Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KI53

Protein Details
Accession E3KI53    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-198AHKAERLLKKKRSRRENPLRKKAVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-205KAERLLKKKRSRRENPLRKKAVEAKEAARK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pgr:PGTG_09691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12246  RRM1_U1A_like  
cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MEVINAQVPQPEAIQQDQEAKPEMEKTITTASASASATDLKPTENSQIPAGLTDTTIPTNSSDEKESEQVDKIPDDATETVYLNNLNERVKLPALKQTLKNLLKNFGPVLDVVAHRSVRMRGQAFVAFPDREMAAKAVKEVKGFPLYGKPIEIAFARSPADCVVKRKTPDDFEAHKAERLLKKKRSRRENPLRKKAVEAKEAARKAASTAASAGPMASSVPPASSNRKIVQMPDEYQPPNKILFIQNLPENAGKDALEVLFKQYPNLVEVRTIPGRSNIAFVEYVDATSSGVAKDALHNYKFDGEHKIKVTFAKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.29
4 0.29
5 0.3
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.28
10 0.28
11 0.21
12 0.2
13 0.21
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.19
18 0.18
19 0.2
20 0.2
21 0.16
22 0.13
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.16
27 0.13
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.24
32 0.26
33 0.24
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.17
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.14
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.21
52 0.23
53 0.24
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.2
79 0.19
80 0.24
81 0.3
82 0.33
83 0.35
84 0.39
85 0.47
86 0.49
87 0.53
88 0.47
89 0.45
90 0.4
91 0.39
92 0.33
93 0.24
94 0.19
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.2
107 0.19
108 0.17
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.17
115 0.15
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.15
148 0.13
149 0.17
150 0.2
151 0.24
152 0.26
153 0.28
154 0.3
155 0.29
156 0.32
157 0.35
158 0.34
159 0.34
160 0.38
161 0.37
162 0.35
163 0.32
164 0.34
165 0.33
166 0.37
167 0.42
168 0.45
169 0.54
170 0.61
171 0.7
172 0.75
173 0.78
174 0.81
175 0.84
176 0.86
177 0.87
178 0.9
179 0.88
180 0.78
181 0.75
182 0.73
183 0.68
184 0.61
185 0.53
186 0.48
187 0.5
188 0.49
189 0.44
190 0.35
191 0.28
192 0.24
193 0.25
194 0.2
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.11
210 0.18
211 0.22
212 0.26
213 0.27
214 0.32
215 0.33
216 0.33
217 0.37
218 0.35
219 0.34
220 0.33
221 0.37
222 0.33
223 0.36
224 0.35
225 0.31
226 0.26
227 0.24
228 0.24
229 0.21
230 0.25
231 0.25
232 0.26
233 0.27
234 0.27
235 0.29
236 0.28
237 0.26
238 0.22
239 0.2
240 0.16
241 0.13
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.14
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.2
253 0.22
254 0.18
255 0.15
256 0.17
257 0.23
258 0.25
259 0.25
260 0.24
261 0.26
262 0.29
263 0.27
264 0.28
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.19
269 0.19
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.14
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.13
282 0.21
283 0.27
284 0.28
285 0.28
286 0.3
287 0.36
288 0.37
289 0.34
290 0.36
291 0.33
292 0.39
293 0.43
294 0.42
295 0.39