Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXC9

Protein Details
Accession C4QXC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-75VPIISKRKSDSKGSKKKEAEFSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-68RKSDSKGSKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0073  -  
Amino Acid Sequences MSPPHIEGFYFDEHRKKYFKITKNTDGISDITPYSISSIRKNERLKRTLEIEVPIISKRKSDSKGSKKKEAEFSLATSFFCSKISQLSPWMNTSFSALYSKSCNTRTSFDNELGLQQVINLFGKHCYEFAGNNRIIGILPIPGNSKILVNIAPGRWGSLQFGSKPLPSYADYLLSQTVSTKLLWYRAFDLNIVFKLEIGNATKVVIIAEGKKVLESIEVHRDDKVTCDFDGSLAIGNGRTVRIQTLSPADALSNENPFSRIKTSSDVMALEMAVIGTSRLLIVGLRDGHIQFWVFKSGSWLSAGKTFFGSTVTQIASFTHTEKHGKDVYVLVSGLQGRLRLFKTCHTKKGTIHLKKVVEYLNYNNDFTLGDCFHLAPCSNLQYGFFAISDPIEECIKIYRFLDSLPIVTQQSSPHYLKIPFGSSSINDFSWISLREACSFSDNGLILNRTSTSNKISPCTINCDDFSLLESRRLLSEQEPKGYSFCGEPFVERFALFVNGSGDHLPYRVSVWF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.45
3 0.43
4 0.48
5 0.53
6 0.59
7 0.62
8 0.69
9 0.73
10 0.76
11 0.75
12 0.66
13 0.59
14 0.52
15 0.42
16 0.36
17 0.26
18 0.19
19 0.17
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.19
24 0.23
25 0.32
26 0.39
27 0.47
28 0.56
29 0.63
30 0.69
31 0.73
32 0.7
33 0.67
34 0.66
35 0.63
36 0.58
37 0.51
38 0.43
39 0.4
40 0.37
41 0.34
42 0.33
43 0.27
44 0.25
45 0.26
46 0.33
47 0.35
48 0.44
49 0.51
50 0.58
51 0.69
52 0.74
53 0.81
54 0.79
55 0.82
56 0.81
57 0.75
58 0.71
59 0.62
60 0.58
61 0.54
62 0.48
63 0.4
64 0.33
65 0.29
66 0.22
67 0.21
68 0.18
69 0.12
70 0.18
71 0.21
72 0.2
73 0.26
74 0.31
75 0.33
76 0.35
77 0.36
78 0.3
79 0.27
80 0.28
81 0.22
82 0.17
83 0.18
84 0.15
85 0.15
86 0.19
87 0.22
88 0.24
89 0.26
90 0.29
91 0.29
92 0.33
93 0.35
94 0.37
95 0.38
96 0.34
97 0.34
98 0.3
99 0.28
100 0.26
101 0.23
102 0.16
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.22
117 0.29
118 0.27
119 0.26
120 0.26
121 0.24
122 0.22
123 0.19
124 0.14
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.1
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.19
147 0.17
148 0.21
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.2
153 0.19
154 0.18
155 0.2
156 0.18
157 0.19
158 0.18
159 0.17
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.22
173 0.24
174 0.24
175 0.22
176 0.23
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.19
205 0.21
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.21
210 0.22
211 0.22
212 0.15
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.15
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.02
263 0.02
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.03
269 0.03
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.18
290 0.18
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.14
308 0.17
309 0.17
310 0.22
311 0.22
312 0.22
313 0.22
314 0.22
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.14
326 0.15
327 0.17
328 0.18
329 0.24
330 0.35
331 0.39
332 0.47
333 0.49
334 0.53
335 0.52
336 0.61
337 0.65
338 0.62
339 0.63
340 0.63
341 0.59
342 0.55
343 0.56
344 0.49
345 0.41
346 0.35
347 0.33
348 0.35
349 0.34
350 0.33
351 0.29
352 0.26
353 0.24
354 0.21
355 0.21
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.13
362 0.13
363 0.1
364 0.12
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.17
388 0.17
389 0.22
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.19
394 0.17
395 0.18
396 0.19
397 0.16
398 0.19
399 0.24
400 0.24
401 0.24
402 0.28
403 0.28
404 0.3
405 0.32
406 0.3
407 0.25
408 0.25
409 0.25
410 0.22
411 0.25
412 0.25
413 0.22
414 0.2
415 0.19
416 0.18
417 0.2
418 0.21
419 0.18
420 0.18
421 0.2
422 0.22
423 0.23
424 0.23
425 0.22
426 0.21
427 0.19
428 0.21
429 0.19
430 0.17
431 0.18
432 0.19
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.16
437 0.18
438 0.2
439 0.24
440 0.28
441 0.3
442 0.32
443 0.35
444 0.38
445 0.38
446 0.44
447 0.41
448 0.4
449 0.38
450 0.39
451 0.36
452 0.3
453 0.3
454 0.26
455 0.23
456 0.24
457 0.24
458 0.21
459 0.22
460 0.23
461 0.23
462 0.24
463 0.33
464 0.34
465 0.4
466 0.41
467 0.4
468 0.4
469 0.39
470 0.33
471 0.27
472 0.23
473 0.21
474 0.2
475 0.22
476 0.23
477 0.26
478 0.26
479 0.23
480 0.22
481 0.19
482 0.21
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.15
487 0.17
488 0.18
489 0.17
490 0.14
491 0.14
492 0.13
493 0.12