Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H6QUC8

Protein Details
Accession H6QUC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
534-562TEQMRRKHKDAIKRDRKWGNKQAAKPSTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-136AAQKLERKLAKLRARKR
538-557RRKHKDAIKRDRKWGNKQAA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pgr:PGTG_22380  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MTDQQNFRLHIGGLGPSVTSSDLEKRFAAFGTVVKVDGVGKLDANGSPLKYAFVDILSTDPQIKRCMNLLSGTTYKGGTLRIAPARPDYVARVEREKANLPINTFVDPDEEAIRVREEKAAQKLERKLAKLRARKRGIEGYESSNMELMTVKKFKSRQGVNGWKKDPETSLPIFPILTRPLRPLPPLETAQSQTANLKEDASDCVRVPTRARRIRIDPTIYRAAIKNRKTHLLGPRAISIEQYKLGFSGGAKDVKKSQANRLLWECQLGEDGHAVWRLTNCGDVIQEERVALSSSTLQKLRDADEHPSSEPLPEQFTEHPLSSSTPALRLRGGASSKRPRRSQGQPESDIVAMNNEKITDHTEPDNVSPVRLSILTDMFKAKEAETTGFRLTDDLGGMELDDDVLGPSDETEMDGSPSAQDFQSEQLVDGQPLKSNTFIHPSRLKGSGFVKTQTAIHVKQGQRNGPFFFYPTDEDPDSKVINSLLSTEHREAARRHWLSGSIPSSSSDSWRTFVRTESVSEIETAHDKKKSTLTEQMRRKHKDAIKRDRKWGNKQAAKPSTLKGLESENDSSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.12
4 0.13
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.19
9 0.21
10 0.24
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.18
17 0.18
18 0.2
19 0.2
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.16
36 0.17
37 0.15
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.19
47 0.2
48 0.22
49 0.27
50 0.27
51 0.26
52 0.29
53 0.31
54 0.28
55 0.29
56 0.29
57 0.29
58 0.3
59 0.3
60 0.27
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.18
65 0.14
66 0.15
67 0.21
68 0.26
69 0.28
70 0.29
71 0.31
72 0.32
73 0.31
74 0.31
75 0.27
76 0.29
77 0.32
78 0.33
79 0.35
80 0.36
81 0.38
82 0.41
83 0.41
84 0.38
85 0.4
86 0.39
87 0.36
88 0.38
89 0.36
90 0.33
91 0.3
92 0.25
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.17
104 0.19
105 0.25
106 0.32
107 0.39
108 0.4
109 0.47
110 0.52
111 0.56
112 0.58
113 0.55
114 0.55
115 0.57
116 0.63
117 0.65
118 0.69
119 0.71
120 0.72
121 0.72
122 0.72
123 0.71
124 0.65
125 0.61
126 0.55
127 0.5
128 0.48
129 0.45
130 0.38
131 0.3
132 0.27
133 0.2
134 0.19
135 0.15
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.23
140 0.26
141 0.31
142 0.38
143 0.42
144 0.43
145 0.51
146 0.62
147 0.66
148 0.73
149 0.7
150 0.63
151 0.6
152 0.54
153 0.45
154 0.38
155 0.35
156 0.29
157 0.29
158 0.26
159 0.25
160 0.24
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.21
167 0.25
168 0.28
169 0.29
170 0.29
171 0.29
172 0.31
173 0.32
174 0.3
175 0.28
176 0.28
177 0.29
178 0.26
179 0.23
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.14
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.28
196 0.36
197 0.41
198 0.45
199 0.46
200 0.51
201 0.57
202 0.6
203 0.58
204 0.49
205 0.48
206 0.5
207 0.44
208 0.4
209 0.35
210 0.37
211 0.39
212 0.41
213 0.42
214 0.4
215 0.45
216 0.46
217 0.5
218 0.49
219 0.49
220 0.48
221 0.42
222 0.43
223 0.39
224 0.37
225 0.31
226 0.24
227 0.18
228 0.16
229 0.15
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.1
236 0.12
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.21
241 0.26
242 0.31
243 0.29
244 0.34
245 0.38
246 0.39
247 0.42
248 0.43
249 0.41
250 0.36
251 0.35
252 0.27
253 0.18
254 0.18
255 0.15
256 0.11
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.08
281 0.1
282 0.12
283 0.14
284 0.14
285 0.15
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.21
291 0.23
292 0.25
293 0.23
294 0.24
295 0.22
296 0.18
297 0.17
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.12
302 0.11
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.15
311 0.12
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.17
319 0.2
320 0.19
321 0.27
322 0.36
323 0.43
324 0.49
325 0.51
326 0.51
327 0.56
328 0.62
329 0.64
330 0.64
331 0.65
332 0.61
333 0.6
334 0.58
335 0.51
336 0.41
337 0.3
338 0.22
339 0.14
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.13
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.24
353 0.2
354 0.18
355 0.16
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.08
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.15
365 0.14
366 0.16
367 0.16
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.18
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.11
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.16
414 0.17
415 0.17
416 0.19
417 0.18
418 0.17
419 0.18
420 0.19
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.25
425 0.25
426 0.29
427 0.33
428 0.35
429 0.37
430 0.39
431 0.37
432 0.34
433 0.36
434 0.37
435 0.34
436 0.33
437 0.31
438 0.28
439 0.29
440 0.29
441 0.31
442 0.25
443 0.28
444 0.35
445 0.37
446 0.42
447 0.48
448 0.49
449 0.49
450 0.52
451 0.49
452 0.44
453 0.41
454 0.36
455 0.32
456 0.28
457 0.27
458 0.26
459 0.29
460 0.27
461 0.27
462 0.28
463 0.29
464 0.27
465 0.23
466 0.21
467 0.16
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.21
474 0.22
475 0.25
476 0.25
477 0.3
478 0.3
479 0.34
480 0.42
481 0.37
482 0.38
483 0.35
484 0.37
485 0.35
486 0.42
487 0.38
488 0.29
489 0.28
490 0.28
491 0.29
492 0.27
493 0.28
494 0.25
495 0.24
496 0.24
497 0.26
498 0.29
499 0.27
500 0.29
501 0.3
502 0.26
503 0.27
504 0.3
505 0.29
506 0.26
507 0.25
508 0.23
509 0.2
510 0.24
511 0.25
512 0.25
513 0.27
514 0.27
515 0.3
516 0.37
517 0.4
518 0.41
519 0.48
520 0.53
521 0.6
522 0.68
523 0.73
524 0.77
525 0.78
526 0.76
527 0.76
528 0.72
529 0.73
530 0.75
531 0.77
532 0.78
533 0.79
534 0.85
535 0.85
536 0.88
537 0.88
538 0.87
539 0.86
540 0.84
541 0.84
542 0.86
543 0.83
544 0.78
545 0.71
546 0.64
547 0.63
548 0.55
549 0.48
550 0.39
551 0.38
552 0.36
553 0.37