Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

H6QR62

Protein Details
Accession H6QR62    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-94DEPSSLPKKSRSKVPRSGGKSVASKIKQRTLRQQEEARQKDLPKPKHSKKATSEQSDSHydrophilic
644-672KAKGIHVTRPNPEKKRSKKHEDDQPDATEBasic
684-715PTLTEKVNSKKHQRDEQDGKEKKKKKTKVKASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-86PKKSRSKVPRSGGKSVASKIKQRTLRQQEEARQKDLPKPKHSKK
652-662RPNPEKKRSKK
701-715DGKEKKKKKTKVKAS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031341  Methyltr_RsmF_N  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR011023  Nop2p  
IPR023267  RCMT  
IPR023273  RCMT_NOP2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0009383  F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
KEGG pgr:PGTG_21386  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PF17125  Methyltr_RsmF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MGGFGFKSRHKQSAPEPLRVKGQSKDPKKIDAEVAADEPSSLPKKSRSKVPRSGGKSVASKIKQRTLRQQEEARQKDLPKPKHSKKATSEQSDSDSDDGSDKDEDDENGNEDEEHVDEGLEEARKAFFSTKDLVEPHNDMDSADDQSDFQSASGSSHSHAESIEELNESEAGDGIEGSAIPDDEDDEEDNDDEASEGSDMVGEGSNDEEDEDENALDADIMNHNKGVPDLRKLYSRIQESVRVLGNWSVLGKKAKGKSRADVTEQTLNDVCEYFGYNAFLSDLLWQLFDPEEALAFFEANETARPVTIRTNTLRTNRRDLAQSLINRGVNLEPIGKWSKVGLQVFESSVPIGATPEYLAGHYMLQAASSFLPVIALDPQPGEKCLDMSAAPGGKTTFMSAMMKNTGKLFANDSSKARCKSLMANVSRMGCHNVIISNHDARDFPKVMGGFNRVLLDAPCSGTGVISKDASVKNNKSEKDLLLLSHLQKQLILSAIDSVSPHSTNGGYLVYSTCSVTVEENESVVDYALKKRPNVKLVETGIGFGKEGFVRFRGKIFNPSLKMTRRFYPHVHNVDGFFVAKLKVNPKAKTAPIQEEEEDDVEETLSQDDIPDKKQKASKAKDEPVAFDDSEDAEIIASAKISQLKAKGIHVTRPNPEKKRSKKHEDDQPDATEKKQAAKQQSDGPTLTEKVNSKKHQRDEQDGKEKKKKKTKVKAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.62
4 0.57
5 0.63
6 0.61
7 0.57
8 0.5
9 0.56
10 0.56
11 0.61
12 0.69
13 0.64
14 0.68
15 0.67
16 0.67
17 0.61
18 0.56
19 0.5
20 0.43
21 0.41
22 0.33
23 0.29
24 0.25
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.18
29 0.2
30 0.28
31 0.38
32 0.44
33 0.54
34 0.59
35 0.66
36 0.75
37 0.81
38 0.83
39 0.8
40 0.82
41 0.77
42 0.73
43 0.68
44 0.63
45 0.63
46 0.58
47 0.58
48 0.58
49 0.61
50 0.63
51 0.65
52 0.71
53 0.72
54 0.76
55 0.77
56 0.78
57 0.79
58 0.81
59 0.79
60 0.72
61 0.66
62 0.61
63 0.61
64 0.63
65 0.62
66 0.62
67 0.68
68 0.73
69 0.79
70 0.83
71 0.84
72 0.81
73 0.83
74 0.83
75 0.81
76 0.76
77 0.68
78 0.65
79 0.58
80 0.51
81 0.41
82 0.32
83 0.24
84 0.21
85 0.18
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.14
114 0.13
115 0.16
116 0.2
117 0.21
118 0.25
119 0.27
120 0.27
121 0.29
122 0.3
123 0.28
124 0.25
125 0.23
126 0.19
127 0.2
128 0.2
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.16
214 0.15
215 0.19
216 0.24
217 0.25
218 0.29
219 0.32
220 0.38
221 0.39
222 0.4
223 0.38
224 0.36
225 0.41
226 0.38
227 0.39
228 0.34
229 0.27
230 0.25
231 0.22
232 0.2
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.2
240 0.26
241 0.33
242 0.4
243 0.43
244 0.46
245 0.52
246 0.54
247 0.53
248 0.52
249 0.49
250 0.47
251 0.43
252 0.4
253 0.33
254 0.29
255 0.24
256 0.19
257 0.15
258 0.08
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.11
294 0.13
295 0.17
296 0.19
297 0.24
298 0.28
299 0.36
300 0.43
301 0.43
302 0.48
303 0.46
304 0.45
305 0.43
306 0.39
307 0.36
308 0.34
309 0.31
310 0.27
311 0.29
312 0.27
313 0.24
314 0.23
315 0.19
316 0.14
317 0.13
318 0.11
319 0.07
320 0.11
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.15
326 0.19
327 0.2
328 0.17
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.14
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.14
394 0.15
395 0.16
396 0.17
397 0.2
398 0.22
399 0.23
400 0.26
401 0.31
402 0.32
403 0.3
404 0.26
405 0.24
406 0.26
407 0.32
408 0.35
409 0.32
410 0.34
411 0.35
412 0.36
413 0.34
414 0.3
415 0.25
416 0.17
417 0.16
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.14
422 0.17
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.16
427 0.15
428 0.2
429 0.19
430 0.16
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.2
435 0.22
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.14
440 0.15
441 0.14
442 0.13
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.13
455 0.15
456 0.19
457 0.25
458 0.26
459 0.33
460 0.39
461 0.39
462 0.4
463 0.41
464 0.38
465 0.35
466 0.34
467 0.25
468 0.23
469 0.27
470 0.24
471 0.27
472 0.28
473 0.23
474 0.22
475 0.22
476 0.19
477 0.17
478 0.16
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.09
491 0.1
492 0.09
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.13
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.08
513 0.13
514 0.18
515 0.21
516 0.24
517 0.31
518 0.38
519 0.43
520 0.47
521 0.46
522 0.49
523 0.49
524 0.51
525 0.43
526 0.38
527 0.32
528 0.28
529 0.23
530 0.15
531 0.14
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.13
536 0.17
537 0.18
538 0.21
539 0.25
540 0.27
541 0.34
542 0.39
543 0.45
544 0.44
545 0.48
546 0.52
547 0.54
548 0.58
549 0.53
550 0.53
551 0.51
552 0.52
553 0.52
554 0.55
555 0.57
556 0.57
557 0.57
558 0.52
559 0.47
560 0.44
561 0.4
562 0.31
563 0.21
564 0.16
565 0.14
566 0.15
567 0.17
568 0.2
569 0.27
570 0.34
571 0.36
572 0.41
573 0.47
574 0.48
575 0.53
576 0.55
577 0.54
578 0.51
579 0.53
580 0.47
581 0.43
582 0.42
583 0.34
584 0.28
585 0.2
586 0.17
587 0.12
588 0.12
589 0.09
590 0.07
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.11
595 0.13
596 0.18
597 0.25
598 0.27
599 0.33
600 0.38
601 0.46
602 0.53
603 0.59
604 0.65
605 0.67
606 0.73
607 0.74
608 0.72
609 0.67
610 0.59
611 0.55
612 0.45
613 0.34
614 0.28
615 0.21
616 0.2
617 0.16
618 0.13
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.07
623 0.06
624 0.05
625 0.08
626 0.12
627 0.13
628 0.17
629 0.19
630 0.24
631 0.27
632 0.31
633 0.37
634 0.37
635 0.44
636 0.49
637 0.53
638 0.56
639 0.64
640 0.7
641 0.69
642 0.76
643 0.78
644 0.8
645 0.85
646 0.87
647 0.87
648 0.88
649 0.9
650 0.91
651 0.89
652 0.86
653 0.81
654 0.77
655 0.73
656 0.63
657 0.54
658 0.5
659 0.42
660 0.42
661 0.41
662 0.42
663 0.45
664 0.5
665 0.54
666 0.57
667 0.63
668 0.6
669 0.56
670 0.51
671 0.47
672 0.42
673 0.39
674 0.35
675 0.33
676 0.37
677 0.46
678 0.52
679 0.58
680 0.65
681 0.73
682 0.77
683 0.8
684 0.82
685 0.83
686 0.85
687 0.85
688 0.84
689 0.85
690 0.85
691 0.86
692 0.86
693 0.86
694 0.86
695 0.86