Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JWX6

Protein Details
Accession E3JWX6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-34TTTTTTRKLRTPSRLRPPPPSSRLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
514-525PHPARIRDRRRE
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR044774  Suv3_DEXQc  
Gene Ontology GO:0045025  C:mitochondrial degradosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000965  P:mitochondrial RNA 3'-end processing  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG pgr:PGTG_02012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17913  DEXQc_Suv3  
cd18805  SF2_C_suv3  
Amino Acid Sequences MLKNKLQKTTTTTTTRKLRTPSRLRPPPPSSRLTTQPFSINNPIYHRILSTLGLLQHTQTEATSTNNRQLAELINHYNLTNQPSNSRSSSKNTIQEQSNPTELSNFIPWAASLNNPPIHPLLKSSLQSLSRLIDIRRPEDLYPDARRYKRQIHLHVGPTNSGKTHSALRALHSAHTGVYAGPLRLLAHEVFTRINAGQIAPDLAPRPCNLLTGEEQRISSPTAGLTSCTVEMLSCQQFYDVVVIDEIQMIGDHFRGDAWTQAVLGVQAKELHLCGEESVVGLIESLANSCQDEFILHRYQRLTPLKVADSSLKGDLSKVQRGDCLVTFSRNNIYALKKAIQSATDLRVGMAYGGLPPEVREREAQMFNLGSQVEGEGGYDVLVGSDAIGMGLNLKIKRVIFQSLHKFDGRNEVALSTSQIKQIGGRAGRFGILPKNAGPGESGESREEGRTVGEVLTMNETDMSLLRRSMAAPFEKIERAVLKAPFTTVEGLARRAPPRGALLQSTRPAKVPDPHPARIRDRRREELGLDRRRAPTHPAPQSLRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.66
4 0.67
5 0.68
6 0.7
7 0.76
8 0.78
9 0.79
10 0.85
11 0.84
12 0.86
13 0.85
14 0.84
15 0.8
16 0.76
17 0.71
18 0.67
19 0.7
20 0.67
21 0.62
22 0.54
23 0.55
24 0.51
25 0.5
26 0.52
27 0.48
28 0.45
29 0.47
30 0.49
31 0.44
32 0.42
33 0.36
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.2
39 0.19
40 0.2
41 0.2
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.16
50 0.23
51 0.24
52 0.31
53 0.33
54 0.34
55 0.32
56 0.32
57 0.32
58 0.3
59 0.32
60 0.29
61 0.28
62 0.28
63 0.27
64 0.29
65 0.26
66 0.28
67 0.27
68 0.25
69 0.28
70 0.29
71 0.34
72 0.35
73 0.37
74 0.35
75 0.37
76 0.45
77 0.47
78 0.53
79 0.54
80 0.56
81 0.55
82 0.59
83 0.57
84 0.53
85 0.49
86 0.42
87 0.37
88 0.32
89 0.29
90 0.24
91 0.21
92 0.17
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.19
101 0.21
102 0.21
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.21
109 0.24
110 0.25
111 0.25
112 0.29
113 0.29
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.22
121 0.25
122 0.26
123 0.28
124 0.29
125 0.26
126 0.28
127 0.31
128 0.32
129 0.34
130 0.39
131 0.43
132 0.44
133 0.49
134 0.51
135 0.56
136 0.59
137 0.63
138 0.63
139 0.64
140 0.69
141 0.7
142 0.68
143 0.6
144 0.53
145 0.46
146 0.39
147 0.31
148 0.25
149 0.19
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.29
157 0.28
158 0.28
159 0.24
160 0.23
161 0.17
162 0.16
163 0.14
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.24
200 0.26
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.22
205 0.2
206 0.17
207 0.11
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.07
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.1
282 0.16
283 0.16
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.29
288 0.33
289 0.31
290 0.27
291 0.3
292 0.3
293 0.29
294 0.29
295 0.23
296 0.2
297 0.19
298 0.18
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.17
303 0.19
304 0.22
305 0.21
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.24
310 0.19
311 0.2
312 0.17
313 0.19
314 0.18
315 0.19
316 0.21
317 0.2
318 0.2
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.2
332 0.19
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.12
337 0.09
338 0.06
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.05
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.17
349 0.22
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.21
354 0.19
355 0.2
356 0.16
357 0.11
358 0.09
359 0.09
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.12
383 0.12
384 0.16
385 0.18
386 0.23
387 0.23
388 0.31
389 0.41
390 0.43
391 0.46
392 0.45
393 0.43
394 0.38
395 0.45
396 0.38
397 0.29
398 0.26
399 0.23
400 0.22
401 0.22
402 0.23
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.17
409 0.2
410 0.25
411 0.25
412 0.24
413 0.24
414 0.24
415 0.24
416 0.23
417 0.22
418 0.21
419 0.2
420 0.21
421 0.19
422 0.24
423 0.24
424 0.23
425 0.22
426 0.18
427 0.2
428 0.21
429 0.22
430 0.18
431 0.19
432 0.2
433 0.2
434 0.18
435 0.14
436 0.13
437 0.11
438 0.12
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.13
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.16
457 0.2
458 0.21
459 0.22
460 0.24
461 0.27
462 0.28
463 0.28
464 0.28
465 0.24
466 0.24
467 0.28
468 0.29
469 0.28
470 0.27
471 0.27
472 0.24
473 0.25
474 0.23
475 0.18
476 0.22
477 0.21
478 0.23
479 0.27
480 0.31
481 0.31
482 0.32
483 0.32
484 0.29
485 0.32
486 0.35
487 0.34
488 0.35
489 0.39
490 0.43
491 0.49
492 0.51
493 0.47
494 0.44
495 0.44
496 0.43
497 0.46
498 0.44
499 0.48
500 0.52
501 0.57
502 0.62
503 0.66
504 0.7
505 0.73
506 0.77
507 0.77
508 0.78
509 0.8
510 0.8
511 0.77
512 0.72
513 0.72
514 0.72
515 0.71
516 0.67
517 0.65
518 0.63
519 0.6
520 0.58
521 0.56
522 0.56
523 0.56
524 0.6
525 0.63