Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JZP9

Protein Details
Accession E3JZP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-323KLPTPQPPVFFKKRKATQAQPRQKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pgr:PGTG_03480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MTEYWVSKQSYYCKYCDIFIRDDKPSRAQHENGLRHKGNLERYIRDIYKKEDRAKKERTDEASQVSKIEKAARLAHQQKDLALVEGEKEVKEETEEGDEPRKRPKYDKQDWKGAEDLQNYSDARSLGFIPDTDSEAARALKEEEEAEAEARSKEGRMGQWEAVLKIQPSNRAGSSASTQAPISREKIVSQLTHDRDPDNKPIRKLFSERNLEAEPDTEILEGMQIKVKVDRRAKAQEDRSLSGSRIHGSLQPIRLDGLQSNQTEPIKSEESSPSAPDPSFKNDLAQEVEDVKPDVDDLKLPTPQPPVFFKKRKATQAQPRQKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.5
4 0.47
5 0.44
6 0.48
7 0.52
8 0.53
9 0.58
10 0.58
11 0.57
12 0.59
13 0.58
14 0.57
15 0.53
16 0.55
17 0.58
18 0.64
19 0.64
20 0.66
21 0.61
22 0.55
23 0.57
24 0.54
25 0.51
26 0.5
27 0.48
28 0.42
29 0.46
30 0.52
31 0.51
32 0.51
33 0.47
34 0.46
35 0.51
36 0.55
37 0.61
38 0.62
39 0.67
40 0.71
41 0.76
42 0.78
43 0.75
44 0.75
45 0.73
46 0.7
47 0.66
48 0.63
49 0.6
50 0.51
51 0.45
52 0.38
53 0.32
54 0.27
55 0.28
56 0.24
57 0.22
58 0.27
59 0.3
60 0.39
61 0.45
62 0.48
63 0.48
64 0.46
65 0.42
66 0.42
67 0.38
68 0.29
69 0.22
70 0.18
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.23
85 0.26
86 0.26
87 0.35
88 0.4
89 0.38
90 0.44
91 0.52
92 0.55
93 0.63
94 0.72
95 0.69
96 0.73
97 0.72
98 0.69
99 0.61
100 0.53
101 0.47
102 0.38
103 0.33
104 0.24
105 0.26
106 0.22
107 0.2
108 0.19
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.1
143 0.13
144 0.17
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.16
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.21
177 0.27
178 0.27
179 0.3
180 0.3
181 0.28
182 0.3
183 0.33
184 0.38
185 0.4
186 0.4
187 0.4
188 0.45
189 0.48
190 0.48
191 0.49
192 0.47
193 0.47
194 0.51
195 0.48
196 0.48
197 0.45
198 0.41
199 0.37
200 0.3
201 0.21
202 0.14
203 0.14
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.15
214 0.2
215 0.28
216 0.33
217 0.37
218 0.4
219 0.49
220 0.54
221 0.58
222 0.6
223 0.59
224 0.58
225 0.57
226 0.54
227 0.47
228 0.42
229 0.37
230 0.32
231 0.26
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.23
236 0.27
237 0.27
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.25
242 0.24
243 0.2
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.26
249 0.26
250 0.25
251 0.25
252 0.26
253 0.23
254 0.22
255 0.25
256 0.24
257 0.28
258 0.29
259 0.3
260 0.27
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.27
266 0.3
267 0.28
268 0.3
269 0.28
270 0.32
271 0.33
272 0.3
273 0.25
274 0.24
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.18
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.1
283 0.12
284 0.15
285 0.19
286 0.23
287 0.24
288 0.28
289 0.34
290 0.35
291 0.37
292 0.4
293 0.44
294 0.51
295 0.59
296 0.64
297 0.68
298 0.74
299 0.8
300 0.82
301 0.84
302 0.84
303 0.87