Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JY04

Protein Details
Accession E3JY04    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MQRIVKPKNARSKRALQAREPKLHydrophilic
334-367LGKLQSRKMKGLKKDKPSKKKSDRQKTSDHDGSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-357SRKMKGLKKDKPSKKKSDR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG pgr:PGTG_02390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MQRIVKPKNARSKRALQAREPKLVEDPKVSIFVKSTQTSEKVRIALSELHQLRSSAHSIQFAKRNLIHPFEDSSSLQFWSVKNDASLFLIGSDSKKRPDNLTFVRMFDHEVLDMVEVGIEGAVSLADIKGPKTSPGLIPLFHFVGTLWDSNERYKQFKSILLDFFRGQEIHSIDLVHGLQYVISVSVGEIDQPGTTTSLLNLDPSALPTPSDETPNQTDKPKTPKPVSLVDSSQTNLSENLQGLPLVHFRTYLVQLLKSGQREPRVELLPHGPSFDFRLRRAQGPSEELLKLALQRHLPKKPAGENKKAQGNKNVDIDEMGDKVGKIHVGQQELGKLQSRKMKGLKKDKPSKKKSDRQKTSDHDGSDGEIEMEDGAQEADEMGAIVELEQSKVTRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.79
4 0.8
5 0.79
6 0.8
7 0.71
8 0.63
9 0.61
10 0.6
11 0.53
12 0.47
13 0.43
14 0.36
15 0.41
16 0.39
17 0.31
18 0.28
19 0.3
20 0.32
21 0.31
22 0.32
23 0.32
24 0.37
25 0.4
26 0.43
27 0.42
28 0.38
29 0.36
30 0.34
31 0.32
32 0.32
33 0.31
34 0.35
35 0.32
36 0.32
37 0.33
38 0.32
39 0.3
40 0.29
41 0.29
42 0.24
43 0.24
44 0.29
45 0.31
46 0.37
47 0.43
48 0.42
49 0.45
50 0.44
51 0.47
52 0.45
53 0.47
54 0.42
55 0.37
56 0.39
57 0.35
58 0.34
59 0.29
60 0.27
61 0.24
62 0.22
63 0.21
64 0.19
65 0.17
66 0.2
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.19
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.12
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.26
83 0.28
84 0.32
85 0.37
86 0.44
87 0.44
88 0.5
89 0.47
90 0.44
91 0.43
92 0.38
93 0.36
94 0.27
95 0.22
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.07
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.18
129 0.17
130 0.1
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.12
136 0.14
137 0.16
138 0.21
139 0.2
140 0.22
141 0.22
142 0.25
143 0.25
144 0.28
145 0.3
146 0.3
147 0.34
148 0.33
149 0.34
150 0.31
151 0.29
152 0.27
153 0.22
154 0.17
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.12
200 0.15
201 0.19
202 0.23
203 0.25
204 0.25
205 0.27
206 0.29
207 0.38
208 0.4
209 0.43
210 0.42
211 0.45
212 0.46
213 0.5
214 0.49
215 0.44
216 0.39
217 0.33
218 0.31
219 0.27
220 0.24
221 0.17
222 0.14
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.19
244 0.22
245 0.21
246 0.24
247 0.23
248 0.28
249 0.3
250 0.32
251 0.35
252 0.35
253 0.34
254 0.32
255 0.33
256 0.31
257 0.3
258 0.28
259 0.22
260 0.19
261 0.24
262 0.28
263 0.27
264 0.24
265 0.33
266 0.34
267 0.38
268 0.41
269 0.41
270 0.38
271 0.39
272 0.39
273 0.34
274 0.32
275 0.27
276 0.25
277 0.2
278 0.19
279 0.17
280 0.19
281 0.2
282 0.28
283 0.35
284 0.4
285 0.43
286 0.44
287 0.48
288 0.54
289 0.6
290 0.6
291 0.63
292 0.64
293 0.67
294 0.72
295 0.71
296 0.66
297 0.65
298 0.63
299 0.58
300 0.57
301 0.51
302 0.41
303 0.37
304 0.35
305 0.27
306 0.21
307 0.16
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.15
315 0.19
316 0.21
317 0.23
318 0.24
319 0.27
320 0.28
321 0.29
322 0.29
323 0.26
324 0.28
325 0.35
326 0.36
327 0.4
328 0.48
329 0.54
330 0.58
331 0.68
332 0.73
333 0.76
334 0.84
335 0.87
336 0.89
337 0.91
338 0.92
339 0.91
340 0.92
341 0.92
342 0.92
343 0.92
344 0.88
345 0.89
346 0.85
347 0.84
348 0.81
349 0.71
350 0.62
351 0.51
352 0.47
353 0.37
354 0.3
355 0.2
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.1