.23
276	0.21
277	0.18
278	0.22
279	0.19
280	0.17
281	0.16
282	0.16
283	0.17
284	0.18
285	0.17
286	0.17
287	0.2
288	0.23
289	0.26
290	0.27
291	0.3
292	0.28
293	0.28
294	0.26
295	0.22
296	0.19
297	0.17
298	0.18
299	0.17
300	0.17
301	0.16
302	0.14
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.16
310	0.2
311	0.2
312	0.2
313	0.2
314	0.21
315	0.19
316	0.17
317	0.14
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.05
323	0.03
324	0.03
325	0.05
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.1
330	0.13
331	0.13
332	0.13
333	0.16
334	0.2
335	0.28
336	0.35
337	0.35
338	0.38
339	0.4
340	0.46
341	0.51
342	0.52
343	0.51
344	0.53
345	0.59
346	0.65
347	0.74
348	0.78
349	0.8
350	0.84
351	0.84
352	0.81
353	0.81
354	0.76
355	0.73
356	0.67
357	0.64
358	0.64
359	0.65
360	0.64
361	0.55
362	0.55
363	0.49
364	0.51
365	0.5
366	0.44
367	0.37
368	0.35
369	0.35
370	0.3
371	0.3
372	0.26
373	0.22
374	0.18
375	0.17
376	0.19
377	0.21
378	0.21
379	0.19
380	0.2
381	0.19
382	0.2
383	0.2
384	0.18
385	0.17
386	0.17
387	0.17
388	0.13
389	0.16
390	0.17
391	0.15
392	0.15
393	0.19
394	0.21
395	0.23
396	0.25
397	0.23
398	0.24
399	0.25
400	0.25
401	0.25
402	0.28
403	0.34
404	0.34
405	0.35
406	0.34
407	0.36
408	0.38
409	0.37
410	0.32
411	0.26
412	0.28
413	0.32
414	0.3
415	0.29
416	0.28
417	0.3
418	0.34
419	0.4
420	0.41
421	0.4
422	0.48
423	0.54
424	0.64
425	0.69
426	0.73
427	0.75
428	0.77
429	0.82
430	0.81
431	0.81
432	0.81
433	0.81
434	0.81
435	0.79
436	0.77
437	0.76
438	0.74
439	0.76
440	0.74
441	0.7
442	0.68
443	0.7
444	0.69
445	0.66
446	0.62
447	0.53
448	0.45
449	0.39
450	0.33
451	0.23
452	0.18
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.15
457	0.16
458	0.17
459	0.23
460	0.27
461	0.29
462	0.33
463	0.36
464	0.39
465	0.47
466	0.54
467	0.56
468	0.56
469	0.55
470	0.55
471	0.55
472	0.53
473	0.51
474	0.45
475	0.42
476	0.41
477	0.49
478	0.52
479	0.47
480	0.45
481	0.4
482	0.39
483	0.42
484	0.41
485	0.33
486	0.25
487	0.29
488	0.3
489	0.29
490	0.26
491	0.19
492	0.21
493	0.19
494	0.2
495	0.17
496	0.14
497	0.14
498	0.14
499	0.15
500	0.13
501	0.15
502	0.15
503	0.17
504	0.2
505	0.21
506	0.23
507	0.26
508	0.26
509	0.24
510	0.29
511	0.26
512	0.32
513	0.34
514	0.35
515	0.31
516	0.29
517	0.29
518	0.23
519	0.23
520	0.15
521	0.12
522	0.08
523	0.07
524	0.08
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.16
529	0.21
530	0.24
531	0.27
532	0.28
533	0.24
534	0.24
535	0.25
536	0.23
537	0.18
538	0.17
539	0.19
540	0.15
541	0.17
542	0.16
543	0.17

H6QT40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer