Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KED1

Protein Details
Accession E3KED1    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-475QQLQLKQKQKQKQQEQDESQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
905-906RR
912-914ARK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005667  C:transcription regulator complex  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_08860  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MSVNRQAHPTAQTPIGVQSPARTPFARPLSQAQNRPIGDLPRPPSQAGIASNNQQAHSPFPSGASQNGTPQSAFKSLPINNLTPAQQAARLPGQTPNSDPKRDELNSIAEAQAQQQRSMYPFEAQTHPIQLSAMQRQVLSHQQQQFSQLSREQFAQLQATHPAQAALLIAQQQNLARVKAQAESQNLSEANTRLLLESQQKDFWQHNQRLFLPPGQAHDDPTHQQAFGNQNPQALHQQRLQMAQIQQLQESTALQHQALQAAQNHHSLKANNLTSPSPLPSQLQQQRHLALQQQQQHAQRQQHLLAQQAQAQQQIQAQQLPQQQHQQHQQHQQAQHQAQQPHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHQQQQQQQQAQQQAQQQQQQQQQQQQQQQQQAQIQQQQLAQQQHAQIQQREQQAQQQAQQQQQLQQQQQQQQQLQLKQKQKQKQQEQDESQQEKRKLADQQEQHLFALRQRQQKETSSHENPLGSTINEAGGVNNGSPNGRNDTFVPPPPPSSSAVPGPGGPRSHVESVGSTQTATTNGKKEADKSFPGHPSATPTNTNPNTNTTNMNAPDPSSASHPHSNGDSSLVVDHWSHPSTVPPPHPPQSLVPAHLAPGPSHPSSFPIPSSSSSIGAVPGNTPPPATAALGGNGFGSGLLRLLKFFDSLAQVAKHEDSLSFLQQLVAEYFIESAVFKISLWDSNSGTNKPFEIPIGSLARFLNEFFEAGARTMTMSIPQGVEMLLVVPLVHQQAETLVRTTVGTKHIGYGIESEASVWGVEYGTGVKVEMTGKLSANMYKCGGLGGPTSGTEQQGLEVLKMDSLEFIACSHVEWISRRAVTRETIDRLVTKSDPDLLPATSDLLSSLLPIPSPPTPVQAKAALKGRRQSAAAARKKSVAAAAAAAAAAEEERAKNEALISADKLAFRTVKTEALSLPISPVGPFGIPDKSMRCLELIEGVAQLAPLMGFSVENNLPPLASLQEFTDQFHRRTMSMGGGSIEGGGVGAPMSRGGVAAGGGVGVAGGVQKGAEEGNSPTTTHSPRKRSATYANGGPGSAGSTGEPEPDDSTSTTTAATTAGPKTANNCGASSAGYFLAGRNNNDALPPIVPPSSSSTNPSNNNNNPTNPSTNNNNNTSSSSTTTTNNNNQNQNQPSNSDESSTLHLLPNNPSSSTDPTSSGSASASKPPAGSSSSSSPPPLPSHTSLLENLTKNPYPHLGSTPQTQANHTLHHQNGLVGNLVSLASSNSNSNSNSNSNSGSNHLKRRASSSDSLDLLALIPRSNSSSPPAQHPGAAISSGPAAAAASSSRVVRARLGSKSNST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.25
4 0.22
5 0.21
6 0.26
7 0.28
8 0.32
9 0.29
10 0.3
11 0.38
12 0.45
13 0.45
14 0.42
15 0.46
16 0.53
17 0.6
18 0.64
19 0.6
20 0.62
21 0.58
22 0.58
23 0.54
24 0.49
25 0.45
26 0.47
27 0.46
28 0.46
29 0.48
30 0.45
31 0.42
32 0.4
33 0.39
34 0.36
35 0.37
36 0.33
37 0.35
38 0.4
39 0.41
40 0.39
41 0.36
42 0.33
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.23
47 0.24
48 0.28
49 0.26
50 0.28
51 0.29
52 0.27
53 0.31
54 0.33
55 0.33
56 0.28
57 0.29
58 0.3
59 0.28
60 0.27
61 0.23
62 0.28
63 0.29
64 0.37
65 0.39
66 0.37
67 0.36
68 0.38
69 0.38
70 0.31
71 0.31
72 0.25
73 0.24
74 0.22
75 0.25
76 0.27
77 0.27
78 0.26
79 0.3
80 0.33
81 0.32
82 0.36
83 0.41
84 0.43
85 0.46
86 0.46
87 0.44
88 0.48
89 0.47
90 0.47
91 0.4
92 0.39
93 0.36
94 0.37
95 0.34
96 0.26
97 0.25
98 0.26
99 0.28
100 0.24
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.24
105 0.28
106 0.25
107 0.23
108 0.25
109 0.29
110 0.32
111 0.33
112 0.33
113 0.32
114 0.31
115 0.27
116 0.24
117 0.23
118 0.25
119 0.28
120 0.29
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.3
125 0.36
126 0.35
127 0.37
128 0.4
129 0.42
130 0.43
131 0.48
132 0.48
133 0.42
134 0.41
135 0.38
136 0.34
137 0.34
138 0.35
139 0.31
140 0.3
141 0.29
142 0.29
143 0.25
144 0.24
145 0.26
146 0.26
147 0.25
148 0.22
149 0.19
150 0.15
151 0.15
152 0.13
153 0.09
154 0.09
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.14
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.18
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.26
168 0.26
169 0.28
170 0.3
171 0.29
172 0.32
173 0.3
174 0.29
175 0.29
176 0.23
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.15
181 0.16
182 0.19
183 0.23
184 0.27
185 0.28
186 0.29
187 0.3
188 0.33
189 0.34
190 0.4
191 0.42
192 0.45
193 0.47
194 0.5
195 0.52
196 0.55
197 0.56
198 0.5
199 0.45
200 0.39
201 0.38
202 0.38
203 0.36
204 0.32
205 0.32
206 0.33
207 0.29
208 0.33
209 0.3
210 0.24
211 0.24
212 0.26
213 0.31
214 0.32
215 0.36
216 0.32
217 0.34
218 0.34
219 0.37
220 0.41
221 0.36
222 0.35
223 0.32
224 0.37
225 0.36
226 0.38
227 0.37
228 0.33
229 0.32
230 0.35
231 0.36
232 0.31
233 0.29
234 0.26
235 0.26
236 0.2
237 0.19
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.22
249 0.24
250 0.28
251 0.28
252 0.28
253 0.31
254 0.28
255 0.29
256 0.33
257 0.33
258 0.29
259 0.3
260 0.29
261 0.28
262 0.3
263 0.28
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.31
269 0.37
270 0.41
271 0.42
272 0.44
273 0.45
274 0.44
275 0.44
276 0.39
277 0.38
278 0.39
279 0.42
280 0.43
281 0.48
282 0.5
283 0.56
284 0.57
285 0.55
286 0.54
287 0.51
288 0.48
289 0.47
290 0.44
291 0.41
292 0.39
293 0.35
294 0.34
295 0.33
296 0.32
297 0.3
298 0.28
299 0.25
300 0.22
301 0.25
302 0.21
303 0.2
304 0.19
305 0.23
306 0.27
307 0.29
308 0.3
309 0.35
310 0.37
311 0.41
312 0.51
313 0.52
314 0.56
315 0.62
316 0.67
317 0.65
318 0.66
319 0.66
320 0.65
321 0.59
322 0.58
323 0.56
324 0.5
325 0.47
326 0.53
327 0.52
328 0.51
329 0.54
330 0.52
331 0.51
332 0.58
333 0.64
334 0.63
335 0.64
336 0.64
337 0.66
338 0.69
339 0.71
340 0.69
341 0.66
342 0.66
343 0.68
344 0.68
345 0.68
346 0.68
347 0.68
348 0.68
349 0.68
350 0.68
351 0.68
352 0.68
353 0.68
354 0.68
355 0.68
356 0.68
357 0.68
358 0.68
359 0.68
360 0.68
361 0.68
362 0.68
363 0.68
364 0.68
365 0.68
366 0.67
367 0.66
368 0.66
369 0.67
370 0.68
371 0.69
372 0.67
373 0.66
374 0.67
375 0.68
376 0.68
377 0.64
378 0.6
379 0.57
380 0.56
381 0.51
382 0.48
383 0.46
384 0.45
385 0.44
386 0.46
387 0.45
388 0.46
389 0.51
390 0.54
391 0.54
392 0.54
393 0.58
394 0.6
395 0.63
396 0.64
397 0.63
398 0.63
399 0.61
400 0.57
401 0.53
402 0.5
403 0.47
404 0.45
405 0.4
406 0.36
407 0.34
408 0.33
409 0.36
410 0.33
411 0.28
412 0.25
413 0.26
414 0.28
415 0.32
416 0.32
417 0.29
418 0.31
419 0.36
420 0.38
421 0.38
422 0.35
423 0.36
424 0.37
425 0.38
426 0.38
427 0.39
428 0.39
429 0.4
430 0.44
431 0.39
432 0.39
433 0.42
434 0.44
435 0.4
436 0.41
437 0.44
438 0.47
439 0.51
440 0.51
441 0.47
442 0.47
443 0.5
444 0.51
445 0.54
446 0.54
447 0.57
448 0.58
449 0.64
450 0.66
451 0.69
452 0.73
453 0.75
454 0.77
455 0.79
456 0.81
457 0.79
458 0.79
459 0.79
460 0.73
461 0.68
462 0.66
463 0.58
464 0.5
465 0.45
466 0.42
467 0.39
468 0.4
469 0.43
470 0.4
471 0.45
472 0.48
473 0.49
474 0.44
475 0.41
476 0.35
477 0.28
478 0.34
479 0.32
480 0.35
481 0.35
482 0.39
483 0.4
484 0.46
485 0.49
486 0.46
487 0.49
488 0.45
489 0.46
490 0.44
491 0.4
492 0.34
493 0.32
494 0.26
495 0.17
496 0.14
497 0.11
498 0.09
499 0.1
500 0.09
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.09
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.17
514 0.22
515 0.25
516 0.27
517 0.28
518 0.24
519 0.25
520 0.26
521 0.25
522 0.23
523 0.22
524 0.22
525 0.2
526 0.21
527 0.2
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.17
532 0.15
533 0.16
534 0.18
535 0.18
536 0.17
537 0.17
538 0.15
539 0.16
540 0.17
541 0.15
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.12
546 0.13
547 0.14
548 0.15
549 0.16
550 0.2
551 0.2
552 0.23
553 0.26
554 0.28
555 0.29
556 0.29
557 0.33
558 0.33
559 0.34
560 0.31
561 0.26
562 0.28
563 0.28
564 0.27
565 0.24
566 0.23
567 0.3
568 0.31
569 0.33
570 0.28
571 0.29
572 0.29
573 0.28
574 0.28
575 0.21
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.18
580 0.16
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.11
585 0.13
586 0.16
587 0.19
588 0.19
589 0.19
590 0.19
591 0.19
592 0.17
593 0.16
594 0.12
595 0.09
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.14
607 0.18
608 0.2
609 0.23
610 0.27
611 0.31
612 0.32
613 0.31
614 0.3
615 0.33
616 0.31
617 0.27
618 0.24
619 0.21
620 0.2
621 0.2
622 0.19
623 0.12
624 0.13
625 0.15
626 0.13
627 0.14
628 0.13
629 0.14
630 0.16
631 0.17
632 0.15
633 0.13
634 0.14
635 0.15
636 0.19
637 0.17
638 0.16
639 0.15
640 0.15
641 0.13
642 0.12
643 0.11
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.08
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.03
664 0.03
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.11
679 0.11
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.11
691 0.08
692 0.07
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.05
704 0.06
705 0.08
706 0.1
707 0.12
708 0.12
709 0.17
710 0.19
711 0.19
712 0.2
713 0.18
714 0.17
715 0.15
716 0.15
717 0.11
718 0.1
719 0.09
720 0.12
721 0.15
722 0.14
723 0.15
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.13
728 0.11
729 0.08
730 0.08
731 0.06
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.05
737 0.05
738 0.06
739 0.05
740 0.06
741 0.06
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.06
747 0.06
748 0.05
749 0.04
750 0.03
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.04
755 0.04
756 0.05
757 0.04
758 0.04
759 0.06
760 0.08
761 0.09
762 0.09
763 0.08
764 0.09
765 0.09
766 0.1
767 0.11
768 0.12
769 0.13
770 0.12
771 0.13
772 0.15
773 0.15
774 0.14
775 0.13
776 0.12
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.07
781 0.07
782 0.06
783 0.04
784 0.04
785 0.03
786 0.03
787 0.04
788 0.04
789 0.04
790 0.04
791 0.04
792 0.04
793 0.05
794 0.06
795 0.07
796 0.09
797 0.1
798 0.1
799 0.12
800 0.13
801 0.14
802 0.15
803 0.16
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.12
808 0.11
809 0.09
810 0.09
811 0.08
812 0.07
813 0.07
814 0.09
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.09
819 0.08
820 0.11
821 0.1
822 0.09
823 0.09
824 0.09
825 0.09
826 0.09
827 0.09
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.04
832 0.05
833 0.05
834 0.05
835 0.05
836 0.06
837 0.07
838 0.08
839 0.1
840 0.12
841 0.15
842 0.17
843 0.17
844 0.18
845 0.2
846 0.21
847 0.24
848 0.27
849 0.26
850 0.27
851 0.27
852 0.27
853 0.26
854 0.27
855 0.23
856 0.18
857 0.15
858 0.18
859 0.16
860 0.17
861 0.17
862 0.14
863 0.15
864 0.14
865 0.15
866 0.1
867 0.1
868 0.08
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.09
877 0.09
878 0.14
879 0.13
880 0.17
881 0.19
882 0.2
883 0.23
884 0.27
885 0.27
886 0.28
887 0.36
888 0.37
889 0.39
890 0.42
891 0.42
892 0.38
893 0.38
894 0.37
895 0.38
896 0.42
897 0.47
898 0.46
899 0.44
900 0.44
901 0.43
902 0.4
903 0.32
904 0.23
905 0.16
906 0.13
907 0.12
908 0.09
909 0.09
910 0.08
911 0.06
912 0.05
913 0.04
914 0.03
915 0.04
916 0.04
917 0.05
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.08
922 0.1
923 0.11
924 0.12
925 0.13
926 0.14
927 0.15
928 0.15
929 0.15
930 0.15
931 0.14
932 0.13
933 0.15
934 0.14
935 0.17
936 0.18
937 0.18
938 0.16
939 0.19
940 0.19
941 0.17
942 0.16
943 0.13
944 0.12
945 0.11
946 0.11
947 0.08
948 0.07
949 0.08
950 0.09
951 0.1
952 0.11
953 0.13
954 0.15
955 0.18
956 0.19
957 0.19
958 0.17
959 0.16
960 0.15
961 0.17
962 0.16
963 0.13
964 0.12
965 0.11
966 0.1
967 0.1
968 0.09
969 0.05
970 0.04
971 0.03
972 0.03
973 0.03
974 0.03
975 0.03
976 0.09
977 0.09
978 0.1
979 0.11
980 0.11
981 0.1
982 0.11
983 0.11
984 0.09
985 0.09
986 0.09
987 0.09
988 0.14
989 0.15
990 0.16
991 0.24
992 0.26
993 0.26
994 0.3
995 0.3
996 0.25
997 0.27
998 0.27
999 0.23
1000 0.2
1001 0.2
1002 0.17
1003 0.16
1004 0.15
1005 0.13
1006 0.11
1007 0.06
1008 0.05
1009 0.04
1010 0.03
1011 0.03
1012 0.03
1013 0.03
1014 0.03
1015 0.03
1016 0.04
1017 0.04
1018 0.04
1019 0.04
1020 0.04
1021 0.04
1022 0.04
1023 0.03
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.03
1027 0.02
1028 0.02
1029 0.02
1030 0.02
1031 0.02
1032 0.02
1033 0.02
1034 0.03
1035 0.04
1036 0.04
1037 0.05
1038 0.07
1039 0.13
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.16
1043 0.21
1044 0.26
1045 0.34
1046 0.4
1047 0.43
1048 0.49
1049 0.57
1050 0.58
1051 0.59
1052 0.62
1053 0.62
1054 0.58
1055 0.56
1056 0.53
1057 0.46
1058 0.42
1059 0.36
1060 0.27
1061 0.2
1062 0.16
1063 0.11
1064 0.07
1065 0.09
1066 0.09
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.11
1070 0.12
1071 0.12
1072 0.14
1073 0.12
1074 0.15
1075 0.15
1076 0.15
1077 0.14
1078 0.12
1079 0.11
1080 0.1
1081 0.1
1082 0.11
1083 0.11
1084 0.13
1085 0.14
1086 0.14
1087 0.17
1088 0.24
1089 0.28
1090 0.26
1091 0.25
1092 0.24
1093 0.24
1094 0.25
1095 0.22
1096 0.17
1097 0.12
1098 0.11
1099 0.11
1100 0.1
1101 0.17
1102 0.19
1103 0.2
1104 0.22
1105 0.23
1106 0.23
1107 0.23
1108 0.24
1109 0.18
1110 0.16
1111 0.15
1112 0.14
1113 0.13
1114 0.13
1115 0.14
1116 0.19
1117 0.23
1118 0.23
1119 0.27
1120 0.3
1121 0.38
1122 0.42
1123 0.47
1124 0.5
1125 0.52
1126 0.58
1127 0.58
1128 0.55
1129 0.54
1130 0.54
1131 0.53
1132 0.47
1133 0.45
1134 0.46
1135 0.51
1136 0.54
1137 0.53
1138 0.51
1139 0.47
1140 0.47
1141 0.46
1142 0.4
1143 0.34
1144 0.31
1145 0.29
1146 0.28
1147 0.32
1148 0.36
1149 0.41
1150 0.46
1151 0.5
1152 0.54
1153 0.56
1154 0.62
1155 0.64
1156 0.61
1157 0.55
1158 0.48
1159 0.45
1160 0.43
1161 0.39
1162 0.33
1163 0.27
1164 0.24
1165 0.27
1166 0.27
1167 0.25
1168 0.22
1169 0.24
1170 0.24
1171 0.28
1172 0.32
1173 0.29
1174 0.28
1175 0.29
1176 0.31
1177 0.35
1178 0.36
1179 0.33
1180 0.29
1181 0.29
1182 0.3
1183 0.28
1184 0.24
1185 0.19
1186 0.19
1187 0.19
1188 0.23
1189 0.24
1190 0.23
1191 0.23
1192 0.23
1193 0.25
1194 0.24
1195 0.24
1196 0.23
1197 0.26
1198 0.29
1199 0.3
1200 0.32
1201 0.31
1202 0.33
1203 0.34
1204 0.34
1205 0.34
1206 0.34
1207 0.38
1208 0.38
1209 0.39
1210 0.36
1211 0.38
1212 0.4
1213 0.35
1214 0.35
1215 0.36
1216 0.37
1217 0.35
1218 0.36
1219 0.36
1220 0.33
1221 0.34
1222 0.36
1223 0.35
1224 0.35
1225 0.39
1226 0.43
1227 0.44
1228 0.42
1229 0.41
1230 0.43
1231 0.4
1232 0.41
1233 0.4
1234 0.41
1235 0.36
1236 0.39
1237 0.38
1238 0.33
1239 0.32
1240 0.29
1241 0.27
1242 0.19
1243 0.17
1244 0.14
1245 0.13
1246 0.1
1247 0.08
1248 0.08
1249 0.08
1250 0.09
1251 0.11
1252 0.13
1253 0.16
1254 0.18
1255 0.2
1256 0.24
1257 0.26
1258 0.28
1259 0.29
1260 0.3
1261 0.29
1262 0.29
1263 0.31
1264 0.37
1265 0.41
1266 0.47
1267 0.52
1268 0.53
1269 0.54
1270 0.59
1271 0.61
1272 0.58
1273 0.57
1274 0.55
1275 0.53
1276 0.5
1277 0.48
1278 0.41
1279 0.34
1280 0.28
1281 0.24
1282 0.18
1283 0.12
1284 0.11
1285 0.11
1286 0.16
1287 0.18
1288 0.19
1289 0.21
1290 0.29
1291 0.31
1292 0.38
1293 0.44
1294 0.4
1295 0.4
1296 0.39
1297 0.37
1298 0.31
1299 0.29
1300 0.21
1301 0.15
1302 0.15
1303 0.13
1304 0.12
1305 0.09
1306 0.07
1307 0.06
1308 0.07
1309 0.06
1310 0.08
1311 0.1
1312 0.1
1313 0.14
1314 0.17
1315 0.18
1316 0.22
1317 0.29
1318 0.33
1319 0.39
1320 0.45