Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KTI1

Protein Details
Accession E3KTI1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48QIRQAREKVKRLEEERKEKERIBasic
51-71EKERLAKKKLEDEKREKQLIEBasic
427-448EERLRQHELEKKKRLLQRRLSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-67AREKVKRLEEERKEKERIRLEKERLAKKKLEDEKREK
140-149REEKQAKARA
437-448KKKRLLQRRLSK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG pgr:PGTG_13977  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSTFEALMDLASKQTKESQIAFAKENQIRQAREKVKRLEEERKEKERIRLEKERLAKKKLEDEKREKQLIEERQRRQADRLSTAEQTRKQQDSDSTNRASSSRMNNGPSPSSRHRATTRPSSSTPTNFDVDPEEKRRLEREEKQAKARAKLFGESVAAHKKPTPSRSSANTSQRTNPSSKGKAPMRGTASGNNSKIALGTPATITARQRIEQTFSASERKPLSQTKRDRRTIEEIEQDMKRKKVEVGTQAIRPSKETSFSSSFTEKRILIPLKPVASSSTLREANKNPRPRSETVSAVKRKAINGLPTPSSKRPQLPTSLPKDSKPNGSRPLPQSRSGSHSGRRQDATVSDEDDDSSNSEEMSEHGEDVAPSVRDEIWKIMGKDRRQYTAKPIFSDEEDDMEADADDVLEEEGRAARLARLEDQREEERLRQHELEKKKRLLQRRLSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.29
4 0.32
5 0.37
6 0.42
7 0.45
8 0.47
9 0.45
10 0.5
11 0.49
12 0.5
13 0.49
14 0.49
15 0.49
16 0.52
17 0.58
18 0.58
19 0.64
20 0.69
21 0.7
22 0.72
23 0.77
24 0.79
25 0.79
26 0.8
27 0.81
28 0.82
29 0.81
30 0.8
31 0.76
32 0.77
33 0.76
34 0.75
35 0.73
36 0.74
37 0.73
38 0.73
39 0.77
40 0.79
41 0.77
42 0.74
43 0.7
44 0.65
45 0.69
46 0.71
47 0.72
48 0.72
49 0.74
50 0.78
51 0.81
52 0.81
53 0.71
54 0.66
55 0.64
56 0.64
57 0.66
58 0.65
59 0.61
60 0.66
61 0.72
62 0.69
63 0.65
64 0.62
65 0.57
66 0.54
67 0.54
68 0.48
69 0.47
70 0.5
71 0.52
72 0.5
73 0.5
74 0.51
75 0.49
76 0.45
77 0.45
78 0.47
79 0.47
80 0.51
81 0.5
82 0.46
83 0.44
84 0.44
85 0.4
86 0.35
87 0.33
88 0.32
89 0.34
90 0.35
91 0.38
92 0.41
93 0.43
94 0.46
95 0.42
96 0.43
97 0.41
98 0.42
99 0.4
100 0.43
101 0.44
102 0.47
103 0.51
104 0.54
105 0.54
106 0.53
107 0.54
108 0.54
109 0.55
110 0.52
111 0.51
112 0.43
113 0.39
114 0.33
115 0.31
116 0.3
117 0.28
118 0.29
119 0.29
120 0.31
121 0.3
122 0.32
123 0.35
124 0.37
125 0.43
126 0.45
127 0.52
128 0.56
129 0.59
130 0.65
131 0.68
132 0.65
133 0.63
134 0.59
135 0.53
136 0.45
137 0.43
138 0.36
139 0.31
140 0.28
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.22
145 0.21
146 0.23
147 0.27
148 0.31
149 0.36
150 0.37
151 0.35
152 0.4
153 0.45
154 0.5
155 0.53
156 0.57
157 0.57
158 0.55
159 0.56
160 0.56
161 0.54
162 0.48
163 0.45
164 0.43
165 0.42
166 0.43
167 0.46
168 0.45
169 0.49
170 0.49
171 0.5
172 0.46
173 0.45
174 0.43
175 0.4
176 0.42
177 0.4
178 0.38
179 0.32
180 0.28
181 0.24
182 0.23
183 0.18
184 0.13
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.18
196 0.17
197 0.21
198 0.21
199 0.24
200 0.21
201 0.22
202 0.26
203 0.23
204 0.26
205 0.24
206 0.23
207 0.24
208 0.29
209 0.34
210 0.38
211 0.48
212 0.55
213 0.63
214 0.68
215 0.67
216 0.65
217 0.66
218 0.62
219 0.57
220 0.51
221 0.43
222 0.41
223 0.4
224 0.39
225 0.34
226 0.3
227 0.25
228 0.21
229 0.22
230 0.23
231 0.27
232 0.29
233 0.34
234 0.35
235 0.37
236 0.4
237 0.41
238 0.36
239 0.32
240 0.29
241 0.22
242 0.23
243 0.21
244 0.24
245 0.25
246 0.26
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.27
251 0.29
252 0.23
253 0.21
254 0.27
255 0.25
256 0.22
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.27
261 0.26
262 0.2
263 0.22
264 0.22
265 0.19
266 0.22
267 0.25
268 0.25
269 0.29
270 0.33
271 0.4
272 0.47
273 0.54
274 0.5
275 0.53
276 0.59
277 0.58
278 0.59
279 0.53
280 0.52
281 0.49
282 0.56
283 0.54
284 0.49
285 0.5
286 0.45
287 0.42
288 0.4
289 0.37
290 0.34
291 0.35
292 0.37
293 0.36
294 0.38
295 0.43
296 0.42
297 0.42
298 0.4
299 0.4
300 0.41
301 0.42
302 0.46
303 0.48
304 0.52
305 0.56
306 0.62
307 0.58
308 0.55
309 0.59
310 0.55
311 0.57
312 0.53
313 0.53
314 0.51
315 0.54
316 0.59
317 0.58
318 0.66
319 0.6
320 0.6
321 0.56
322 0.51
323 0.53
324 0.51
325 0.49
326 0.45
327 0.48
328 0.49
329 0.51
330 0.5
331 0.44
332 0.41
333 0.38
334 0.36
335 0.31
336 0.27
337 0.22
338 0.21
339 0.21
340 0.19
341 0.17
342 0.13
343 0.13
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.13
356 0.16
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.24
366 0.26
367 0.32
368 0.39
369 0.43
370 0.5
371 0.52
372 0.54
373 0.53
374 0.54
375 0.57
376 0.6
377 0.59
378 0.53
379 0.53
380 0.48
381 0.46
382 0.47
383 0.37
384 0.3
385 0.26
386 0.23
387 0.19
388 0.17
389 0.15
390 0.1
391 0.09
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.14
405 0.17
406 0.23
407 0.3
408 0.34
409 0.38
410 0.43
411 0.45
412 0.47
413 0.49
414 0.47
415 0.47
416 0.46
417 0.49
418 0.47
419 0.5
420 0.53
421 0.6
422 0.66
423 0.67
424 0.71
425 0.73
426 0.77
427 0.81
428 0.83