Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R211

Protein Details
Accession C4R211    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-73KPDSSATGSSKNKKKKSKKQTAPETSNADAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-62KNKKKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito_nucl 10.166, cyto_nucl 9.333, mito 8.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0370  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSDQSFWNSTVKFVSSHKAVITLTTIAGASTLAYLYYATNATSKPDSSATGSSKNKKKKSKKQTAPETSNADAPYPVDNEGKPQINEEIIGRLTEDEKNTWAQSLKETGNRAFKSDDYETALEYYNLALLCKKDPAFYSNSSACWACLGDNQKVIEFSTKALELKPDYAKCLMRRAAAYEKIEEYEKALYDLTVLTIYESTIADKSIQSMLERILTKQANYVMEKQLKDFVPQLPSASSIASLLGSFTEDSVSDVFGTEIPEDGSGDKFLYEALQDFKTATADSYEHADVALNQAVSKYADVTVSSDETTKRRAAMAYEYLGQFYFLKNVTAVAQEHLKRAIELSPRPRSHVILALTYIDKDLLNEAEVEFQKAMAINANDPDIYYQRGQLSYLRGDLANASENFETCKRLNPKNVYAYIQLACISYREGKIEEAVERFVQAKRTFPTSPEVPNYYGEILVDKNDTEDAIKQFDIAIKLQRSLSTVSIGALGILNKATILARRNEFPQAIELLEEAIQVDPKSELAAVQLAQIKLQLNQAEEAIVLFEKTAKLARSPEEKQHAISFAEAAKIQARVKKDPALSKRVEEIIAQAQGHQNEATAASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.3
4 0.29
5 0.29
6 0.28
7 0.27
8 0.27
9 0.21
10 0.18
11 0.16
12 0.15
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.16
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.23
34 0.24
35 0.31
36 0.31
37 0.37
38 0.45
39 0.52
40 0.59
41 0.67
42 0.72
43 0.77
44 0.84
45 0.85
46 0.89
47 0.91
48 0.92
49 0.93
50 0.95
51 0.95
52 0.91
53 0.87
54 0.82
55 0.72
56 0.66
57 0.56
58 0.45
59 0.35
60 0.28
61 0.24
62 0.19
63 0.2
64 0.18
65 0.17
66 0.21
67 0.27
68 0.31
69 0.28
70 0.29
71 0.28
72 0.26
73 0.27
74 0.23
75 0.21
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.16
84 0.18
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.2
90 0.21
91 0.25
92 0.27
93 0.29
94 0.32
95 0.35
96 0.43
97 0.42
98 0.41
99 0.37
100 0.34
101 0.37
102 0.35
103 0.33
104 0.29
105 0.29
106 0.27
107 0.26
108 0.26
109 0.19
110 0.17
111 0.14
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.2
122 0.23
123 0.26
124 0.28
125 0.33
126 0.3
127 0.3
128 0.3
129 0.28
130 0.24
131 0.2
132 0.18
133 0.12
134 0.15
135 0.18
136 0.19
137 0.23
138 0.23
139 0.23
140 0.23
141 0.23
142 0.22
143 0.18
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.19
150 0.16
151 0.21
152 0.27
153 0.25
154 0.26
155 0.3
156 0.34
157 0.33
158 0.39
159 0.37
160 0.33
161 0.33
162 0.35
163 0.38
164 0.4
165 0.4
166 0.34
167 0.33
168 0.31
169 0.31
170 0.26
171 0.21
172 0.17
173 0.15
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.21
205 0.24
206 0.22
207 0.24
208 0.28
209 0.28
210 0.33
211 0.33
212 0.31
213 0.33
214 0.3
215 0.3
216 0.29
217 0.25
218 0.23
219 0.23
220 0.23
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.11
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.07
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.16
303 0.18
304 0.16
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.18
329 0.18
330 0.22
331 0.29
332 0.37
333 0.38
334 0.42
335 0.42
336 0.39
337 0.36
338 0.36
339 0.3
340 0.21
341 0.21
342 0.19
343 0.18
344 0.16
345 0.14
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.19
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.14
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.16
392 0.16
393 0.19
394 0.14
395 0.23
396 0.27
397 0.33
398 0.42
399 0.47
400 0.53
401 0.57
402 0.59
403 0.54
404 0.49
405 0.47
406 0.38
407 0.32
408 0.25
409 0.18
410 0.15
411 0.12
412 0.13
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.16
419 0.17
420 0.18
421 0.16
422 0.17
423 0.15
424 0.15
425 0.17
426 0.17
427 0.22
428 0.2
429 0.23
430 0.24
431 0.3
432 0.3
433 0.3
434 0.34
435 0.31
436 0.36
437 0.36
438 0.37
439 0.33
440 0.34
441 0.34
442 0.28
443 0.24
444 0.19
445 0.15
446 0.12
447 0.12
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.13
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.18
461 0.19
462 0.17
463 0.22
464 0.21
465 0.23
466 0.24
467 0.24
468 0.23
469 0.23
470 0.23
471 0.18
472 0.17
473 0.15
474 0.15
475 0.14
476 0.12
477 0.11
478 0.1
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.1
486 0.14
487 0.19
488 0.22
489 0.25
490 0.28
491 0.32
492 0.32
493 0.3
494 0.29
495 0.25
496 0.22
497 0.2
498 0.17
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.09
503 0.07
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.11
514 0.1
515 0.13
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.2
520 0.19
521 0.19
522 0.23
523 0.22
524 0.19
525 0.2
526 0.2
527 0.18
528 0.16
529 0.15
530 0.11
531 0.09
532 0.07
533 0.06
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.13
538 0.13
539 0.17
540 0.22
541 0.28
542 0.35
543 0.4
544 0.48
545 0.52
546 0.53
547 0.52
548 0.52
549 0.48
550 0.41
551 0.37
552 0.3
553 0.22
554 0.23
555 0.2
556 0.18
557 0.17
558 0.2
559 0.23
560 0.25
561 0.3
562 0.33
563 0.39
564 0.45
565 0.49
566 0.55
567 0.59
568 0.64
569 0.63
570 0.6
571 0.6
572 0.55
573 0.5
574 0.4
575 0.37
576 0.34
577 0.35
578 0.31
579 0.28
580 0.3
581 0.3
582 0.31
583 0.26
584 0.2
585 0.16