Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KIN8

Protein Details
Accession E3KIN8    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-416KPQTSNPRKKAPPKKRVGRSADSHydrophilic
695-727HSNNKQSSSQRSRGKKRAPGGRDRNRKKFPSQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-411PRKKAPPKKRVG
705-722RSRGKKRAPGGRDRNRKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG pgr:PGTG_10541  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSGNAEGEHIPVPTTSAPVLAAAPPSQSLQESHPQNPPYVNQMVEDIISKATAYFPQSSSVTPLTFSNQFNPSQYPLGPQSYNMHHWSPSDVSAQPMHHMMAQPQVPISSSQIPSPSVDPRSHLPQDILHILQSDFTSDSADNQARKDQQISRVAEELRVKVRLSRYTRVRDQLSDSEDEVSEQGKESDISEDESEEGSEKNSEDRMNNRKVNPQSDIDDEADLVDGSGDEEEERAKNNKVLAKLKMEIESIIGIPESATGPTEEAAETMTTTIQPDEKPTITNELELLTEIEAVAEAPEHVQISTIAEPEDAPAVTSIPEDPSVTELLAKVKSQIDQLNKSSEPTSIIIPSETRIKEESPPNPEPETVTPASLSTPTTVEAKPAPQGSSSQVKPQTSNPRKKAPPKKRVGRSADSGDESDDEGQESYLATAGPTTANELKEPPSEVVEVPFTRVTDEELKSINPFGSISSLIGNVLVIQGTAGLGYDRVLDEGTLVCQKDGLVIGKIFETFGSVTNPHYSIRLPNHILASHPRNDKEGLDLSPGLVMYYLPTHSNFVFTAELRAQPKGTDASNFYDEEVGNADEIEFSDDEAEAAYRKACRLAKKTANDPHPNPHHQNHPRENNHQDHARANNSVQVSENGRRMFVKMTSDRLNYGTDDGDLPSQSGTVESDYSLLQRPKASNDPSMSMSTPTHSNNKQSSSQRSRGKKRAPGGRDRNRKKFPSQTSHASSSQPGPTSSVSGTNGGSNHPNGNSRANFQADRTSTNPGIQSQLNSLPANPNSNLLQSPRDVQGSLMSTLGNMNMNFVTQPPSHSLQQSMHSLPYTPMWTAPNGMAMTQNPMMMSMMMNQNAYYQSNAGIPSYNPHLPAHSSNPILQFGLQHPNFASVPPAQQLSSQHPSSNPSFQFSQLSQQPQNHQAQNQAQNNQPSHPFPTTPNFSTGGHFNPSFYRPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.14
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.19
17 0.27
18 0.31
19 0.35
20 0.41
21 0.42
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.39
26 0.37
27 0.33
28 0.26
29 0.27
30 0.25
31 0.23
32 0.22
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.15
41 0.18
42 0.19
43 0.23
44 0.25
45 0.25
46 0.29
47 0.29
48 0.25
49 0.22
50 0.23
51 0.23
52 0.28
53 0.29
54 0.29
55 0.3
56 0.31
57 0.33
58 0.35
59 0.34
60 0.32
61 0.3
62 0.3
63 0.31
64 0.35
65 0.32
66 0.32
67 0.34
68 0.36
69 0.4
70 0.39
71 0.37
72 0.33
73 0.33
74 0.35
75 0.31
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.25
80 0.27
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.2
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.19
94 0.19
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.26
101 0.27
102 0.29
103 0.31
104 0.28
105 0.28
106 0.29
107 0.31
108 0.39
109 0.4
110 0.38
111 0.33
112 0.31
113 0.35
114 0.36
115 0.32
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.11
126 0.13
127 0.18
128 0.23
129 0.22
130 0.24
131 0.3
132 0.31
133 0.33
134 0.37
135 0.36
136 0.4
137 0.48
138 0.5
139 0.46
140 0.48
141 0.46
142 0.45
143 0.44
144 0.4
145 0.35
146 0.33
147 0.3
148 0.3
149 0.36
150 0.39
151 0.42
152 0.47
153 0.52
154 0.58
155 0.65
156 0.68
157 0.66
158 0.6
159 0.6
160 0.57
161 0.53
162 0.47
163 0.4
164 0.35
165 0.31
166 0.28
167 0.22
168 0.16
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.13
190 0.15
191 0.18
192 0.26
193 0.34
194 0.42
195 0.47
196 0.48
197 0.55
198 0.58
199 0.6
200 0.56
201 0.51
202 0.45
203 0.43
204 0.43
205 0.36
206 0.3
207 0.25
208 0.2
209 0.17
210 0.13
211 0.09
212 0.06
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.12
223 0.14
224 0.17
225 0.21
226 0.25
227 0.3
228 0.35
229 0.37
230 0.39
231 0.4
232 0.41
233 0.38
234 0.35
235 0.28
236 0.24
237 0.2
238 0.15
239 0.12
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.12
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.24
269 0.22
270 0.22
271 0.19
272 0.16
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.21
323 0.25
324 0.29
325 0.31
326 0.34
327 0.32
328 0.33
329 0.3
330 0.25
331 0.22
332 0.18
333 0.17
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.18
344 0.24
345 0.3
346 0.34
347 0.35
348 0.38
349 0.39
350 0.39
351 0.38
352 0.35
353 0.3
354 0.31
355 0.23
356 0.21
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.13
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.12
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.13
374 0.15
375 0.17
376 0.22
377 0.22
378 0.25
379 0.28
380 0.29
381 0.3
382 0.36
383 0.44
384 0.47
385 0.57
386 0.55
387 0.6
388 0.66
389 0.75
390 0.79
391 0.79
392 0.79
393 0.8
394 0.85
395 0.84
396 0.87
397 0.84
398 0.77
399 0.72
400 0.66
401 0.58
402 0.49
403 0.41
404 0.31
405 0.24
406 0.2
407 0.15
408 0.11
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.07
423 0.09
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.13
428 0.14
429 0.16
430 0.13
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.15
444 0.16
445 0.15
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.16
450 0.13
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.02
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.06
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.11
504 0.12
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.15
509 0.18
510 0.22
511 0.23
512 0.24
513 0.25
514 0.24
515 0.25
516 0.25
517 0.26
518 0.27
519 0.28
520 0.27
521 0.27
522 0.28
523 0.27
524 0.25
525 0.24
526 0.18
527 0.17
528 0.16
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.1
533 0.07
534 0.06
535 0.04
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.09
541 0.09
542 0.11
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.11
547 0.14
548 0.13
549 0.17
550 0.16
551 0.17
552 0.15
553 0.14
554 0.16
555 0.15
556 0.14
557 0.13
558 0.14
559 0.17
560 0.19
561 0.19
562 0.18
563 0.18
564 0.17
565 0.15
566 0.14
567 0.1
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.04
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.13
587 0.16
588 0.24
589 0.29
590 0.38
591 0.45
592 0.5
593 0.58
594 0.61
595 0.66
596 0.66
597 0.64
598 0.63
599 0.62
600 0.64
601 0.61
602 0.56
603 0.58
604 0.58
605 0.65
606 0.66
607 0.68
608 0.67
609 0.69
610 0.73
611 0.67
612 0.64
613 0.58
614 0.51
615 0.45
616 0.43
617 0.39
618 0.33
619 0.28
620 0.28
621 0.25
622 0.23
623 0.2
624 0.18
625 0.2
626 0.22
627 0.27
628 0.22
629 0.23
630 0.23
631 0.23
632 0.23
633 0.2
634 0.24
635 0.22
636 0.27
637 0.31
638 0.32
639 0.32
640 0.31
641 0.31
642 0.24
643 0.22
644 0.17
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.11
649 0.1
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.07
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.15
663 0.15
664 0.16
665 0.19
666 0.2
667 0.25
668 0.32
669 0.34
670 0.34
671 0.36
672 0.37
673 0.36
674 0.37
675 0.32
676 0.27
677 0.24
678 0.2
679 0.21
680 0.21
681 0.26
682 0.26
683 0.33
684 0.35
685 0.39
686 0.45
687 0.48
688 0.55
689 0.57
690 0.63
691 0.65
692 0.71
693 0.76
694 0.78
695 0.81
696 0.78
697 0.78
698 0.79
699 0.78
700 0.79
701 0.8
702 0.81
703 0.83
704 0.84
705 0.86
706 0.85
707 0.83
708 0.8
709 0.79
710 0.78
711 0.77
712 0.74
713 0.72
714 0.7
715 0.7
716 0.64
717 0.56
718 0.48
719 0.43
720 0.4
721 0.33
722 0.27
723 0.24
724 0.23
725 0.23
726 0.22
727 0.21
728 0.18
729 0.19
730 0.19
731 0.18
732 0.18
733 0.17
734 0.19
735 0.17
736 0.19
737 0.19
738 0.22
739 0.22
740 0.29
741 0.29
742 0.29
743 0.32
744 0.34
745 0.33
746 0.31
747 0.36
748 0.3
749 0.33
750 0.32
751 0.35
752 0.31
753 0.33
754 0.33
755 0.26
756 0.28
757 0.25
758 0.24
759 0.21
760 0.24
761 0.25
762 0.23
763 0.23
764 0.26
765 0.27
766 0.3
767 0.27
768 0.26
769 0.23
770 0.25
771 0.26
772 0.22
773 0.23
774 0.2
775 0.23
776 0.23
777 0.23
778 0.21
779 0.19
780 0.22
781 0.22
782 0.22
783 0.19
784 0.15
785 0.14
786 0.14
787 0.15
788 0.13
789 0.1
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.12
795 0.16
796 0.13
797 0.16
798 0.19
799 0.23
800 0.26
801 0.28
802 0.3
803 0.28
804 0.32
805 0.35
806 0.32
807 0.3
808 0.27
809 0.27
810 0.24
811 0.25
812 0.23
813 0.18
814 0.19
815 0.18
816 0.19
817 0.2
818 0.19
819 0.21
820 0.19
821 0.19
822 0.18
823 0.17
824 0.21
825 0.2
826 0.2
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.13
831 0.13
832 0.12
833 0.16
834 0.17
835 0.17
836 0.16
837 0.18
838 0.19
839 0.2
840 0.17
841 0.13
842 0.13
843 0.15
844 0.16
845 0.15
846 0.14
847 0.14
848 0.16
849 0.22
850 0.23
851 0.22
852 0.22
853 0.24
854 0.27
855 0.31
856 0.34
857 0.34
858 0.35
859 0.36
860 0.39
861 0.38
862 0.34
863 0.3
864 0.26
865 0.24
866 0.32
867 0.29
868 0.27
869 0.26
870 0.3
871 0.29
872 0.26
873 0.26
874 0.18
875 0.21
876 0.22
877 0.23
878 0.19
879 0.22
880 0.26
881 0.31
882 0.36
883 0.34
884 0.34
885 0.34
886 0.39
887 0.41
888 0.46
889 0.39
890 0.37
891 0.37
892 0.37
893 0.4
894 0.36
895 0.4
896 0.38
897 0.44
898 0.45
899 0.49
900 0.53
901 0.56
902 0.63
903 0.6
904 0.55
905 0.56
906 0.59
907 0.64
908 0.64
909 0.61
910 0.59
911 0.62
912 0.62
913 0.57
914 0.53
915 0.46
916 0.46
917 0.44
918 0.41
919 0.37
920 0.45
921 0.48
922 0.46
923 0.46
924 0.43
925 0.4
926 0.41
927 0.4
928 0.35
929 0.33
930 0.31
931 0.29
932 0.31