Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3KIE8

Protein Details
Accession E3KIE8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-236QLYPKRRLRARSPTPPRHRENBasic
429-463DARIPARGHSPRRARSPRRSPSPSRRPLDHRRLAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-224R
431-463RIPARGHSPRRARSPRRSPSPSRRPLDHRRLAG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pgr:PGTG_10451  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MLAQKDMTRPQIDQHHQREDYRATRSRVEGDVRDSDRRGFHQSSLPRERHTESRPLPRDSPPRPPPPHDRNAERIYRDPPGPETVPHGASLPVDAHGPVDSIQNAPVPNPSKIYIGGLPELTRPEDLQDCFSQLGRIKNIELKSGYGFVEYDSPQAACDAVSKYHEGTFLGSQIKVELSHGGSRPRHVAVSNNPEACYTCGIIGHWARDCPDADSQLYPKRRLRARSPTPPRHRENAYMNRDSRPEELSSHEYRPHRRRSPLGEIDYSRTERERLPPSSRESYFQPAYLEDKRYRPEHSLRDRERDEPRALDLKILPRNDDHRAPYLITPSRSRSPPPGSRDYYTAERTRPAAPYPIRSLPRDDYQSRVHVIKPYAPEPTYYRDHVVRAPETTRVSRYEDRSPGRPHWAHPAERVVEPTRIDRRYEAADARIPARGHSPRRARSPRRSPSPSRRPLDHRRLAGRIHSPPPYEQTGYARPAYPIRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.65
4 0.66
5 0.66
6 0.64
7 0.61
8 0.6
9 0.6
10 0.54
11 0.56
12 0.57
13 0.54
14 0.52
15 0.52
16 0.47
17 0.45
18 0.5
19 0.49
20 0.51
21 0.48
22 0.46
23 0.44
24 0.43
25 0.45
26 0.39
27 0.38
28 0.42
29 0.47
30 0.53
31 0.58
32 0.58
33 0.53
34 0.55
35 0.56
36 0.56
37 0.55
38 0.55
39 0.53
40 0.61
41 0.65
42 0.66
43 0.66
44 0.66
45 0.71
46 0.66
47 0.7
48 0.68
49 0.72
50 0.72
51 0.75
52 0.76
53 0.75
54 0.79
55 0.77
56 0.74
57 0.72
58 0.73
59 0.73
60 0.67
61 0.62
62 0.57
63 0.53
64 0.49
65 0.43
66 0.38
67 0.37
68 0.34
69 0.31
70 0.33
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.26
75 0.2
76 0.19
77 0.19
78 0.14
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.19
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.26
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.17
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.18
113 0.18
114 0.2
115 0.19
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.21
120 0.2
121 0.24
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.29
126 0.29
127 0.3
128 0.27
129 0.24
130 0.22
131 0.23
132 0.21
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.06
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.16
168 0.22
169 0.22
170 0.24
171 0.26
172 0.25
173 0.24
174 0.21
175 0.24
176 0.25
177 0.33
178 0.37
179 0.35
180 0.34
181 0.33
182 0.34
183 0.29
184 0.23
185 0.15
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.17
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.23
204 0.26
205 0.29
206 0.3
207 0.36
208 0.4
209 0.44
210 0.5
211 0.54
212 0.59
213 0.65
214 0.72
215 0.76
216 0.81
217 0.83
218 0.79
219 0.73
220 0.68
221 0.62
222 0.61
223 0.61
224 0.58
225 0.56
226 0.53
227 0.49
228 0.47
229 0.43
230 0.35
231 0.27
232 0.21
233 0.17
234 0.19
235 0.23
236 0.25
237 0.25
238 0.29
239 0.3
240 0.38
241 0.44
242 0.5
243 0.51
244 0.52
245 0.56
246 0.58
247 0.65
248 0.64
249 0.6
250 0.54
251 0.49
252 0.48
253 0.45
254 0.39
255 0.3
256 0.23
257 0.2
258 0.18
259 0.24
260 0.27
261 0.29
262 0.33
263 0.36
264 0.42
265 0.47
266 0.46
267 0.41
268 0.38
269 0.4
270 0.35
271 0.32
272 0.27
273 0.21
274 0.25
275 0.26
276 0.28
277 0.24
278 0.27
279 0.3
280 0.31
281 0.33
282 0.34
283 0.38
284 0.43
285 0.5
286 0.57
287 0.58
288 0.64
289 0.63
290 0.64
291 0.62
292 0.58
293 0.51
294 0.41
295 0.41
296 0.38
297 0.35
298 0.31
299 0.28
300 0.3
301 0.33
302 0.32
303 0.29
304 0.27
305 0.31
306 0.33
307 0.35
308 0.31
309 0.29
310 0.3
311 0.31
312 0.29
313 0.32
314 0.32
315 0.3
316 0.3
317 0.32
318 0.35
319 0.36
320 0.37
321 0.38
322 0.42
323 0.48
324 0.51
325 0.55
326 0.54
327 0.54
328 0.54
329 0.51
330 0.48
331 0.46
332 0.43
333 0.36
334 0.33
335 0.34
336 0.34
337 0.31
338 0.28
339 0.31
340 0.29
341 0.33
342 0.37
343 0.43
344 0.43
345 0.43
346 0.46
347 0.42
348 0.46
349 0.47
350 0.43
351 0.4
352 0.41
353 0.43
354 0.4
355 0.38
356 0.33
357 0.32
358 0.33
359 0.33
360 0.33
361 0.31
362 0.34
363 0.32
364 0.33
365 0.31
366 0.34
367 0.34
368 0.32
369 0.33
370 0.3
371 0.32
372 0.33
373 0.36
374 0.32
375 0.31
376 0.31
377 0.32
378 0.34
379 0.35
380 0.34
381 0.31
382 0.36
383 0.39
384 0.43
385 0.46
386 0.5
387 0.52
388 0.57
389 0.6
390 0.57
391 0.61
392 0.58
393 0.52
394 0.54
395 0.56
396 0.52
397 0.5
398 0.53
399 0.46
400 0.45
401 0.48
402 0.4
403 0.37
404 0.35
405 0.38
406 0.39
407 0.39
408 0.4
409 0.37
410 0.37
411 0.39
412 0.42
413 0.38
414 0.34
415 0.36
416 0.37
417 0.36
418 0.38
419 0.32
420 0.28
421 0.34
422 0.38
423 0.39
424 0.47
425 0.56
426 0.58
427 0.69
428 0.79
429 0.8
430 0.83
431 0.87
432 0.88
433 0.88
434 0.9
435 0.89
436 0.9
437 0.91
438 0.9
439 0.86
440 0.83
441 0.82
442 0.84
443 0.85
444 0.82
445 0.8
446 0.77
447 0.75
448 0.7
449 0.69
450 0.66
451 0.63
452 0.6
453 0.58
454 0.54
455 0.52
456 0.54
457 0.52
458 0.47
459 0.42
460 0.43
461 0.44
462 0.45
463 0.45
464 0.41
465 0.37