Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3L5T6

Protein Details
Accession E3L5T6    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-46KSLYQAPKSKKSNEQNQQHSKAPHydrophilic
80-108EQTAPKESKEKRSKKDKKRKLQAVEQQATHydrophilic
150-178ESTDGLTKKEKRKKQKKAKKEQLDPSQSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-99KESKEKRSKKDKKRK
156-169TKKEKRKKQKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pgr:PGTG_17938  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
Amino Acid Sequences MPSFNCDGWKSHTTCISEAQKYQKSLYQAPKSKKSNEQNQQHSKAPSLPIAPVNSISAKHSSIAAEPALIAAEKPATVVEQTAPKESKEKRSKKDKKRKLQAVEQQATPDTPNTTQNIETIIPTQENKKQKLEENGQGKEETSSKKNKEESTDGLTKKEKRKKQKKAKKEQLDPSQSIDGTQAVDAPIRVHQRLPESLTHPEIIKAIQGLSRSSNQGKSMTLNELIDGVLKTTVSTHHPQNEDASAQTDQENTWRSALLELFGSHLQFVRPTTDQSSAVGLAWNGSPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.48
4 0.45
5 0.47
6 0.52
7 0.52
8 0.51
9 0.52
10 0.47
11 0.45
12 0.5
13 0.55
14 0.56
15 0.58
16 0.64
17 0.72
18 0.74
19 0.75
20 0.77
21 0.77
22 0.77
23 0.78
24 0.8
25 0.81
26 0.85
27 0.83
28 0.79
29 0.71
30 0.63
31 0.57
32 0.5
33 0.43
34 0.34
35 0.32
36 0.3
37 0.3
38 0.28
39 0.25
40 0.24
41 0.21
42 0.2
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.13
68 0.15
69 0.2
70 0.21
71 0.21
72 0.29
73 0.32
74 0.41
75 0.46
76 0.54
77 0.58
78 0.69
79 0.79
80 0.83
81 0.9
82 0.9
83 0.9
84 0.92
85 0.93
86 0.89
87 0.88
88 0.85
89 0.85
90 0.78
91 0.67
92 0.57
93 0.48
94 0.4
95 0.31
96 0.23
97 0.14
98 0.12
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.15
112 0.19
113 0.25
114 0.27
115 0.3
116 0.32
117 0.35
118 0.43
119 0.45
120 0.46
121 0.47
122 0.45
123 0.43
124 0.4
125 0.36
126 0.29
127 0.26
128 0.21
129 0.18
130 0.24
131 0.25
132 0.3
133 0.34
134 0.35
135 0.37
136 0.38
137 0.37
138 0.36
139 0.41
140 0.37
141 0.36
142 0.38
143 0.4
144 0.46
145 0.51
146 0.52
147 0.57
148 0.67
149 0.75
150 0.82
151 0.86
152 0.88
153 0.91
154 0.94
155 0.93
156 0.92
157 0.9
158 0.89
159 0.85
160 0.75
161 0.67
162 0.58
163 0.48
164 0.38
165 0.29
166 0.2
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.11
175 0.14
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.21
180 0.23
181 0.26
182 0.25
183 0.26
184 0.28
185 0.29
186 0.28
187 0.24
188 0.22
189 0.2
190 0.16
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.16
199 0.19
200 0.22
201 0.24
202 0.24
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.21
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.1
221 0.13
222 0.18
223 0.23
224 0.29
225 0.32
226 0.33
227 0.35
228 0.36
229 0.32
230 0.29
231 0.26
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.16
236 0.14
237 0.18
238 0.21
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.2
244 0.2
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.15
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.22
259 0.25
260 0.28
261 0.28
262 0.28
263 0.3
264 0.25
265 0.23
266 0.21
267 0.17
268 0.14