Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KDE9

Protein Details
Accession E3KDE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-250RDSRDRDRSPRDRSRDRERDRSPRDRRYDRERRRSPPPRDDRDRERDRGYDRKERDRSPRRDVRADSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-247GGGGRRDRSRSPAYRDSRDRDRSPRDRSRDRERDRSPRDRRYDRERRRSPPPRDDRDRERDRGYDRKERDRSPRRDVR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_07555  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12339  RRM2_SRSF1_4_like  
Amino Acid Sequences MASAGRRIYVGRIPPDASRTDVEKYFGRYGTLMDVRIMAGFGFLEYDSVRDAEDAVHDLNGRDFMGERLIVEFAKAPRGRDIHSGGHGPRRGGFRLLVKGLSHETSWQDLKDFARQAGNVTRADVDRNMPGEGLIEFASQDDADNAIRKLDGTELKGMVVTLIEDRPGGGGGGRRDRSRSPAYRDSRDRDRSPRDRSRDRERDRSPRDRRYDRERRRSPPPRDDRDRERDRGYDRKERDRSPRRDVRADSVSKKSPSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.37
4 0.35
5 0.3
6 0.29
7 0.3
8 0.29
9 0.3
10 0.3
11 0.34
12 0.35
13 0.33
14 0.31
15 0.27
16 0.26
17 0.3
18 0.29
19 0.24
20 0.2
21 0.2
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.09
26 0.07
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.12
60 0.11
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.25
65 0.27
66 0.29
67 0.31
68 0.35
69 0.29
70 0.31
71 0.34
72 0.3
73 0.35
74 0.35
75 0.3
76 0.29
77 0.3
78 0.28
79 0.26
80 0.27
81 0.24
82 0.27
83 0.28
84 0.25
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.23
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.16
110 0.17
111 0.15
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.1
146 0.08
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.09
158 0.12
159 0.2
160 0.22
161 0.23
162 0.26
163 0.28
164 0.34
165 0.39
166 0.42
167 0.43
168 0.51
169 0.57
170 0.62
171 0.68
172 0.68
173 0.69
174 0.7
175 0.68
176 0.67
177 0.7
178 0.7
179 0.73
180 0.77
181 0.76
182 0.77
183 0.79
184 0.81
185 0.82
186 0.81
187 0.82
188 0.81
189 0.82
190 0.82
191 0.85
192 0.84
193 0.83
194 0.86
195 0.84
196 0.83
197 0.83
198 0.85
199 0.85
200 0.86
201 0.86
202 0.82
203 0.84
204 0.87
205 0.86
206 0.86
207 0.85
208 0.84
209 0.85
210 0.87
211 0.86
212 0.86
213 0.85
214 0.8
215 0.74
216 0.7
217 0.67
218 0.69
219 0.67
220 0.66
221 0.65
222 0.7
223 0.73
224 0.74
225 0.78
226 0.79
227 0.8
228 0.8
229 0.83
230 0.8
231 0.81
232 0.78
233 0.75
234 0.74
235 0.74
236 0.69
237 0.68
238 0.67