Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KIS4

Protein Details
Accession E3KIS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-132QIEKTTGVKKSRKNKYWQKKNQAKAIKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-119KSRKNK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8, cyto_nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG pgr:PGTG_10577  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MISVRHFSGRPPLSSLTGLTPDWTTISSCNLAIPKDLGRRKYSKMGEPIGPAPSSSSIADFHKRPLSGLFAINKPSGTISMTLLESLKELFLSSKLFVDNPEPFQIEKTTGVKKSRKNKYWQKKNQAKAIKIGQGGTLDPLASGVLIIGLNSATKKLSNFLDCSKAYRTTGILGCKTDSYDSDGKTVGLAAWKHVKPDDIRRECGLIKGEHWQIPPIYSALKMDGKPLYEYARKNIPLPRAIEARRCEISEIRMVEWKEADEHAYKWPTKMMSEEDSKIFQRAEHLVQQTGVVKGNNSSSLVVPPKQEAQEETNTTLNESSKRELPLEQEAEKESKKIKLEEVKEIKKGESDQPNDPTTPKLEEGNDPKIVKPEDGSSGVDDAQSSTNDPPTGQENTDGVTMEDNGKSPVFTLEMTVSSGTYVRTIVHDIGQAVSSAATVVSLIRTRQGDFCLDPPPKDPHGDDSKSLGCIEWSVFESAIQARSSGSDYPVDQAGFREWERELLKHIQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.32
4 0.3
5 0.28
6 0.24
7 0.22
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.15
12 0.13
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.2
17 0.21
18 0.21
19 0.22
20 0.23
21 0.26
22 0.34
23 0.4
24 0.42
25 0.47
26 0.52
27 0.55
28 0.63
29 0.62
30 0.61
31 0.64
32 0.64
33 0.61
34 0.6
35 0.58
36 0.52
37 0.45
38 0.36
39 0.3
40 0.26
41 0.24
42 0.2
43 0.18
44 0.16
45 0.21
46 0.27
47 0.26
48 0.29
49 0.33
50 0.32
51 0.32
52 0.32
53 0.33
54 0.3
55 0.34
56 0.34
57 0.31
58 0.34
59 0.34
60 0.32
61 0.26
62 0.24
63 0.2
64 0.17
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.2
86 0.22
87 0.23
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.26
92 0.26
93 0.23
94 0.23
95 0.25
96 0.28
97 0.32
98 0.41
99 0.46
100 0.53
101 0.61
102 0.68
103 0.71
104 0.75
105 0.81
106 0.84
107 0.88
108 0.9
109 0.91
110 0.9
111 0.89
112 0.88
113 0.86
114 0.77
115 0.73
116 0.69
117 0.64
118 0.56
119 0.49
120 0.41
121 0.33
122 0.3
123 0.24
124 0.17
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.14
145 0.17
146 0.2
147 0.22
148 0.29
149 0.28
150 0.31
151 0.31
152 0.3
153 0.28
154 0.26
155 0.24
156 0.22
157 0.25
158 0.26
159 0.25
160 0.23
161 0.24
162 0.22
163 0.22
164 0.19
165 0.16
166 0.17
167 0.19
168 0.19
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.21
182 0.24
183 0.23
184 0.34
185 0.42
186 0.39
187 0.42
188 0.42
189 0.44
190 0.41
191 0.41
192 0.34
193 0.23
194 0.2
195 0.23
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.24
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.15
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.14
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.28
220 0.27
221 0.3
222 0.33
223 0.33
224 0.31
225 0.33
226 0.33
227 0.32
228 0.33
229 0.36
230 0.34
231 0.34
232 0.31
233 0.29
234 0.27
235 0.22
236 0.23
237 0.21
238 0.2
239 0.17
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.1
249 0.11
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.19
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.2
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.21
266 0.18
267 0.14
268 0.14
269 0.15
270 0.17
271 0.2
272 0.21
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.13
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.19
296 0.2
297 0.24
298 0.25
299 0.26
300 0.25
301 0.24
302 0.24
303 0.22
304 0.2
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.21
310 0.22
311 0.22
312 0.24
313 0.27
314 0.29
315 0.27
316 0.25
317 0.25
318 0.27
319 0.26
320 0.25
321 0.21
322 0.22
323 0.24
324 0.24
325 0.29
326 0.34
327 0.38
328 0.46
329 0.53
330 0.53
331 0.54
332 0.53
333 0.47
334 0.41
335 0.41
336 0.38
337 0.38
338 0.37
339 0.39
340 0.42
341 0.44
342 0.42
343 0.4
344 0.34
345 0.27
346 0.26
347 0.22
348 0.2
349 0.2
350 0.26
351 0.31
352 0.35
353 0.38
354 0.36
355 0.35
356 0.38
357 0.37
358 0.3
359 0.26
360 0.23
361 0.21
362 0.23
363 0.23
364 0.19
365 0.19
366 0.19
367 0.17
368 0.15
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.17
379 0.2
380 0.18
381 0.19
382 0.17
383 0.18
384 0.19
385 0.18
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.1
412 0.13
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.16
419 0.14
420 0.12
421 0.1
422 0.08
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.14
432 0.16
433 0.18
434 0.21
435 0.23
436 0.25
437 0.26
438 0.28
439 0.32
440 0.33
441 0.33
442 0.35
443 0.39
444 0.37
445 0.39
446 0.39
447 0.38
448 0.45
449 0.47
450 0.45
451 0.44
452 0.43
453 0.4
454 0.39
455 0.31
456 0.21
457 0.19
458 0.18
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.2
467 0.17
468 0.15
469 0.14
470 0.15
471 0.18
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.18
476 0.21
477 0.24
478 0.22
479 0.2
480 0.2
481 0.22
482 0.23
483 0.23
484 0.23
485 0.2
486 0.27
487 0.3
488 0.29
489 0.31