Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KN40

Protein Details
Accession E3KN40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-78RECFNKLPHRPKRLDHKLIKPDQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-175RG
178-178K
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 12, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR012678  Ribosomal_L23/L15e_core_dom_sf  
IPR013025  Ribosomal_L25/23  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG pgr:PGTG_11005  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00276  Ribosomal_L23  
Amino Acid Sequences MRPAIHSNLRTIKSICHQRASIPSLRTLATTVSIDPLDRIEGEEPKPKPNQDIRECFNKLPHRPKRLDHKLIKPDQSSSDDILIRSLDKGRSPIGSSYAKAQSPVYFPNISIRLVRPSSTDRGDPFTAIFRCDLQLTKPDIFNYLRQIYGLGITSIRTAIYRGRYERQIKSKVRGGVKIAKDKNRTFKKVWVGLDKPFFYPPQPNQRFLNENYNYQDFLNAYNRSRLSQIKHAKLDRNQVMPSGVHDRKGERVNVLRQILDSKKSIQAELNEHVKQSLIDSTTAPSTPTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.5
4 0.49
5 0.5
6 0.57
7 0.58
8 0.55
9 0.47
10 0.45
11 0.41
12 0.4
13 0.36
14 0.29
15 0.24
16 0.19
17 0.18
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.13
28 0.18
29 0.21
30 0.29
31 0.29
32 0.34
33 0.39
34 0.38
35 0.44
36 0.47
37 0.54
38 0.56
39 0.62
40 0.61
41 0.65
42 0.68
43 0.61
44 0.61
45 0.59
46 0.59
47 0.62
48 0.67
49 0.67
50 0.68
51 0.74
52 0.77
53 0.79
54 0.8
55 0.78
56 0.78
57 0.79
58 0.82
59 0.81
60 0.72
61 0.64
62 0.57
63 0.53
64 0.46
65 0.37
66 0.34
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.19
80 0.19
81 0.21
82 0.22
83 0.21
84 0.24
85 0.27
86 0.25
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.23
92 0.21
93 0.18
94 0.18
95 0.23
96 0.23
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.19
104 0.22
105 0.25
106 0.25
107 0.26
108 0.22
109 0.26
110 0.26
111 0.24
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.18
116 0.18
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.1
122 0.15
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.22
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.07
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.08
147 0.13
148 0.16
149 0.19
150 0.23
151 0.3
152 0.36
153 0.42
154 0.47
155 0.52
156 0.52
157 0.54
158 0.57
159 0.56
160 0.53
161 0.5
162 0.47
163 0.45
164 0.47
165 0.52
166 0.51
167 0.53
168 0.56
169 0.58
170 0.63
171 0.64
172 0.64
173 0.58
174 0.59
175 0.6
176 0.6
177 0.6
178 0.58
179 0.52
180 0.51
181 0.54
182 0.48
183 0.41
184 0.36
185 0.32
186 0.26
187 0.31
188 0.32
189 0.38
190 0.41
191 0.43
192 0.44
193 0.48
194 0.51
195 0.47
196 0.5
197 0.41
198 0.41
199 0.42
200 0.41
201 0.37
202 0.32
203 0.3
204 0.2
205 0.21
206 0.24
207 0.23
208 0.22
209 0.27
210 0.28
211 0.28
212 0.31
213 0.32
214 0.31
215 0.38
216 0.46
217 0.49
218 0.56
219 0.61
220 0.65
221 0.66
222 0.71
223 0.67
224 0.62
225 0.54
226 0.48
227 0.45
228 0.37
229 0.35
230 0.34
231 0.29
232 0.28
233 0.3
234 0.3
235 0.35
236 0.4
237 0.38
238 0.35
239 0.42
240 0.45
241 0.5
242 0.5
243 0.44
244 0.4
245 0.44
246 0.42
247 0.38
248 0.34
249 0.3
250 0.34
251 0.35
252 0.36
253 0.33
254 0.35
255 0.37
256 0.41
257 0.45
258 0.4
259 0.39
260 0.37
261 0.33
262 0.27
263 0.23
264 0.22
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.19
269 0.22
270 0.22
271 0.21