Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3L6D3

Protein Details
Accession E3L6D3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MTDPSSSSSRKRTRKPGRASSNWKTLQTHydrophilic
33-56VPAAVKARTLEKKKNRNQAIHSSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-17KRTRKPG
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 4.5, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgr:PGTG_17413  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MTDPSSSSSRKRTRKPGRASSNWKTLQTALPQVPAAVKARTLEKKKNRNQAIHSSRTQASTSTTPSITTSLTSQKLLDILQKNPTQQATKKQTEVGKYLAIDCEMVGVGPRGNEQSALARVSIVNYYGNVVLDTYVQPKEKVTDYRTWVSGIKPEHLHNASTFEDVTRKVADLIHDKILIGHAISNDLQALLLTHPRQLIRDTSTYQPLRQLAKTKFPSLKKLTLLLLDIEIQKDSHCSVDDARATLAIYRTQKDQWEALVKKEQARQPQTRPAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.89
3 0.9
4 0.9
5 0.91
6 0.91
7 0.88
8 0.87
9 0.81
10 0.73
11 0.64
12 0.56
13 0.51
14 0.46
15 0.46
16 0.37
17 0.35
18 0.33
19 0.31
20 0.29
21 0.27
22 0.25
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.25
27 0.33
28 0.4
29 0.47
30 0.55
31 0.65
32 0.72
33 0.81
34 0.82
35 0.81
36 0.8
37 0.81
38 0.79
39 0.76
40 0.69
41 0.64
42 0.57
43 0.51
44 0.45
45 0.35
46 0.3
47 0.26
48 0.27
49 0.25
50 0.23
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.18
55 0.16
56 0.15
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.19
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.23
65 0.2
66 0.21
67 0.27
68 0.29
69 0.3
70 0.32
71 0.34
72 0.31
73 0.31
74 0.39
75 0.41
76 0.43
77 0.44
78 0.46
79 0.47
80 0.46
81 0.45
82 0.37
83 0.3
84 0.27
85 0.26
86 0.21
87 0.18
88 0.14
89 0.11
90 0.09
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.18
129 0.19
130 0.24
131 0.28
132 0.3
133 0.3
134 0.3
135 0.28
136 0.24
137 0.25
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.24
144 0.24
145 0.2
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.18
166 0.15
167 0.1
168 0.09
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.2
187 0.2
188 0.24
189 0.25
190 0.27
191 0.36
192 0.36
193 0.35
194 0.36
195 0.36
196 0.36
197 0.37
198 0.42
199 0.37
200 0.46
201 0.49
202 0.52
203 0.55
204 0.55
205 0.6
206 0.59
207 0.61
208 0.53
209 0.52
210 0.47
211 0.41
212 0.38
213 0.3
214 0.24
215 0.2
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.22
228 0.24
229 0.23
230 0.23
231 0.22
232 0.21
233 0.22
234 0.21
235 0.21
236 0.23
237 0.23
238 0.27
239 0.29
240 0.33
241 0.34
242 0.34
243 0.34
244 0.41
245 0.4
246 0.43
247 0.48
248 0.48
249 0.5
250 0.56
251 0.55
252 0.56
253 0.63
254 0.66
255 0.65