Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JRT4

Protein Details
Accession E3JRT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1037-1062SEEKLNEELKKRRKGRPRLTSKELLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1046-1054KKRRKGRPR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000329  C:fungal-type vacuole membrane  
GO:0006914  P:autophagy  
GO:0034058  P:endosomal vesicle fusion  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
KEGG pgr:PGTG_00217  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MFSPFEHSSNLISNLSTTINSRPSSLLIHSDQLYIGTQAGSLYIYSIKTTNQATLSKSFNNLLANSNPIDSLCLIKEINSLAILSAGNITLHELNQLKLQSNCQRWTKSQASSIYLQTNILRQNDDQQLIQTTPTEDQTHIPVLLSILAVPCKRRLLLFFWKDGQWIDPKEINLPHQVRSLTFATPLNLFLGYSTGDYATIKLTIPSNTQQPITHQISDPFPSPIANLINNRSLSNDSVSPIAVSNSSPKVSGLSSLAFKTTGLVSLGLAGSHKVARNSVLRLGPPTDELIGIKEQIATFLNPQGKLTRPQTVHSGPSTIPSSILYPIPPSETIVRSPYLLSLLPTSSTSTSLFVHSIPTLSHLQTLPLPDQTTQESENKSSLPSTTQTSSPGKKPSLEPPFSSRPPNRQLLTASPNSGPIFLIGSQWNPIENNFQYQLECLQMKPWPDQIQQLIELGEYEEALGLMEGLDESHLPNKAQLLKKLNALCGVIDFSKYKYDRAIDTFISLSINPAKVVALYPSEISGSLGKKREEWEELFGGRSAESYRSNPLVGPRPASELVYPPHLSRAGSDIGSIPRSISHLGNNPNVVDDDRRSILSGPSAAPTKPKMGEPSLQRTVLEEKSPEDLHFRPSVEVLIRYLTDRRQQVNRALAAIQERPESAEVTDRPGTSPSDIIQPSVELEDRPIAEIESFEQLVHVAKVIDTALFKSYLALRPTMLGPLCRLPNWCEVELVEGLLMEAKRYHELLDLYHGKGQHAKALKLLKKMAMNEEDAMTQIEPTVRYLQKLGSKHIDVILESSKWVFSLCQDQEEEGGPGSAMELIKAGLEIFVADLSAVDSLPKPLIVTFLDHLKSSTPIQLYLEFIVRSLRLQDSSFHEKLIQIYLLEVNRLRGLGSLESGQEIYKKLLDHLEDSSSYSPNWVLGRLPPDSMWEARAITLGKIGQHETALRIYVERLNDIRLAEEYCQRVYEKNGAVDGSVFLCLLKICLRPNVSIVDKQSEDEDEEKSEKEEEEEEKSGEQQLPEEEKQQEEENESEEKLNEELKKRRKGRPRLTSKELLESGIKMINEHGHKVVEIEAIVELIPPLVQLNRLDQFLIHALDHLHTSIQLQLVLRNSLLSRRASLAMAAQVLANRRVKIDLKRLCIGCGKRLGNTVIAVHPPFGEVTHYQCQDRYNNPHLRRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.19
4 0.16
5 0.19
6 0.24
7 0.25
8 0.26
9 0.25
10 0.26
11 0.29
12 0.29
13 0.3
14 0.27
15 0.3
16 0.3
17 0.29
18 0.27
19 0.25
20 0.23
21 0.17
22 0.15
23 0.11
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.17
36 0.19
37 0.22
38 0.24
39 0.27
40 0.3
41 0.33
42 0.37
43 0.36
44 0.37
45 0.35
46 0.33
47 0.34
48 0.31
49 0.31
50 0.28
51 0.29
52 0.27
53 0.26
54 0.23
55 0.19
56 0.19
57 0.15
58 0.16
59 0.14
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.18
64 0.17
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.21
83 0.23
84 0.23
85 0.24
86 0.33
87 0.36
88 0.43
89 0.49
90 0.52
91 0.56
92 0.56
93 0.63
94 0.62
95 0.58
96 0.58
97 0.56
98 0.53
99 0.51
100 0.51
101 0.46
102 0.4
103 0.36
104 0.3
105 0.3
106 0.31
107 0.29
108 0.28
109 0.25
110 0.32
111 0.37
112 0.37
113 0.33
114 0.3
115 0.31
116 0.29
117 0.29
118 0.22
119 0.18
120 0.18
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.2
125 0.23
126 0.24
127 0.22
128 0.2
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.24
142 0.26
143 0.29
144 0.39
145 0.42
146 0.43
147 0.44
148 0.44
149 0.43
150 0.4
151 0.36
152 0.32
153 0.3
154 0.3
155 0.3
156 0.3
157 0.34
158 0.36
159 0.35
160 0.38
161 0.37
162 0.35
163 0.36
164 0.36
165 0.31
166 0.33
167 0.32
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.2
172 0.2
173 0.21
174 0.17
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.14
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.26
196 0.28
197 0.27
198 0.29
199 0.35
200 0.36
201 0.36
202 0.32
203 0.33
204 0.34
205 0.36
206 0.33
207 0.26
208 0.22
209 0.19
210 0.18
211 0.19
212 0.18
213 0.2
214 0.22
215 0.24
216 0.29
217 0.3
218 0.3
219 0.28
220 0.27
221 0.25
222 0.24
223 0.22
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.14
229 0.13
230 0.1
231 0.1
232 0.13
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.14
241 0.14
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.1
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.17
264 0.2
265 0.23
266 0.27
267 0.27
268 0.26
269 0.28
270 0.29
271 0.26
272 0.23
273 0.22
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.17
288 0.21
289 0.19
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.29
294 0.31
295 0.34
296 0.32
297 0.34
298 0.4
299 0.4
300 0.41
301 0.35
302 0.35
303 0.27
304 0.29
305 0.29
306 0.22
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.19
321 0.2
322 0.2
323 0.18
324 0.18
325 0.16
326 0.15
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.1
346 0.13
347 0.14
348 0.13
349 0.16
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.19
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.15
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.19
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.14
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.21
376 0.27
377 0.3
378 0.32
379 0.36
380 0.34
381 0.35
382 0.37
383 0.42
384 0.46
385 0.45
386 0.43
387 0.44
388 0.5
389 0.5
390 0.55
391 0.49
392 0.47
393 0.5
394 0.54
395 0.49
396 0.44
397 0.44
398 0.41
399 0.44
400 0.38
401 0.34
402 0.28
403 0.3
404 0.27
405 0.25
406 0.19
407 0.13
408 0.13
409 0.1
410 0.12
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.1
417 0.11
418 0.14
419 0.14
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.15
427 0.15
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.15
432 0.17
433 0.21
434 0.23
435 0.24
436 0.28
437 0.28
438 0.28
439 0.26
440 0.25
441 0.2
442 0.15
443 0.13
444 0.1
445 0.07
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.11
465 0.18
466 0.21
467 0.27
468 0.31
469 0.32
470 0.38
471 0.39
472 0.37
473 0.32
474 0.29
475 0.23
476 0.17
477 0.17
478 0.12
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.23
489 0.26
490 0.19
491 0.2
492 0.2
493 0.17
494 0.16
495 0.14
496 0.11
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.1
513 0.1
514 0.14
515 0.18
516 0.18
517 0.19
518 0.21
519 0.24
520 0.25
521 0.25
522 0.24
523 0.23
524 0.23
525 0.22
526 0.2
527 0.17
528 0.13
529 0.12
530 0.09
531 0.09
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.15
538 0.18
539 0.23
540 0.22
541 0.23
542 0.21
543 0.24
544 0.24
545 0.24
546 0.21
547 0.16
548 0.16
549 0.18
550 0.18
551 0.14
552 0.16
553 0.16
554 0.15
555 0.13
556 0.15
557 0.12
558 0.11
559 0.12
560 0.11
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.09
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.09
569 0.11
570 0.16
571 0.19
572 0.21
573 0.21
574 0.2
575 0.19
576 0.18
577 0.16
578 0.13
579 0.1
580 0.1
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.09
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.13
594 0.15
595 0.14
596 0.15
597 0.17
598 0.18
599 0.24
600 0.26
601 0.33
602 0.33
603 0.32
604 0.31
605 0.29
606 0.31
607 0.27
608 0.24
609 0.16
610 0.14
611 0.17
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.18
617 0.19
618 0.18
619 0.16
620 0.16
621 0.17
622 0.14
623 0.14
624 0.11
625 0.1
626 0.09
627 0.1
628 0.11
629 0.12
630 0.17
631 0.2
632 0.23
633 0.27
634 0.3
635 0.35
636 0.38
637 0.36
638 0.32
639 0.28
640 0.26
641 0.24
642 0.22
643 0.18
644 0.13
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.12
649 0.09
650 0.13
651 0.12
652 0.16
653 0.18
654 0.17
655 0.17
656 0.18
657 0.19
658 0.15
659 0.15
660 0.11
661 0.16
662 0.16
663 0.15
664 0.14
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.06
670 0.07
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.08
685 0.07
686 0.07
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.07
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.11
699 0.15
700 0.16
701 0.15
702 0.15
703 0.16
704 0.16
705 0.18
706 0.16
707 0.12
708 0.12
709 0.15
710 0.16
711 0.16
712 0.17
713 0.17
714 0.24
715 0.28
716 0.26
717 0.23
718 0.22
719 0.24
720 0.22
721 0.19
722 0.11
723 0.07
724 0.06
725 0.08
726 0.08
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.09
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.11
735 0.12
736 0.18
737 0.2
738 0.2
739 0.22
740 0.22
741 0.19
742 0.23
743 0.23
744 0.21
745 0.22
746 0.21
747 0.24
748 0.33
749 0.36
750 0.36
751 0.38
752 0.36
753 0.36
754 0.38
755 0.38
756 0.32
757 0.3
758 0.26
759 0.25
760 0.21
761 0.18
762 0.17
763 0.11
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.07
768 0.09
769 0.16
770 0.15
771 0.16
772 0.18
773 0.21
774 0.26
775 0.27
776 0.3
777 0.29
778 0.29
779 0.3
780 0.31
781 0.28
782 0.22
783 0.22
784 0.2
785 0.14
786 0.14
787 0.13
788 0.11
789 0.1
790 0.1
791 0.07
792 0.07
793 0.16
794 0.16
795 0.19
796 0.19
797 0.2
798 0.21
799 0.21
800 0.21
801 0.11
802 0.11
803 0.07
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.06
808 0.05
809 0.05
810 0.05
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.03
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.03
820 0.03
821 0.03
822 0.03
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.11
836 0.16
837 0.17
838 0.17
839 0.18
840 0.16
841 0.18
842 0.16
843 0.2
844 0.15
845 0.16
846 0.17
847 0.18
848 0.19
849 0.18
850 0.19
851 0.14
852 0.14
853 0.14
854 0.13
855 0.12
856 0.13
857 0.13
858 0.13
859 0.13
860 0.17
861 0.23
862 0.31
863 0.31
864 0.29
865 0.28
866 0.27
867 0.28
868 0.27
869 0.21
870 0.12
871 0.13
872 0.16
873 0.15
874 0.16
875 0.16
876 0.14
877 0.14
878 0.14
879 0.13
880 0.11
881 0.12
882 0.11
883 0.12
884 0.12
885 0.11
886 0.12
887 0.12
888 0.11
889 0.11
890 0.11
891 0.12
892 0.13
893 0.13
894 0.14
895 0.17
896 0.19
897 0.19
898 0.2
899 0.22
900 0.2
901 0.22
902 0.22
903 0.19
904 0.18
905 0.16
906 0.14
907 0.14
908 0.14
909 0.13
910 0.12
911 0.15
912 0.19
913 0.19
914 0.2
915 0.17
916 0.2
917 0.23
918 0.22
919 0.2
920 0.17
921 0.17
922 0.16
923 0.18
924 0.16
925 0.12
926 0.14
927 0.14
928 0.14
929 0.16
930 0.17
931 0.15
932 0.16
933 0.17
934 0.16
935 0.16
936 0.16
937 0.14
938 0.13
939 0.14
940 0.16
941 0.16
942 0.18
943 0.17
944 0.18
945 0.2
946 0.2
947 0.19
948 0.17
949 0.18
950 0.17
951 0.21
952 0.21
953 0.2
954 0.21
955 0.21
956 0.22
957 0.24
958 0.3
959 0.28
960 0.28
961 0.29
962 0.27
963 0.27
964 0.25
965 0.22
966 0.15
967 0.11
968 0.09
969 0.07
970 0.07
971 0.07
972 0.08
973 0.11
974 0.13
975 0.15
976 0.22
977 0.25
978 0.25
979 0.28
980 0.32
981 0.32
982 0.34
983 0.35
984 0.34
985 0.32
986 0.32
987 0.31
988 0.27
989 0.26
990 0.23
991 0.21
992 0.19
993 0.2
994 0.2
995 0.2
996 0.2
997 0.17
998 0.17
999 0.2
1000 0.19
1001 0.23
1002 0.25
1003 0.25
1004 0.24
1005 0.25
1006 0.27
1007 0.25
1008 0.22
1009 0.18
1010 0.21
1011 0.27
1012 0.28
1013 0.32
1014 0.3
1015 0.29
1016 0.31
1017 0.33
1018 0.29
1019 0.26
1020 0.26
1021 0.23
1022 0.24
1023 0.23
1024 0.22
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.16
1028 0.21
1029 0.23
1030 0.29
1031 0.38
1032 0.46
1033 0.57
1034 0.63
1035 0.71
1036 0.77
1037 0.82
1038 0.85
1039 0.87
1040 0.89
1041 0.87
1042 0.88
1043 0.87
1044 0.8
1045 0.77
1046 0.67
1047 0.58
1048 0.49
1049 0.4
1050 0.34
1051 0.29
1052 0.26
1053 0.17
1054 0.18
1055 0.23
1056 0.23
1057 0.25
1058 0.25
1059 0.22
1060 0.22
1061 0.23
1062 0.23
1063 0.17
1064 0.15
1065 0.13
1066 0.11
1067 0.1
1068 0.1
1069 0.09
1070 0.07
1071 0.05
1072 0.05
1073 0.04
1074 0.06
1075 0.06
1076 0.09
1077 0.1
1078 0.17
1079 0.19
1080 0.2
1081 0.21
1082 0.19
1083 0.22
1084 0.23
1085 0.23
1086 0.17
1087 0.15
1088 0.16
1089 0.16
1090 0.17
1091 0.15
1092 0.12
1093 0.1
1094 0.11
1095 0.12
1096 0.12
1097 0.14
1098 0.14
1099 0.17
1100 0.19
1101 0.21
1102 0.2
1103 0.19
1104 0.19
1105 0.22
1106 0.26
1107 0.25
1108 0.24
1109 0.26
1110 0.28
1111 0.26
1112 0.26
1113 0.24
1114 0.23
1115 0.21
1116 0.19
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.2
1120 0.25
1121 0.26
1122 0.24
1123 0.24
1124 0.29
1125 0.35
1126 0.41
1127 0.48
1128 0.5
1129 0.53
1130 0.6
1131 0.59
1132 0.58
1133 0.6
1134 0.55
1135 0.52
1136 0.54
1137 0.49
1138 0.44
1139 0.49
1140 0.47
1141 0.42
1142 0.4
1143 0.36
1144 0.3
1145 0.33
1146 0.31
1147 0.26
1148 0.24
1149 0.22
1150 0.2
1151 0.17
1152 0.18
1153 0.15
1154 0.21
1155 0.29
1156 0.32
1157 0.32
1158 0.34
1159 0.39
1160 0.41
1161 0.48
1162 0.5
1163 0.52
1164 0.59