Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3JR86

Protein Details
Accession E3JR86    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
633-661KAAWSKKINAKISKEQKRLKRLREQEAGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-655KKLPEKAAWSKKINAKISKEQKRLKRLR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG pgr:PGTG_00154  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17960  DEADc_DDX55  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAIESSQTNRFDELNPPLTSWVSDTIKSFGFQQMTPVQAHTIPLFLQNKDVVVQAVTGSGKTLAFVIPIIERLIQLEPRPHSHVAAIIISPTRELATQTFQVLNQFLENRPSPSDQASCSSDPVTPFLKAMLLIGGTGARSIKQDLSEFQEYGANILVATPGRLEEFLFGYSSLNKRKTNDLSEFKQRSQFKTLANLKSLEVLVLDEADRLLDLGFAPVLSNILGKLPKQRRTGLFSATLLNDGLTELIRAGLRNPVKVLVKVQTAHQNLRENEAGPTALTNQYIAVPKVAWKMPQLVRLLNHLAFPDPEENTPGARKLIIYFATCACVEYFYKILSVLDELKSFSVHSLHGQQSPTRRSMTFTAFKNSNPLSPAVLLCTDLVARGLDLPDVDVVIQFDPPKDVRNFFHRIGRTARAGKSGRAIVLLQSNRELDYVDYLKLKNLHLKPLPYIRSCSRSNGAQGSEIATDSAAEEFIRKVKNIVKTDRALHDRGVKAFVSYVQFYSKHEASYIFKLDQIDLLSLAFHGFGLIKLPKMPELKKFRTQIDLVTPDGFEVGQEEFDWPKYSYLDPLKETQRQEKYKQTTEAQRMIKESNEANNKSSGLTKPSRKSGQTSTPIDKKIQALEQKKLPEKAAWSKKINAKISKEQKRLKRLREQEAGGPGDNNQDNQENNKNNEDNDDDEDDGETDWKELVMEKKTLKKLKLDLDHQKSIDRLPITEHPNPAQSSSGFDKNLGEFFLGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.35
4 0.35
5 0.34
6 0.33
7 0.28
8 0.28
9 0.24
10 0.25
11 0.26
12 0.27
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.25
17 0.25
18 0.23
19 0.27
20 0.29
21 0.31
22 0.31
23 0.3
24 0.26
25 0.24
26 0.26
27 0.2
28 0.17
29 0.15
30 0.22
31 0.25
32 0.23
33 0.26
34 0.24
35 0.25
36 0.24
37 0.25
38 0.17
39 0.14
40 0.14
41 0.1
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.13
60 0.16
61 0.17
62 0.19
63 0.25
64 0.28
65 0.32
66 0.38
67 0.37
68 0.35
69 0.33
70 0.33
71 0.28
72 0.27
73 0.22
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.12
82 0.13
83 0.17
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.24
89 0.23
90 0.21
91 0.19
92 0.2
93 0.18
94 0.23
95 0.25
96 0.24
97 0.27
98 0.29
99 0.28
100 0.3
101 0.32
102 0.28
103 0.31
104 0.33
105 0.31
106 0.3
107 0.29
108 0.27
109 0.25
110 0.26
111 0.24
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.1
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.25
134 0.28
135 0.27
136 0.25
137 0.26
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.13
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.14
159 0.19
160 0.25
161 0.29
162 0.32
163 0.34
164 0.42
165 0.47
166 0.51
167 0.55
168 0.55
169 0.55
170 0.62
171 0.65
172 0.59
173 0.61
174 0.57
175 0.53
176 0.51
177 0.5
178 0.42
179 0.47
180 0.54
181 0.5
182 0.49
183 0.45
184 0.39
185 0.37
186 0.35
187 0.24
188 0.16
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.19
214 0.27
215 0.35
216 0.39
217 0.46
218 0.47
219 0.54
220 0.56
221 0.5
222 0.46
223 0.39
224 0.37
225 0.31
226 0.27
227 0.2
228 0.16
229 0.12
230 0.09
231 0.08
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.19
244 0.21
245 0.22
246 0.24
247 0.2
248 0.23
249 0.22
250 0.24
251 0.29
252 0.31
253 0.32
254 0.35
255 0.38
256 0.35
257 0.39
258 0.37
259 0.29
260 0.27
261 0.25
262 0.2
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.12
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.22
281 0.24
282 0.3
283 0.3
284 0.28
285 0.28
286 0.3
287 0.32
288 0.25
289 0.23
290 0.18
291 0.17
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.13
337 0.15
338 0.18
339 0.19
340 0.2
341 0.26
342 0.28
343 0.29
344 0.25
345 0.24
346 0.23
347 0.26
348 0.3
349 0.29
350 0.28
351 0.31
352 0.3
353 0.3
354 0.32
355 0.29
356 0.25
357 0.2
358 0.19
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.12
389 0.13
390 0.16
391 0.17
392 0.23
393 0.28
394 0.28
395 0.35
396 0.32
397 0.33
398 0.35
399 0.36
400 0.35
401 0.34
402 0.34
403 0.35
404 0.34
405 0.32
406 0.32
407 0.3
408 0.25
409 0.21
410 0.2
411 0.14
412 0.2
413 0.19
414 0.16
415 0.16
416 0.17
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.08
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.17
428 0.18
429 0.23
430 0.23
431 0.29
432 0.3
433 0.32
434 0.34
435 0.39
436 0.43
437 0.36
438 0.39
439 0.35
440 0.37
441 0.37
442 0.38
443 0.33
444 0.3
445 0.32
446 0.31
447 0.29
448 0.24
449 0.23
450 0.21
451 0.18
452 0.16
453 0.13
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.09
463 0.11
464 0.1
465 0.13
466 0.18
467 0.27
468 0.33
469 0.38
470 0.4
471 0.42
472 0.47
473 0.5
474 0.49
475 0.42
476 0.39
477 0.41
478 0.38
479 0.35
480 0.34
481 0.27
482 0.23
483 0.22
484 0.22
485 0.17
486 0.16
487 0.16
488 0.16
489 0.17
490 0.18
491 0.24
492 0.22
493 0.19
494 0.19
495 0.21
496 0.21
497 0.25
498 0.27
499 0.21
500 0.22
501 0.23
502 0.22
503 0.21
504 0.19
505 0.14
506 0.11
507 0.1
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.05
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.13
521 0.17
522 0.23
523 0.26
524 0.31
525 0.4
526 0.46
527 0.53
528 0.57
529 0.54
530 0.54
531 0.52
532 0.47
533 0.46
534 0.42
535 0.36
536 0.32
537 0.29
538 0.23
539 0.22
540 0.18
541 0.09
542 0.08
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.08
547 0.09
548 0.1
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.15
553 0.15
554 0.21
555 0.27
556 0.3
557 0.3
558 0.35
559 0.4
560 0.45
561 0.48
562 0.5
563 0.53
564 0.56
565 0.59
566 0.63
567 0.64
568 0.65
569 0.67
570 0.64
571 0.64
572 0.65
573 0.68
574 0.63
575 0.57
576 0.53
577 0.49
578 0.44
579 0.38
580 0.33
581 0.33
582 0.37
583 0.37
584 0.36
585 0.36
586 0.35
587 0.33
588 0.34
589 0.28
590 0.26
591 0.32
592 0.39
593 0.43
594 0.51
595 0.57
596 0.56
597 0.59
598 0.59
599 0.62
600 0.62
601 0.63
602 0.63
603 0.63
604 0.63
605 0.6
606 0.55
607 0.48
608 0.43
609 0.44
610 0.44
611 0.43
612 0.47
613 0.5
614 0.55
615 0.59
616 0.58
617 0.53
618 0.47
619 0.49
620 0.53
621 0.58
622 0.58
623 0.56
624 0.61
625 0.65
626 0.71
627 0.72
628 0.69
629 0.67
630 0.69
631 0.75
632 0.78
633 0.81
634 0.81
635 0.81
636 0.84
637 0.86
638 0.85
639 0.85
640 0.84
641 0.84
642 0.83
643 0.77
644 0.73
645 0.71
646 0.65
647 0.54
648 0.46
649 0.36
650 0.35
651 0.33
652 0.27
653 0.22
654 0.23
655 0.23
656 0.29
657 0.38
658 0.37
659 0.4
660 0.47
661 0.46
662 0.43
663 0.47
664 0.44
665 0.38
666 0.36
667 0.36
668 0.28
669 0.27
670 0.27
671 0.22
672 0.2
673 0.17
674 0.12
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.08
679 0.12
680 0.17
681 0.2
682 0.26
683 0.31
684 0.4
685 0.5
686 0.57
687 0.57
688 0.59
689 0.62
690 0.67
691 0.7
692 0.71
693 0.73
694 0.73
695 0.77
696 0.7
697 0.66
698 0.57
699 0.5
700 0.48
701 0.38
702 0.3
703 0.29
704 0.36
705 0.4
706 0.44
707 0.46
708 0.43
709 0.47
710 0.48
711 0.43
712 0.39
713 0.32
714 0.32
715 0.33
716 0.37
717 0.31
718 0.31
719 0.33
720 0.31
721 0.32
722 0.27
723 0.22