Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JRN6

Protein Details
Accession E3JRN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-200MPNTRPAKRAKVRPARPIDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-189R
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_00731  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSQKLLANTSDARMEDGETIFPTTASLSVIAPHPTATTTTEAGGSGNADHAGRGSAPIKETEVDRFNPQHLLLPLSNISKLMKASVPLDSKISNPSKLLIQACVSEFISFLTSDANEQVLAEKRRTLNGVDLICAVRRLGFEGYYEALQIYLAKYRTVANETGKRHRRPRADDDQEEPEDMPNTRPAKRAKVRPARPIDQAQPAHLGRQDDDEAEEDDDEDDESDKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.15
6 0.16
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.25
52 0.25
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.25
57 0.22
58 0.24
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.2
64 0.16
65 0.16
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.24
79 0.25
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.22
85 0.22
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.07
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.16
110 0.16
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.2
116 0.2
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.16
122 0.12
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.17
145 0.2
146 0.23
147 0.3
148 0.35
149 0.45
150 0.52
151 0.57
152 0.62
153 0.67
154 0.69
155 0.7
156 0.74
157 0.75
158 0.76
159 0.72
160 0.69
161 0.68
162 0.6
163 0.53
164 0.44
165 0.34
166 0.26
167 0.23
168 0.2
169 0.2
170 0.23
171 0.24
172 0.3
173 0.33
174 0.42
175 0.5
176 0.59
177 0.62
178 0.7
179 0.76
180 0.8
181 0.84
182 0.78
183 0.76
184 0.73
185 0.68
186 0.66
187 0.59
188 0.51
189 0.5
190 0.45
191 0.42
192 0.37
193 0.34
194 0.25
195 0.29
196 0.28
197 0.22
198 0.23
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.19
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.09