Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KR20

Protein Details
Accession E3KR20    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-146GEGWHKRKRVPVPPVPPKVKTKNEEKDPKKRKLKEAVMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-142HKRKRVPVPPVPPKVKTKNEEKDPKKRKLKE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pgr:PGTG_13127  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MLDPFTGPLPAEIYPPPPNKRADTLAIKQAIAEALSEDEGLAYWTSLVKFLTGKLDRTEFEVQTAYLLKSETLVGLHNALILSILYNTTRPDPAISNPLKEPGPSTTGEGWHKRKRVPVPPVPPKVKTKNEEKDPKKRKLKEAVMALGQRERNRLKQIALLKENELELNSNKFNPQQLAPRQLSACHYLYPERTENVMNTPLASKMKISSSTLYQDYMRCQQAPICSESKQLPDFDTLKDRMSLIAYDSGLMNGVDKAASSLALIALEVHLKTLLGDLLSLIRSDRSVATPADCELATTMSIDRTQPVESQSQSLTEAPVASTSARPYSSPADPLTRPDPTSSPSKPATVSLANQAFQASSNLRLRDLKTQGLAPHLTSRDVAALAEISPHAFGRTHPAALERLIAVCNSSNDTSSSSTTTNGHTENHPDRIIHNNHHTNSNVNLVENYLLIEQKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.36
3 0.4
4 0.43
5 0.48
6 0.49
7 0.53
8 0.53
9 0.53
10 0.54
11 0.54
12 0.57
13 0.55
14 0.5
15 0.44
16 0.4
17 0.33
18 0.24
19 0.19
20 0.11
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.07
29 0.06
30 0.06
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.13
38 0.22
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.32
43 0.31
44 0.36
45 0.41
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.25
50 0.24
51 0.26
52 0.2
53 0.14
54 0.15
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.09
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.19
81 0.28
82 0.29
83 0.3
84 0.3
85 0.33
86 0.31
87 0.29
88 0.28
89 0.21
90 0.22
91 0.2
92 0.23
93 0.22
94 0.27
95 0.33
96 0.39
97 0.44
98 0.49
99 0.53
100 0.52
101 0.58
102 0.62
103 0.65
104 0.67
105 0.68
106 0.71
107 0.77
108 0.83
109 0.8
110 0.76
111 0.74
112 0.74
113 0.72
114 0.67
115 0.67
116 0.67
117 0.72
118 0.78
119 0.78
120 0.8
121 0.8
122 0.86
123 0.85
124 0.83
125 0.82
126 0.82
127 0.82
128 0.78
129 0.76
130 0.69
131 0.64
132 0.58
133 0.5
134 0.44
135 0.39
136 0.33
137 0.32
138 0.32
139 0.32
140 0.36
141 0.37
142 0.34
143 0.37
144 0.42
145 0.44
146 0.45
147 0.41
148 0.36
149 0.35
150 0.34
151 0.28
152 0.21
153 0.15
154 0.13
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.23
164 0.28
165 0.35
166 0.35
167 0.36
168 0.34
169 0.34
170 0.33
171 0.3
172 0.26
173 0.19
174 0.19
175 0.19
176 0.2
177 0.23
178 0.23
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.11
192 0.1
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.17
208 0.19
209 0.21
210 0.22
211 0.22
212 0.19
213 0.18
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.19
221 0.2
222 0.19
223 0.22
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.09
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.17
296 0.17
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.15
315 0.18
316 0.2
317 0.22
318 0.23
319 0.26
320 0.26
321 0.3
322 0.31
323 0.3
324 0.29
325 0.28
326 0.28
327 0.25
328 0.32
329 0.3
330 0.32
331 0.31
332 0.32
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.27
337 0.26
338 0.29
339 0.3
340 0.28
341 0.28
342 0.26
343 0.21
344 0.19
345 0.21
346 0.14
347 0.17
348 0.22
349 0.23
350 0.25
351 0.29
352 0.3
353 0.36
354 0.39
355 0.36
356 0.33
357 0.35
358 0.35
359 0.36
360 0.35
361 0.28
362 0.31
363 0.28
364 0.27
365 0.24
366 0.23
367 0.19
368 0.18
369 0.16
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.17
382 0.2
383 0.2
384 0.2
385 0.23
386 0.23
387 0.24
388 0.26
389 0.17
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.16
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.2
401 0.21
402 0.21
403 0.23
404 0.2
405 0.21
406 0.22
407 0.24
408 0.25
409 0.24
410 0.25
411 0.24
412 0.33
413 0.36
414 0.4
415 0.39
416 0.35
417 0.36
418 0.43
419 0.47
420 0.45
421 0.5
422 0.53
423 0.54
424 0.58
425 0.57
426 0.51
427 0.47
428 0.47
429 0.38
430 0.3
431 0.28
432 0.24
433 0.24
434 0.21
435 0.19
436 0.13