Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3L417

Protein Details
Accession E3L417    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-436MTTTPKTSTIQRKKKQRLQTWDKMLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018983  U3_snoRNA-assocProt_15_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0045943  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase I  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgr:PGTG_17149  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09384  UTP15_C  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MEFVKLPILQHPRLTKSNAERSEGRYWREFKNPVFVKSYAPISHITFSSKVPHRYCVSSGTKIQIYSPKTLRVVKTISRFQLPARCSDIKSDGKLVVSSDDSGLIQVFDLNSRAILRTFKEIKQPVHVVKFSPTSAHVLTCSDDSTVRLFDLATSKTVRTFMGHTDYVRAGDFTAPNLILSGSYDGQLKLWDDRIEENGGLAWSLNHQHPIEKILIHPTSTLAISAGGPVANVWDILGGSGSKQPLVSLSNHQKTITSLCWARGPYSNFDEGSQSTRRLLSGGLDGLVKVYDISTGSYKVRHTIRYSSPILSMAVSPDDSLLVVGCTDGSLSMRKRPKSSNEIAVNKAIKAQKLLAVASQGSDPAANETEIVWGRQDANLIEEMAGAGMDNAHEEAADEYPDLKTTEAMMTTTPKTSTIQRKKKQRLQTWDKMLKAFRYGDALDSVLSSTVPPNTTFSLIRELMHRDGLHQALSGRDEVSLAPILRLISRHITDPRWFNIASDVLNCIINLYRAVLGKSQTIDALLSTISFRISDELKLHSTLFAVNGQLEMILSGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.56
4 0.64
5 0.61
6 0.6
7 0.58
8 0.59
9 0.66
10 0.63
11 0.58
12 0.56
13 0.55
14 0.55
15 0.6
16 0.6
17 0.53
18 0.58
19 0.58
20 0.54
21 0.55
22 0.51
23 0.46
24 0.44
25 0.47
26 0.37
27 0.34
28 0.34
29 0.31
30 0.33
31 0.3
32 0.3
33 0.25
34 0.26
35 0.33
36 0.37
37 0.42
38 0.42
39 0.48
40 0.48
41 0.5
42 0.51
43 0.5
44 0.5
45 0.47
46 0.48
47 0.47
48 0.45
49 0.41
50 0.44
51 0.42
52 0.39
53 0.41
54 0.41
55 0.41
56 0.43
57 0.49
58 0.47
59 0.46
60 0.49
61 0.48
62 0.52
63 0.54
64 0.53
65 0.5
66 0.5
67 0.48
68 0.5
69 0.44
70 0.41
71 0.41
72 0.41
73 0.38
74 0.41
75 0.45
76 0.42
77 0.44
78 0.42
79 0.37
80 0.34
81 0.34
82 0.3
83 0.24
84 0.2
85 0.18
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.22
105 0.27
106 0.29
107 0.38
108 0.43
109 0.44
110 0.49
111 0.53
112 0.51
113 0.53
114 0.51
115 0.43
116 0.41
117 0.42
118 0.35
119 0.3
120 0.26
121 0.23
122 0.23
123 0.22
124 0.18
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.17
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.24
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.06
190 0.05
191 0.08
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.13
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.11
235 0.17
236 0.26
237 0.29
238 0.3
239 0.3
240 0.29
241 0.28
242 0.3
243 0.23
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.21
251 0.22
252 0.22
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.18
259 0.2
260 0.18
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.16
287 0.18
288 0.21
289 0.23
290 0.27
291 0.31
292 0.35
293 0.37
294 0.33
295 0.32
296 0.29
297 0.26
298 0.2
299 0.16
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.08
318 0.09
319 0.17
320 0.24
321 0.27
322 0.31
323 0.36
324 0.43
325 0.47
326 0.51
327 0.53
328 0.56
329 0.57
330 0.56
331 0.55
332 0.49
333 0.4
334 0.4
335 0.33
336 0.25
337 0.22
338 0.21
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.15
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.08
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.06
372 0.06
373 0.04
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.24
404 0.34
405 0.42
406 0.51
407 0.58
408 0.69
409 0.79
410 0.86
411 0.88
412 0.87
413 0.87
414 0.86
415 0.88
416 0.88
417 0.84
418 0.78
419 0.72
420 0.66
421 0.57
422 0.52
423 0.43
424 0.33
425 0.31
426 0.28
427 0.25
428 0.23
429 0.21
430 0.16
431 0.14
432 0.13
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.16
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.24
446 0.24
447 0.24
448 0.24
449 0.27
450 0.26
451 0.3
452 0.28
453 0.23
454 0.26
455 0.27
456 0.24
457 0.2
458 0.19
459 0.17
460 0.18
461 0.18
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.13
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.19
476 0.2
477 0.25
478 0.29
479 0.33
480 0.38
481 0.43
482 0.42
483 0.4
484 0.39
485 0.34
486 0.34
487 0.32
488 0.27
489 0.23
490 0.22
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.19
503 0.19
504 0.22
505 0.23
506 0.22
507 0.19
508 0.19
509 0.17
510 0.14
511 0.13
512 0.1
513 0.09
514 0.08
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.11
520 0.13
521 0.16
522 0.18
523 0.22
524 0.24
525 0.26
526 0.26
527 0.23
528 0.22
529 0.2
530 0.19
531 0.17
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.08