Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KBE7

Protein Details
Accession E3KBE7    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28MPRLSSKQSGPDSKKPKKVVHydrophilic
50-69LKSAMKKKVPQKTESKKAEKHydrophilic
136-156QPSSKNQPTPNRKSKRKAAEEHydrophilic
246-272VGSGKKFRKDCKLRLDREKRNQAKTLPHydrophilic
311-337QVETDPTPENKPKKSKKASLPSAESGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-342KPKKSKKASLPSAESGRAKKKN
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG pgr:PGTG_07909  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MPKQRSYAMPRLSSKQSGPDSKKPKKVVISEIEQLASNPSISSQLPAVPLKSAMKKKVPQKTESKKAEKAAEESEEEPSSSPASENDVVQLNVFDDDESDDDSSDDDDDDDDDDGDDNDSSEEESNQSSDDDSKAQPSSKNQPTPNRKSKRKAAEEQAGVVYLGRIPQGFYEDEMRAYFSQFGEVLRLRLSRCKRTGKPKHYGFIEFKHLEVAQIVAETIHNYLLCGKLLQCKVLEKDQIHPKLWVGSGKKFRKDCKLRLDREKRNQAKTLPQRNVISDRLIKQEQLKRKRLAELGIDYNFEGYTSPAKPQVETDPTPENKPKKSKKASLPSAESGRAKKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.55
4 0.57
5 0.61
6 0.64
7 0.69
8 0.74
9 0.81
10 0.78
11 0.77
12 0.75
13 0.74
14 0.73
15 0.7
16 0.67
17 0.62
18 0.59
19 0.52
20 0.43
21 0.37
22 0.3
23 0.23
24 0.17
25 0.12
26 0.1
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.18
34 0.19
35 0.17
36 0.2
37 0.24
38 0.31
39 0.36
40 0.39
41 0.46
42 0.52
43 0.6
44 0.67
45 0.68
46 0.67
47 0.71
48 0.75
49 0.77
50 0.8
51 0.79
52 0.75
53 0.75
54 0.74
55 0.66
56 0.6
57 0.53
58 0.46
59 0.41
60 0.36
61 0.34
62 0.27
63 0.24
64 0.21
65 0.17
66 0.15
67 0.12
68 0.12
69 0.09
70 0.14
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.17
124 0.21
125 0.29
126 0.35
127 0.41
128 0.45
129 0.53
130 0.62
131 0.7
132 0.76
133 0.76
134 0.77
135 0.77
136 0.8
137 0.81
138 0.79
139 0.76
140 0.74
141 0.72
142 0.64
143 0.59
144 0.5
145 0.39
146 0.31
147 0.23
148 0.15
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.19
177 0.25
178 0.29
179 0.35
180 0.44
181 0.49
182 0.59
183 0.69
184 0.71
185 0.76
186 0.73
187 0.73
188 0.67
189 0.66
190 0.58
191 0.51
192 0.51
193 0.41
194 0.36
195 0.32
196 0.28
197 0.23
198 0.19
199 0.16
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.21
220 0.24
221 0.29
222 0.34
223 0.27
224 0.35
225 0.43
226 0.47
227 0.44
228 0.42
229 0.38
230 0.35
231 0.36
232 0.34
233 0.28
234 0.31
235 0.4
236 0.46
237 0.53
238 0.55
239 0.59
240 0.64
241 0.69
242 0.69
243 0.7
244 0.74
245 0.75
246 0.81
247 0.86
248 0.86
249 0.87
250 0.9
251 0.87
252 0.83
253 0.8
254 0.73
255 0.73
256 0.74
257 0.73
258 0.68
259 0.67
260 0.62
261 0.61
262 0.62
263 0.54
264 0.49
265 0.44
266 0.41
267 0.41
268 0.4
269 0.38
270 0.41
271 0.47
272 0.52
273 0.56
274 0.62
275 0.61
276 0.64
277 0.68
278 0.63
279 0.6
280 0.57
281 0.53
282 0.51
283 0.45
284 0.43
285 0.36
286 0.33
287 0.27
288 0.2
289 0.14
290 0.09
291 0.13
292 0.13
293 0.16
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.25
298 0.32
299 0.35
300 0.36
301 0.38
302 0.42
303 0.44
304 0.5
305 0.56
306 0.55
307 0.56
308 0.65
309 0.71
310 0.73
311 0.8
312 0.83
313 0.85
314 0.89
315 0.91
316 0.89
317 0.86
318 0.83
319 0.78
320 0.75
321 0.69
322 0.66